Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472001
• Subject: XM_006713529.4
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1263
• Gaps: 90

Alignment

Query    1  ATGTTGAGATTCTACTTATTCATCAGTTTGTTGTGCTTGTCAAGATCAGACGCAGAAGAAACATGTCCTTCATT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGAGATTCTACTTATTCATCAGTTTGTTGTGCTTGTCAAGATCAGACGCAGAAGAAACATGTCCTTCATT  74

Query   75  CACCAGGCTGAGCTTTCACAGTGCAGTGGTTGGTACGGGACTAAATGTGAGGCTGATGCTCTACACAAGGAAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCAGGCTGAGCTTTCACAGTGCAGTGGTTGGTACGGGACTAAATGTGAGGCTGATGCTCTACACAAGGAAAA  148

Query  149  ACCTGACCTGCGCACAAACCATCAACTCCTCAGCTTTTGGGAACTTGAATGTGACCAAGAAAACCACCTTCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTGACCTGCGCACAAACCATCAACTCCTCAGCTTTTGGGAACTTGAATGTGACCAAGAAAACCACCTTCATT  222

Query  223  GTCCATGGATTCAGGCCAACAGGCTCCCCTCCTGTTTGGATGGATGACTTAGTAAAGGGTTTGCTCTCTGTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCATGGATTCAGGCCAACAGGCTCCCCTCCTGTTTGGATGGATGACTTAGTAAAGGGTTTGCTCTCTGTTGA  296

Query  297  AGACATGAACGTAGTTGTTGTTGATTGGAATCGAGGAGCTACAACTTTAATATATACCCATGCCTCTAGTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACATGAACGTAGTTGTTGTTGATTGGAATCGAGGAGCTACAACTTTAATATATACCCATGCCTCTAGTAAGA  370

Query  371  CCAGAAAAGTAGCCATGGTCTTGAAGGAATTTATTGACCAGATGTTGGCAGAAGGAGCTTCTCTTGATGACATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGAAAAGTAGCCATGGTCTTGAAGGAATTTATTGACCAGATGTTGGCAGAAGGAGCTTCTCTTGATGACATT  444

Query  445  TACATGATCGGAGTAAGTCTAGGAGCCCACATATCTGGGTTTGTTGGAGAGATGTACGATGGATGGCTGGGGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACATGATCGGAGTAAGTCTAGGAGCCCACATATCTGGGTTTGTTGGAGAGATGTACGATGGATGGCTGGGGAG  518

Query  519  AATTACAGGCCTCGACCCTGCAGGCCCTTTATTCAACGGGAAACCTCACCAAGACAGATTAGATCCCAGTGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AATTACAGGCCTCGACCCTGCAGGCCCTTTATTCAACGGGAAACCTCACCAAGACAGATTAGATCCCAGTGATG  592

Query  593  CGCAGTTTGTTGATGTCATCCATTCCGACACTGATGCACTGGGCTACAAGGAGCCATTAGGAAACATAGACTTC  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct  593  CGCAGTTTGTTGATGTCATCCATTCCGACACTGAT---------------------------------------  627

Query  667  TACCCAAATGGAGGATTGGATCAACCTGGCTGCCCCAAAACAATATTGGGAGGATTTCAGTATTTTAAATGTGA  740
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  ---------------------------------------------------GGATTTCAGTATTTTAAATGTGA  650

Query  741  CCACCAGAGGTCTGTATACCTGTACCTGTCTTCCCTGAGAGAGAGCTGCACCATCACTGCGTATCCCTGTGACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CCACCAGAGGTCTGTATACCTGTACCTGTCTTCCCTGAGAGAGAGCTGCACCATCACTGCGTATCCCTGTGACT  724

Query  815  CCTACCAGGATTATAGGAATGGCAAGTGTGTCAGCTGCGGCACGTCACAAAAAGAGTCCTGTCCCCTTCTGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  725  CCTACCAGGATTATAGGAATGGCAAGTGTGTCAGCTGCGGCACGTCACAAAAAGAGTCCTGTCCCCTTCTGGGC  798

Query  889  TATTATGCTGATAATTGGAAAGACCATCTAAGGGGGAAAGATCCTCCAATGACGAAGGCATTCTTTGACACAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  799  TATTATGCTGATAATTGGAAAGACCATCTAAGGGGGAAAGATCCTCCAATGACGAAGGCATTCTTTGACACAGC  872

Query  963  TGAGGAGAGCCCATTCTGCATGTATCATTACTTTGTGGATATTATAACATGGAACAAGAATGTAAGAAGAGGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  873  TGAGGAGAGCCCATTCTGCATGTATCATTACTTTGTGGATATTATAACATGGAACAAGAATGTAAGAAGAGGGG  946

Query 1037  ACATTACCATCAAATTGAGAGACAAAGCTGGAAACACCACAGAATCCAAAATCAATCATGAACCCACCACATTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  947  ACATTACCATCAAATTGAGAGACAAAGCTGGAAACACCACAGAATCCAAAATCAATCATGAACCCACCACATTT  1020

Query 1111  CAGAAATATCACCAAGTGAGTCTACTTGCAAGATTTAATCAAGATCTGGATAAAGTGGCTGCAATTTCCTTGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1021  CAGAAATATCACCAAGTGAGTCTACTTGCAAGATTTAATCAAGATCTGGATAAAGTGGCTGCAATTTCCTTGAT  1094

Query 1185  GTTCTCTACAGGATCTCTAATAGGCCCAAGGTACAAGCTCAGGATTCTCCGAATGAAGTTAAGGTCCCTTGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095  GTTCTCTACAGGATCTCTAATAGGCCCAAGGTACAAGCTCAGGATTCTCCGAATGAAGTTAAGGTCCCTTGCCC  1168

Query 1259  ATCCGGAGAGGCCTCAGCTGTGTCGGTATGATCTTGTCCTGATGGAAAACGTTGAAACAGTCTTCCAACCTATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1169  ATCCGGAGAGGCCTCAGCTGTGTCGGTATGATCTTGTCCTGATGGAAAACGTTGAAACAGTCTTCCAACCTATT  1242

Query 1333  CTTTGCCCAGAGTTGCAGTTG  1353
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1243  CTTTGCCCAGAGTTGCAGTTG  1263