Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472001
• Subject: XM_011512531.3
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1224
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGTTGAGATTCTACTTATTCATCAGTTTGTTGTGCTTGTCAAGATCAGACGCAGAAGAAACATGTCCTTCATT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CACCAGGCTGAGCTTTCACAGTGCAGTGGTTGGTACGGGACTAAATGTGAGGCTGATGCTCTACACAAGGAAAA  148
                                                                   |||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------------------ATGCTCTACACAAGGAAAA  19

Query  149  ACCTGACCTGCGCACAAACCATCAACTCCTCAGCTTTTGGGAACTTGAATGTGACCAAGAAAACCACCTTCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   20  ACCTGACCTGCGCACAAACCATCAACTCCTCAGCTTTTGGGAACTTGAATGTGACCAAGAAAACCACCTTCATT  93

Query  223  GTCCATGGATTCAGGCCAACAGGCTCCCCTCCTGTTTGGATGGATGACTTAGTAAAGGGTTTGCTCTCTGTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   94  GTCCATGGATTCAGGCCAACAGGCTCCCCTCCTGTTTGGATGGATGACTTAGTAAAGGGTTTGCTCTCTGTTGA  167

Query  297  AGACATGAACGTAGTTGTTGTTGATTGGAATCGAGGAGCTACAACTTTAATATATACCCATGCCTCTAGTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  168  AGACATGAACGTAGTTGTTGTTGATTGGAATCGAGGAGCTACAACTTTAATATATACCCATGCCTCTAGTAAGA  241

Query  371  CCAGAAAAGTAGCCATGGTCTTGAAGGAATTTATTGACCAGATGTTGGCAGAAGGAGCTTCTCTTGATGACATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  242  CCAGAAAAGTAGCCATGGTCTTGAAGGAATTTATTGACCAGATGTTGGCAGAAGGAGCTTCTCTTGATGACATT  315

Query  445  TACATGATCGGAGTAAGTCTAGGAGCCCACATATCTGGGTTTGTTGGAGAGATGTACGATGGATGGCTGGGGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  316  TACATGATCGGAGTAAGTCTAGGAGCCCACATATCTGGGTTTGTTGGAGAGATGTACGATGGATGGCTGGGGAG  389

Query  519  AATTACAGGCCTCGACCCTGCAGGCCCTTTATTCAACGGGAAACCTCACCAAGACAGATTAGATCCCAGTGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  390  AATTACAGGCCTCGACCCTGCAGGCCCTTTATTCAACGGGAAACCTCACCAAGACAGATTAGATCCCAGTGATG  463

Query  593  CGCAGTTTGTTGATGTCATCCATTCCGACACTGATGCACTGGGCTACAAGGAGCCATTAGGAAACATAGACTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  464  CGCAGTTTGTTGATGTCATCCATTCCGACACTGATGCACTGGGCTACAAGGAGCCATTAGGAAACATAGACTTC  537

Query  667  TACCCAAATGGAGGATTGGATCAACCTGGCTGCCCCAAAACAATATTGGGAGGATTTCAGTATTTTAAATGTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  538  TACCCAAATGGAGGATTGGATCAACCTGGCTGCCCCAAAACAATATTGGGAGGATTTCAGTATTTTAAATGTGA  611

Query  741  CCACCAGAGGTCTGTATACCTGTACCTGTCTTCCCTGAGAGAGAGCTGCACCATCACTGCGTATCCCTGTGACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  612  CCACCAGAGGTCTGTATACCTGTACCTGTCTTCCCTGAGAGAGAGCTGCACCATCACTGCGTATCCCTGTGACT  685

Query  815  CCTACCAGGATTATAGGAATGGCAAGTGTGTCAGCTGCGGCACGTCACAAAAAGAGTCCTGTCCCCTTCTGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  686  CCTACCAGGATTATAGGAATGGCAAGTGTGTCAGCTGCGGCACGTCACAAAAAGAGTCCTGTCCCCTTCTGGGC  759

Query  889  TATTATGCTGATAATTGGAAAGACCATCTAAGGGGGAAAGATCCTCCAATGACGAAGGCATTCTTTGACACAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  760  TATTATGCTGATAATTGGAAAGACCATCTAAGGGGGAAAGATCCTCCAATGACGAAGGCATTCTTTGACACAGC  833

Query  963  TGAGGAGAGCCCATTCTGCATGTATCATTACTTTGTGGATATTATAACATGGAACAAGAATGTAAGAAGAGGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  834  TGAGGAGAGCCCATTCTGCATGTATCATTACTTTGTGGATATTATAACATGGAACAAGAATGTAAGAAGAGGGG  907

Query 1037  ACATTACCATCAAATTGAGAGACAAAGCTGGAAACACCACAGAATCCAAAATCAATCATGAACCCACCACATTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  908  ACATTACCATCAAATTGAGAGACAAAGCTGGAAACACCACAGAATCCAAAATCAATCATGAACCCACCACATTT  981

Query 1111  CAGAAATATCACCAAGTGAGTCTACTTGCAAGATTTAATCAAGATCTGGATAAAGTGGCTGCAATTTCCTTGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  982  CAGAAATATCACCAAGTGAGTCTACTTGCAAGATTTAATCAAGATCTGGATAAAGTGGCTGCAATTTCCTTGAT  1055

Query 1185  GTTCTCTACAGGATCTCTAATAGGCCCAAGGTACAAGCTCAGGATTCTCCGAATGAAGTTAAGGTCCCTTGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056  GTTCTCTACAGGATCTCTAATAGGCCCAAGGTACAAGCTCAGGATTCTCCGAATGAAGTTAAGGTCCCTTGCCC  1129

Query 1259  ATCCGGAGAGGCCTCAGCTGTGTCGGTATGATCTTGTCCTGATGGAAAACGTTGAAACAGTCTTCCAACCTATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130  ATCCGGAGAGGCCTCAGCTGTGTCGGTATGATCTTGTCCTGATGGAAAACGTTGAAACAGTCTTCCAACCTATT  1203

Query 1333  CTTTGCCCAGAGTTGCAGTTG  1353
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1204  CTTTGCCCAGAGTTGCAGTTG  1224