Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471971
• Subject: NM_001163989.1
• Aligned Length: 698
• Identities: 640
• Gaps: 43

Alignment

Query   1  ---------AT----GACGGGCACG----CCAGGCGCCGTTGC-CACCCGGGATGGCGAGGCCCCCGAGCGCTC  56
                    ||    ||.|.|||||    |.||.||..||||| ||   |||| |||  .||||.|   |.||.
Sbjct   1  ATGTGGCTCATGTCCGAAGCGCACGGAGCCGAGCCGGTGTTGCTCA---GGGA-GGC--TGCCCGC---CCCTT  65

Query  57  CCCG----CCCTGCAG---TCCGAGCTACGACCTCACGG----GCAAGGTGATGCTTCTGGGAGACACAGGCGT  119
           |.||    ||||||.|   |.||.||     |||||.||    |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  66  CACGCAGACCCTGCGGCTCTGCGTGC-----CCTCAGGGAACAGCAAGGTGATGCTTCTGGGAGACACAGGCGT  134

Query 120  CGGCAAAACATGTTTCCTGATCCAATTCAAAGACGGGGCCTTCCTGTCCGGAACCTTCATAGCCACCGTCGGCA  193
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 135  CGGCAAAACATGTTTCCTGATCCAATTCAAAGACGGGGCCTTCCTGTCCGGAACCTTCATAGCCACCGTCGGCA  208

Query 194  TAGACTTCAGGAACAAGGTGGTGACTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAGATCTGGGACACCGCTGGGCAG  267
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 209  TAGACTTCAGGAACAAGGTGGTGACTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAGATCTGGGACACCGCTGGGCAG  282

Query 268  GAACGGTTCCGAAGCGTCACCCATGCTTATTACAGAGATGCTCAGGCCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAA  341
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 283  GAACGGTTCCGAAGCGTCACCCATGCTTATTACAGAGATGCTCAGGCCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAA  356

Query 342  CAAATCTTCTTTCGACAACATCAGGGCCTGGCTCACTGAGATTCATGAGTATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCA  415
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 357  CAAATCTTCTTTCGACAACATCAGGGCCTGGCTCACTGAGATTCATGAGTATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCA  430

Query 416  TGCTGCTAGGCAACAAGGCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCTTGGCCAGG  489
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 431  TGCTGCTAGGCAACAAGGCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCTTGGCCAGG  504

Query 490  GAGTACGGTGTTCCCTTCCTGGAGACCAGCGCCAAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGC  563
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 505  GAGTACGGTGTTCCCTTCCTGGAGACCAGCGCCAAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGC  578

Query 564  CAAGGAACTGAAATACCGGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCCAGATCCGAGACTATGTAGAGTCCC  637
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 579  CAAGGAACTGAAATACCGGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCCAGATCCGAGACTATGTAGAGTCCC  652

Query 638  AGAAGAAGCGCTCCAGCTGCTGCTCCTTCATG  669
           ||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 653  AGAAGAAGCGCTCCAGCTGCTGCTCCTTCATG  684