Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471969
• Subject: NM_001310456.1
• Aligned Length: 1500
• Identities: 1247
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ----------ATGGATCGGATGAAGAAGATCAAACGGCAGCTGTCAATGACACTCCGAGGTGGCCGAGGCATAG  64
                      ||||||..|||||||||                                           |||.
Sbjct    1  ATGTACACAAATGGATACGATGAAGAA-------------------------------------------ATAT  31

Query   65  ACAAGACCAATGGTGCCCCTGAGCAGATAGGCCTGGATGAGAGTGGTGGTGGTGGCGGCAGTGACCCTGGAGAG  138
            |..|   .|.|||.|                   |.|.|||||||.|                   ||.||   
Sbjct   32  ATTA---TATTGGGG-------------------GAAAGAGAGTGTT-------------------CTTGA---  61

Query  139  GCCCCCACACGTGCTGCTCCTGGGGAAC--TTCGTTCTGCACGGGGCCCACTCAGCTCTGCACCAGAGATTGTG  210
              |.|||.|.|       |||||    |  |||..|||       .||||          |.||||||||||||
Sbjct   62  --CTCCAAAGG-------CCTGG----CCTTTCCCTCT-------CCCCA----------CCCCAGAGATTGTG  105

Query  211  CACGAGGACTTGAAGATGGGGTCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACGTCCTCGGATGAGGTGCAGTC  284
            |||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  106  CACGAGGACATGAAGATGGGATCTGATGGGGAGAGTGACCAGGCTTCAGCCACATCCTCAGATGAGGTGCAGTC  179

Query  285  TCCAGTGAGAGTGCGTATGCGCAACCATCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAGCGCCTATCAC  358
            |||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  180  TCCAGTGAGAGTGCGCATGCGCAACCACCCCCCACGCAAGATCTCCACTGAGGACATCAACAAACGCCTGTCAC  253

Query  359  TACCAGCTGACATCCGGCTGCCTGAGGGCTACCTGGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGACAAGCCC  432
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  254  TACCAGCTGACATACGGCTGCCTGAGGGCTACCTTGAGAAGCTGACCCTCAATAGCCCCATCTTTGATAAGCCT  327

Query  433  CTCAGCCGCCGCCTCCGTCGTGTCAGCCTATCTGAGATTGGCTTTGGGAAACTGGAGACCTACATTAAGCTGGA  506
            ||.|||||.||||||||.||.|||||..|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  328  CTTAGCCGGCGCCTCCGCCGAGTCAGTTTGTCTGAGATTGGCTTTGGAAAACTGGAGACCTACATCAAGCTAGA  401

Query  507  CAAACTGGGCGAGGGTACCTATGCCACCGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTGGCACTCA  580
            |||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  402  CAAGCTGGGTGAGGGTACCTATGCCACTGTCTACAAAGGCAAAAGCAAGCTCACAGACAACCTTGTAGCACTTA  475

Query  581  AGGAGATCAGACTGGAACATGAAGAGGGGGCACCCTGCACCGCCATCCGGGAAGTGTCCCTGCTCAAGGACCTC  654
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  476  AGGAGATCAGACTGGAACACGAAGAAGGGGCACCCTGTACTGCTATCCGGGAAGTATCCCTGCTTAAGGACCTC  549

Query  655  AAACACGCCAACATCGTTACGCTACATGACATTATCCACACGGAGAAGTCCCTCACCCTTGTCTTTGAGTACCT  728
            ||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|
Sbjct  550  AAGCATGCCAACATCGTCACACTACATGACATTATCCACACAGAGAAGTCCCTCACACTTGTCTTTGAATACTT  623

Query  729  GGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGGAACATCATCAACATGCACAACGTGAAACTGTTCCTGT  802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  624  GGACAAGGACCTGAAGCAGTACCTGGATGACTGTGGAAATGTCATCAACATGCACAATGTGAAACTGTTCCTGT  697

Query  803  TCCAGCTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACCGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTG  876
            |||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  698  TCCAGTTGCTCCGTGGCCTGGCCTACTGCCACAGGCAGAAGGTGCTACACCGAGACCTCAAGCCCCAGAACCTA  771

Query  877  CTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAGCTGGCTGACTTTGGCCTGGCCCGAGCCAAGTCAATCCCAACAAAGAC  950
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||
Sbjct  772  CTCATCAACGAGAGGGGAGAGCTCAAACTGGCAGATTTTGGCCTGGCTCGTGCCAAGTCAATTCCTACTAAAAC  845

Query  951  ATACTCCAATGAGGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTGCTTGGGTCCACGGACTACTCCACTC  1024
            |||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct  846  ATACTCCAACGAAGTGGTGACACTGTGGTACCGGCCCCCTGACATCCTACTTGGGTCCACAGACTACTCTACCC  919

Query 1025  AGATTGACATGTGGGGTGTGGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACAGGCCGTCCCCTCTTTCCGGGCTCCACG  1098
            |.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.
Sbjct  920  AAATTGACATGTGGGGTGTAGGCTGCATCTTCTATGAGATGGCCACCGGCCGGCCCCTCTTCCCAGGCTCCACA  993

Query 1099  GTGGAGGAACAGCTACACTTCATCTTCCGTATCTTAGGAACCCCAACTGAGGAGACGTGGCCAGGCATCCTGTC  1172
            |||||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  994  GTGGAAGAACAGCTGCACTTCATCTTCCGCATTTTGGGAACCCCAACTGAGGAGACATGGCCAGGTATCCTGTC  1067

Query 1173  CAACGAGGAGTTCAAGACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTTTGAGCCACGCACCCCGACTTG  1246
            |||.||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct 1068  CAATGAGGAGTTTAGAACATACAACTACCCCAAGTACCGAGCCGAGGCCCTTCTGAGCCATGCACCCCGACTTG  1141

Query 1247  ATAGCGACGGGGCCGACCTCCTCACCAAGCTGTTGCAGTTTGAGGGTCGAAATCGGATCTCCGCAGAGGATGCC  1320
            |||||||.||.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1142  ATAGCGATGGAGCTGACCTCCTCACCAAGCTGCTGCAGTTTGAGGGTCGCAATCGGATCTCTGCTGAGGATGCC  1215

Query 1321  ATGAAACATCCATTCTTCCTCAGTCTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACT  1394
            |.|||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1216  AGGAAACATCCATTCTTTCTCAGCTTGGGGGAGCGGATCCACAAACTTCCTGACACTACTTCCATATTTGCACT  1289

Query 1395  AAAGGAGATTCAGCTACAAAAGGAGGCCAGCCTTCGGTCTTCGTCGATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCC  1468
            |||||||.|.|||||||||||||||||||.|.|||||||..|.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1290  AAAGGAGGTACAGCTACAAAAGGAGGCCAACATTCGGTCCACTTCTATGCCTGACTCAGGCAGGCCAGCTTTCC  1363

Query 1469  GCGTGGTGGACACCGAGTTC  1488
            |.||||||||.|||||||||
Sbjct 1364  GTGTGGTGGATACCGAGTTC  1383