Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000471971
• Subject: NM_175738.5
• Aligned Length: 681
• Identities: 588
• Gaps: 45

Alignment

Query   1  AT-GACGGGCACGCCAGGCGCCG-TTGCCACCCGGGATGGCGAGGCCCCCGAGCGCT-------CCCCGCCCTG  65
           || |||..|||   .||.| ||| ||.|.|||.|||| ||.|..|.|||.||   ||       ||.||.||||
Sbjct   1  ATGGACCTGCA---GAGAC-CCGATTCCTACCAGGGA-GGAGCTGGCCCTGA---CTTCAACGACCACGTCCTG  66

Query  66  CAGTCCGAGCTACGACCTCACGGGCAAGGTGATGCTTCTGGGAGACACAGGCGTCGGCAAAACATGTTTCCTGA  139
           ||        ||.||||              ||.||..||||.||||..||.||.||.||.||.|.|.|.|||.
Sbjct  67  CA--------TAAGACC--------------ATCCTGGTGGGTGACAGTGGTGTGGGAAAGACGTCTCTGCTGG  118

Query 140  TCCAATTCAAAGA-CGGGGC--CTTCCTGTCCGGAACCTTCATAGCCACCGTCGGCATAGACTTCAGGAACAAG  210
           |.||.|||   || |.||||  .|||.|..||||..|||||...|||||.||.|||||.|..||||.|||||||
Sbjct 119  TTCAGTTC---GATCAGGGCAAGTTCATCCCCGGCTCCTTCTCGGCCACTGTGGGCATCGGATTCACGAACAAG  189

Query 211  GTGGTGACTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAGATCTGGGACACCGCTGGGCAGGAACGGTTCCGAAGCGT  284
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 190  GTGGTGACTGTGGATGGCGTGAGAGTGAAGCTGCAGATCTGGGACACCGCTGGGCAGGAACGGTTCCGAAGCGT  263

Query 285  CACCCATGCTTATTACAGAGATGCTCAGGCCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAACAAATCTTCTTTCGACA  358
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 264  CACCCATGCTTATTACAGAGATGCTCAGGCCTTGCTTCTGCTGTATGACATCACCAACAAATCTTCTTTCGACA  337

Query 359  ACATCAGGGCCTGGCTCACTGAGATTCATGAGTATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCATGCTGCTAGGCAACAAG  432
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 338  ACATCAGGGCCTGGCTCACTGAGATTCATGAGTATGCCCAGAGGGACGTGGTGATCATGCTGCTAGGCAACAAG  411

Query 433  GCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCTTGGCCAGGGAGTACGGTGTTCCCTT  506
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 412  GCGGATATGAGCAGCGAAAGAGTGATCCGTTCCGAAGACGGAGAGACCTTGGCCAGGGAGTACGGTGTTCCCTT  485

Query 507  CCTGGAGACCAGCGCCAAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGCCAAGGAACTGAAATACC  580
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 486  CCTGGAGACCAGCGCCAAGACTGGCATGAATGTGGAGTTAGCCTTTCTGGCCATCGCCAAGGAACTGAAATACC  559

Query 581  GGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCCAGATCCGAGACTATGTAGAGTCCCAGAAGAAGCGCTCCAGC  654
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 560  GGGCCGGGCATCAGGCGGATGAGCCCAGCTTCCAGATCCGAGACTATGTAGAGTCCCAGAAGAAGCGCTCCAGC  633

Query 655  TGCTGCTCCTTCATG  669
           |||||||||||||||
Sbjct 634  TGCTGCTCCTTCATG  648