Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472001
• Subject: XM_017005852.2
• Aligned Length: 1353
• Identities: 1251
• Gaps: 102

Alignment

Query    1  ATGTTGAGATTCTACTTATTCATCAGTTTGTTGTGCTTGTCAAGATCAGACGCAGAAGAAACATGTCCTTCATT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTTGAGATTCTACTTATTCATCAGTTTGTTGTGCTTGTCAAGATCAGACGCAGAAGAAACATGTCCTTCATT  74

Query   75  CACCAGGCTGAGCTTTCACAGTGCAGTGGTTGGTACGGGACTAAATGTGAGGCTGATGCTCTACACAAGGAAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CACCAGGCTGAGCTTTCACAGTGCAGTGGTTGGTACGGGACTAAATGTGAGGCTGATGCTCTACACAAGGAAAA  148

Query  149  ACCTGACCTGCGCACAAACCATCAACTCCTCAGCTTTTGGGAACTTGAATGTGACCAAGAAAACCACCTTCATT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACCTGACCTGCGCACAAACCATCAACTCCTCAGCTTTTGGGAACTTGAATGTGACCAAGAAAACCACCTTCATT  222

Query  223  GTCCATGGATTCAGGCCAACAGGCTCCCCTCCTGTTTGGATGGATGACTTAGTAAAGGGTTTGCTCTCTGTTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTCCATGGATTCAGGCCAACAGGCTCCCCTCCTGTTTGGATGGATGACTTAGTAAAGGGTTTGCTCTCTGTTGA  296

Query  297  AGACATGAACGTAGTTGTTGTTGATTGGAATCGAGGAGCTACAACTTTAATATATACCCATGCCTCTAGTAAGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGACATGAACGTAGTTGTTGTTGATTGGAATCGAGGAGCTACAACTTTAATATATACCCATGCCTCTAGTAAGA  370

Query  371  CCAGAAAAGTAGCCATGGTCTTGAAGGAATTTATTGACCAGATGTTGGCAGAAGGAGCTTCTCTTGATGACATT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGAAAAGTAGCCATGGTCTTGAAGGAATTTATTGACCAGATGTTGGCAGAAGGAGCTTCTCTTGATGACATT  444

Query  445  TACATGATCGGAGTAAGTCTAGGAGCCCACATATCTGGGTTTGTTGGAGAGATGTACGATGGATGGCTGGGGAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACATGATCGGAGTAAGTCTAGGAGCCCACATATCTGGGTTTGTTGGAGAGATGTACGATGGATGGCTGGGGAG  518

Query  519  AATTACAGGCCTCGACCCTGCAGGCCCTTTATTCAACGGGAAACCTCACCAAGACAGATTAGATCCCAGTGATG  592
            |||||||                                                                   
Sbjct  519  AATTACA-------------------------------------------------------------------  525

Query  593  CGCAGTTTGTTGATGTCATCCATTCCGACACTGATGCACTGGGCTACAAGGAGCCATTAGGAAACATAGACTTC  666
                                               |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  526  -----------------------------------GCACTGGGCTACAAGGAGCCATTAGGAAACATAGACTTC  564

Query  667  TACCCAAATGGAGGATTGGATCAACCTGGCTGCCCCAAAACAATATTGGGAGGATTTCAGTATTTTAAATGTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  TACCCAAATGGAGGATTGGATCAACCTGGCTGCCCCAAAACAATATTGGGAGGATTTCAGTATTTTAAATGTGA  638

Query  741  CCACCAGAGGTCTGTATACCTGTACCTGTCTTCCCTGAGAGAGAGCTGCACCATCACTGCGTATCCCTGTGACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  CCACCAGAGGTCTGTATACCTGTACCTGTCTTCCCTGAGAGAGAGCTGCACCATCACTGCGTATCCCTGTGACT  712

Query  815  CCTACCAGGATTATAGGAATGGCAAGTGTGTCAGCTGCGGCACGTCACAAAAAGAGTCCTGTCCCCTTCTGGGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  CCTACCAGGATTATAGGAATGGCAAGTGTGTCAGCTGCGGCACGTCACAAAAAGAGTCCTGTCCCCTTCTGGGC  786

Query  889  TATTATGCTGATAATTGGAAAGACCATCTAAGGGGGAAAGATCCTCCAATGACGAAGGCATTCTTTGACACAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  TATTATGCTGATAATTGGAAAGACCATCTAAGGGGGAAAGATCCTCCAATGACGAAGGCATTCTTTGACACAGC  860

Query  963  TGAGGAGAGCCCATTCTGCATGTATCATTACTTTGTGGATATTATAACATGGAACAAGAATGTAAGAAGAGGGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  TGAGGAGAGCCCATTCTGCATGTATCATTACTTTGTGGATATTATAACATGGAACAAGAATGTAAGAAGAGGGG  934

Query 1037  ACATTACCATCAAATTGAGAGACAAAGCTGGAAACACCACAGAATCCAAAATCAATCATGAACCCACCACATTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  ACATTACCATCAAATTGAGAGACAAAGCTGGAAACACCACAGAATCCAAAATCAATCATGAACCCACCACATTT  1008

Query 1111  CAGAAATATCACCAAGTGAGTCTACTTGCAAGATTTAATCAAGATCTGGATAAAGTGGCTGCAATTTCCTTGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  CAGAAATATCACCAAGTGAGTCTACTTGCAAGATTTAATCAAGATCTGGATAAAGTGGCTGCAATTTCCTTGAT  1082

Query 1185  GTTCTCTACAGGATCTCTAATAGGCCCAAGGTACAAGCTCAGGATTCTCCGAATGAAGTTAAGGTCCCTTGCCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  GTTCTCTACAGGATCTCTAATAGGCCCAAGGTACAAGCTCAGGATTCTCCGAATGAAGTTAAGGTCCCTTGCCC  1156

Query 1259  ATCCGGAGAGGCCTCAGCTGTGTCGGTATGATCTTGTCCTGATGGAAAACGTTGAAACAGTCTTCCAACCTATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  ATCCGGAGAGGCCTCAGCTGTGTCGGTATGATCTTGTCCTGATGGAAAACGTTGAAACAGTCTTCCAACCTATT  1230

Query 1333  CTTTGCCCAGAGTTGCAGTTG  1353
            |||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  CTTTGCCCAGAGTTGCAGTTG  1251