Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472018
• Subject: NM_175548.3
• Aligned Length: 1050
• Identities: 915
• Gaps: 63

Alignment

Query    1  ATGGTCAGGAGAGTTCAGCCGGATCGGAAACAGTTGCCACTGGTCCTACTGAGATTGCTCTGCCTTCTCAGCAC  74
            ||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||...|||
Sbjct    1  ATGGTCGGGAGAGTTCAGCCCGATCGGAAACAGTTGCCGCTGGTCCTACTGAGACTGCTCTGCCTTCTTCCCAC  74

Query   75  AGGACTGCCTGTTCGCAGCGTGGATTTTAACCGAGGCACGGACAACATCACCGTGAGGCAGGGGGACACAGCCA  148
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  AGGACTGCCCGTTCGCAGCGTGGATTTTAACCGAGGCACGGACAACATCACCGTGAGACAGGGGGACACGGCCA  148

Query  149  TCCTCAGGTGCGTTGTAGAAGACAAGAACTCAAAGGTGGCCTGGTTGAACCGTTCTGGCATCATTTTTGCTGGA  222
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  149  TCCTCAGGTGTGTGGTAGAAGACAAGAACTCAAAAGTGGCCTGGTTGAACCGCTCTGGCATCATCTTCGCTGGA  222

Query  223  CATGACAAGTGGTCTCTGGACCCACGGGTTGAGCTGGAGAAACGCCATTCTCTGGAATACAGCCTCCGAATCCA  296
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGACAAGTGGTCTCTGGACCCTCGGGTTGAGCTGGAGAAGCGCCATGCTCTGGAATACAGCCTCCGAATCCA  296

Query  297  GAAGGTGGATGTCTATGATGAGGGTTCCTACACTTGCTCAGTTCAGACACAGCATGAGCCCAAGACCTCCCAAG  370
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGGTGGATGTCTATGATGAAGGATCCTACACATGCTCAGTTCAGACACAGCATGAGCCCAAGACCTCCCAAG  370

Query  371  TTTACTTGATCGTACAAGTCCCACCAAAGATCTCCAATATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGGCAGCAAC  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TTTACTTGATCGTACAAGTTCCACCAAAGATCTCCAACATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGGCAGCAAT  444

Query  445  GTGACTCTGGTCTGCATGGCCAATGGCCGTCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACCAACT-GGAA  517
            ||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct  445  GTAACCCTGGTCTGCATGGCCAATGGGCGCCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACC-ACTAGGAA  517

Query  518  GGGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTTGGCATCACCAGGGAGCAGTCAGGCAAATATGAGTGC  591
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  518  GAGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTAGGCATCACCAGGGAACAGTCAGGCAAATATGAGTGC  591

Query  592  AAAGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCTCCCACTATCAC  665
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  592  AAGGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCACCCACTATCAC  665

Query  666  AGAATCCAAGAGCAATGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCACTCAAATGTGAGGCCTCGGCAGTGCCTGCAC  739
            .||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  666  GGAGTCGAAGAGCAACGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCCCTCAAATGTGAAGCCTCAGCGGTGCCTGCAC  739

Query  740  CTGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACTAGGATAAATAGTGCCAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACGGAGGGC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  740  CTGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACCAGGATAAACAGTGCAAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACTGAGGGC  813

Query  814  CAGTCTTCCCTGACGGTGACCAACGTCACTGAGGAGCACTACGGCAACTACACCTGTGTGGCTGCCAACAAGCT  887
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CAGTCCTCCCTGACGGTGACCAATGTCACTGAGGAACACTATGGCAACTATACCTGTGTGGCTGCCAACAAGCT  887

Query  888  GGGGGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCAGACCTGGGTCGGTGAGAGGAAT---AAA--------TGGATC  950
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||              .|.|.||   |||        ||..||
Sbjct  888  CGGTGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCAG--------------TAAGTATGCCAAAACCGAGCCTGATTC  947

Query  951  CAT--CAGTC-TGGCCGTACCACTG-----TGGCTGCTGGCAGCATCTCTGCTCTGCCTTCTCAGCAAATGT--  1014
            |||  .|||| |.| .||.|  |||     ||.||  ||..|.| |.||.||..|.||||      |||.||  
Sbjct  948  CATGCAAGTCATAG-AGTTC--CTGCATATTGACT--TGAAATC-TATCCGCCATCCCTT------AAAGGTAA  1009

Query 1015  --------------  1014
                          
Sbjct 1010  ACCCTATACAAAAA  1023