Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472009
• Subject: NM_001136067.2
• Aligned Length: 1312
• Identities: 1052
• Gaps: 77

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------ATGAATAGGCACCTCTGGAA  20
                                                                  |||||.|.|||||.||||||
Sbjct    1  ATGTATATCAGGTACTGCTGTGATGATCAGGACACACAGACACTGTCCTGTTGGATGAACAAGCACCCCTGGAA  74

Query   21  GAGCCAACTGTGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCGGCAGCAGATCAGGACGTACTGGGCGAAGAGTCTC  94
            ||.|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.||||||.|.|||||.|||||.|||.
Sbjct   75  GAACCAGCTGAGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCAGCAGAGGACCAGGACATGCTGGGTGAAGAATCTT  148

Query   95  CTCTGGGGAAGCCAGCCATGCTGCACCTGCCTTCAGAACAGGGCGCTCCTGAGACCCTCCAGCGCTGCCTGGAG  168
            |||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  CTCTGGGGAAGCCTGCAATGCTACATCTGCCTTCAGAGCAGGGTACTCCTGAGACCCTCCAGCGCTGCCTGGAA  222

Query  169  GAGAATCAAGAGCTCCGAGATGCCATCCGGCAGAGCAACCAGATTCTGCGGGAGCGCTGCGAGGAGCTTCTGCA  242
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  223  GAGAATCAAGAGCTCCGAGACGCTATCCGGCAGAGCAATCAGATGCTGAGGGAACGCTGTGAGGAGCTGCTGCA  296

Query  243  TTTCCAAGCCAGCCAGAGGGAGGAGAAGGAGTTCCTCATGTGCAAGTTCCAGGAGGCCAGGAAACTGGTGGAGA  316
            ||||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.||||.||||||||||
Sbjct  297  TTTCCAGGTCAGCCAGCGGGAGGAGAAGGAGTTCCTTATGTGCAAATTCCAGGAAGCCCGGAAGCTGGTGGAGA  370

Query  317  GACTCGGCCTGGAGAAGCTCGATCTGAAGAGGCAGAAGGAGCAGGCTCTGCGGGAGGTGGAGCACCTGAAGAGA  390
            ||||..||.||||||||||.|||||...|||.||||.|||.|||||..|...||||.|||||||.|||||||.|
Sbjct  371  GACTGAGCTTGGAGAAGCTTGATCTTCGGAGTCAGAGGGAACAGGCCTTAAAGGAGTTGGAGCAACTGAAGAAA  444

Query  391  TGCCAGCAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCCCAGGTGACGTCCTTGCTCGGGGAGCTGCAGGA  464
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct  445  TGCCAACAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCTCAGGTGACATCATTGCTCGGAGAACTCCAGGA  518

Query  465  GAGCCAGAGTCGCTTGGAGGCTGCCACTAAGGAATGCCAGGCTCTGGAGGGTCGGGCCCGGGCGGCCAGCGAGC  538
            |||||||||.||.||||||||||||||.|||||..|.||.|||.|.|||||..||...||.||.|..||.||||
Sbjct  519  GAGCCAGAGCCGTTTGGAGGCTGCCACCAAGGATCGGCAAGCTTTAGAGGGAAGGATTCGAGCAGTTAGTGAGC  592

Query  539  AGGCGCGGCAGCTGGAGAGTGAGCGCGAGGCGCTGCAGCAGCAGCACAGCGTGCAGGTGGACCAGCTGCGCATG  612
            |||...|.|||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  593  AGGTCAGACAGCTGGAGAGTGAGCGGGAGGTGCTACAGCAGCAGCACAGCGTCCAGGTGGACCAGCTGCGTATG  666

Query  613  CAGGGCCAGAGCGTGGAGGCCGCGCTCCGCATGGAGCGCCAGGCCGCCTCGGAGGAGAAGAGGAAGCTGGCCCA  686
            |||..|||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct  667  CAGAACCAGAGCGTGGAGGCTGCCTTGCGAATGGAGCGGCAGGCTGCTTCAGAGGAGAAGCGGAAGCTGGCTCA  740

Query  687  GTTGCAGGTGGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGAATACGACAACCACATCAAGAGCAGCGTGGTGGGCAGTGAGC  760
            ||||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||||||                
Sbjct  741  GTTGCAGGCAGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGACTACGACAGCCACATTAAGAGCAGC----------------  798

Query  761  GGAAGCGAGGAATGCAGCTGGAAGATCTCAAACAGCAGCTCCAGCAGGCCGAGGAGGCCCTGGTGGCCAAACAG  834
              |||   ||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  799  --AAG---GGCATGCAGCTGGAAGATCTGAGGCAACAGCTCCAGCAAGCTGAGGAGGCCCTGGTAGCCAAACAG  867

Query  835  GAGGTGATCGATAAGCTGAAGGAGGAGGCCGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAGACCGTTCCGGTGCTGAAGGC  908
            ||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||..|||||||
Sbjct  868  GAATTGATTGATAAGCTGAAAGAGGAGGCTGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAGACTGTGCCAGTCTTGAAGGC  941

Query  909  CCAGGCGGATATCTACAAGGCGGACTTCCAGGCTGAGAGGCAGGCCCGGGAGAAGCTGGCCGAGAAGAAGGAGC  982
            |||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||..||||||||||||.
Sbjct  942  CCAGGCGGATATCTACAAGGCTGACTTCCAAGCTGAGAGGCATGCCCGGGAGAAGCTGGTGGAGAAGAAGGAGT  1015

Query  983  TCCTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGAGGGAGTACAGCAAACTGAAGGCCAGCTGTCAGGAGTCGGCCAGG  1056
            ...||||||||||||||||||||||||||.|.||||.||.|||.|||||.|...||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1016  ATTTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGCGCGAGTTCAACAAGCTGAAAGTTGGCTGCCATGAGTCAGCCAGG  1089

Query 1057  ATCGAGGACATGAGGAAGCGGCATGTCGAGGTCT-CCCAGGCCCCCTTGCCCCCCGCCCCTGCCTACCTCTCCT  1129
            ||.|||||.|||||||||||||||||.|| |.|| |||||.|.||.||.|.|||.||.||.||..|||.|||||
Sbjct 1090  ATTGAGGATATGAGGAAGCGGCATGTAGA-GACTCCCCAGCCTCCTTTACTCCCTGCTCCAGCTCACCACTCCT  1162

Query 1130  CTCCCCTGGCCCTGCCCAGCCAGAGGAGGAGCCCCCCCGAGGAGCCACCTGACTTCTGCTGTCCCAAGTGCCAG  1203
            .||...|||||.||.|||.||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1163  TTCATTTGGCCTTGTCCAACCAGCGGAGGAGCCCTCCTGAAGAACCTCCTGACTTCTGTTGTCCGAAGTGCCAG  1236

Query 1204  TATCAGGCCCCTGATATGGACACCCTGCAGATACATGTCATGGAGTGCATTGAG  1257
            ||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1237  TATCAGGCTCCTGATATGGACACTCTACAGATACATGTCATGGAGTGCATAGAG  1290