Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472009
- Subject:
- NM_178590.4
- Aligned Length:
- 1258
- Identities:
- 1049
- Gaps:
- 26
Alignment
Query 1 ATGAATAGGCACCTCTGGAAGAGCCAACTGTGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCGGCAGCAGATCAGGA 74
|||||.|.|||||.||||||||.|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||..||.|||||
Sbjct 1 ATGAACAAGCACCCCTGGAAGAACCAGCTGAGTGAGATGGTGCAGCCCAGTGGTGGCCCAGCAGAGGACCAGGA 74
Query 75 CGTACTGGGCGAAGAGTCTCCTCTGGGGAAGCCAGCCATGCTGCACCTGCCTTCAGAACAGGGCGCTCCTGAGA 148
|.|.|||||.|||||.|||.|||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||..|||||||||
Sbjct 75 CATGCTGGGTGAAGAATCTTCTCTGGGGAAGCCTGCAATGCTACATCTGCCTTCAGAGCAGGGTACTCCTGAGA 148
Query 149 CCCTCCAGCGCTGCCTGGAGGAGAATCAAGAGCTCCGAGATGCCATCCGGCAGAGCAACCAGATTCTGCGGGAG 222
|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.
Sbjct 149 CCCTCCAGCGCTGCCTGGAAGAGAATCAAGAGCTCCGAGACGCTATCCGGCAGAGCAATCAGATGCTGAGGGAA 222
Query 223 CGCTGCGAGGAGCTTCTGCATTTCCAAGCCAGCCAGAGGGAGGAGAAGGAGTTCCTCATGTGCAAGTTCCAGGA 296
|||||.||||||||.|||||||||||.|.|||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 223 CGCTGTGAGGAGCTGCTGCATTTCCAGGTCAGCCAGCGGGAGGAGAAGGAGTTCCTTATGTGCAAATTCCAGGA 296
Query 297 GGCCAGGAAACTGGTGGAGAGACTCGGCCTGGAGAAGCTCGATCTGAAGAGGCAGAAGGAGCAGGCTCTGCGGG 370
.|||.||||.||||||||||||||..||.||||||||||.|||||...|||.||||.|||.|||||..|...||
Sbjct 297 AGCCCGGAAGCTGGTGGAGAGACTGAGCTTGGAGAAGCTTGATCTTCGGAGTCAGAGGGAACAGGCCTTAAAGG 370
Query 371 AGGTGGAGCACCTGAAGAGATGCCAGCAGCAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCCCAGGTGACGTCC 444
||.|||||||.|||||||.|||| ||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 371 AGTTGGAGCAACTGAAGAAATGC---CAACAGATGGCTGAGGACAAGGCCTCTGTGAAAGCTCAGGTGACATCA 441
Query 445 TTGCTCGGGGAGCTGCAGGAGAGCCAGAGTCGCTTGGAGGCTGCCACTAAGGAATGCCAGGCTCTGGAGGGTCG 518
||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..|.||.|||.|.|||||..|
Sbjct 442 TTGCTCGGAGAACTCCAGGAGAGCCAGAGCCGTTTGGAGGCTGCCACCAAGGATCGGCAAGCTTTAGAGGGAAG 515
Query 519 GGCCCGGGCGGCCAGCGAGCAGGCGCGGCAGCTGGAGAGTGAGCGCGAGGCGCTGCAGCAGCAGCACAGCGTGC 592
|...||.||.|..||.|||||||...|.|||||||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 516 GATTCGAGCAGTTAGTGAGCAGGTCAGACAGCTGGAGAGTGAGCGGGAGGTGCTACAGCAGCAGCACAGCGTCC 589
Query 593 AGGTGGACCAGCTGCGCATGCAGGGCCAGAGCGTGGAGGCCGCGCTCCGCATGGAGCGCCAGGCCGCCTCGGAG 666
||||||||||||||||.||||||..|||||||||||||||.||..|.||.||||||||.|||||.||.||.|||
Sbjct 590 AGGTGGACCAGCTGCGTATGCAGAACCAGAGCGTGGAGGCTGCCTTGCGAATGGAGCGGCAGGCTGCTTCAGAG 663
Query 667 GAGAAGAGGAAGCTGGCCCAGTTGCAGGTGGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGAATACGACAACCACATCAAGAG 740
||||||.||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||.|||||
Sbjct 664 GAGAAGCGGAAGCTGGCTCAGTTGCAGGCAGCCTATCACCAGCTCTTCCAAGACTACGACAGCCACATTAAGAG 737
Query 741 CAGCGTGGTGGGCAGTGAGCGGAAGCGAGGAATGCAGCTGGAAGATCTCAAACAGCAGCTCCAGCAGGCCGAGG 814
|||| ||| ||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 738 CAGC------------------AAG---GGCATGCAGCTGGAAGATCTGAGGCAACAGCTCCAGCAAGCTGAGG 790
Query 815 AGGCCCTGGTGGCCAAACAGGAGGTGATCGATAAGCTGAAGGAGGAGGCCGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAG 888
||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 791 AGGCCCTGGTAGCCAAACAGGAATTGATTGATAAGCTGAAAGAGGAGGCTGAGCAGCACAAGATTGTGATGGAG 864
Query 889 ACCGTTCCGGTGCTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCGGACTTCCAGGCTGAGAGGCAGGCCCGGGAGAA 962
||.||.||.||..||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 865 ACTGTGCCAGTCTTGAAGGCCCAGGCGGATATCTACAAGGCTGACTTCCAAGCTGAGAGGCATGCCCGGGAGAA 938
Query 963 GCTGGCCGAGAAGAAGGAGCTCCTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGAGGGAGTACAGCAAACTGAAGGCCA 1036
|||||..||||||||||||....||||||||||||||||||||||||||.|.||||.||.|||.|||||.|...
Sbjct 939 GCTGGTGGAGAAGAAGGAGTATTTGCAGGAGCAGCTGGAGCAGCTGCAGCGCGAGTTCAACAAGCTGAAAGTTG 1012
Query 1037 GCTGTCAGGAGTCGGCCAGGATCGAGGACATGAGGAAGCGGCATGTCGAGGTCT-CCCAGGCCCCCTTGCCCCC 1109
||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|| |.|| |||||.|.||.||.|.|||
Sbjct 1013 GCTGCCATGAGTCAGCCAGGATTGAGGATATGAGGAAGCGGCATGTAGA-GACTCCCCAGCCTCCTTTACTCCC 1085
Query 1110 CGCCCCTGCCTACCTCTCCTCTCCCCTGGCCCTGCCCAGCCAGAGGAGGAGCCCCCCCGAGGAGCCACCTGACT 1183
.||.||.||..|||.|||||.||...|||||.||.|||.||||.||||||||||.||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1086 TGCTCCAGCTCACCACTCCTTTCATTTGGCCTTGTCCAACCAGCGGAGGAGCCCTCCTGAAGAACCTCCTGACT 1159
Query 1184 TCTGCTGTCCCAAGTGCCAGTATCAGGCCCCTGATATGGACACCCTGCAGATACATGTCATGGAGTGCATTGAG 1257
||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1160 TCTGTTGTCCGAAGTGCCAGTATCAGGCTCCTGATATGGACACTCTACAGATACATGTCATGGAGTGCATAGAG 1233