Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472018
• Subject: XM_006522201.3
• Aligned Length: 1084
• Identities: 953
• Gaps: 71

Alignment

Query    1  ATGGTCAGGAGAGTTCAGCCGGATCGGAAACAGTTGCCACTGGTCCTACTGAGATTGCTCTGCCTTCTCAGCAC  74
            ||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||...|||
Sbjct    1  ATGGTCGGGAGAGTTCAGCCCGATCGGAAACAGTTGCCGCTGGTCCTACTGAGACTGCTCTGCCTTCTTCCCAC  74

Query   75  AGGACTGCCTGTTCGCAGCGTGGATTTTAACCGAGGCACGGACAACATCACCGTGAGGCAGGGGGACACAGCCA  148
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct   75  AGGACTGCCCGTTCGCAGCGTGGATTTTAACCGAGGCACGGACAACATCACCGTGAGACAGGGGGACACGGCCA  148

Query  149  TCCTCAGGTGCGTTGTAGAAGACAAGAACTCAAAGGTGGCCTGGTTGAACCGTTCTGGCATCATTTTTGCTGGA  222
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct  149  TCCTCAGGTGTGTGGTAGAAGACAAGAACTCAAAAGTGGCCTGGTTGAACCGCTCTGGCATCATCTTCGCTGGA  222

Query  223  CATGACAAGTGGTCTCTGGACCCACGGGTTGAGCTGGAGAAACGCCATTCTCTGGAATACAGCCTCCGAATCCA  296
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGACAAGTGGTCTCTGGACCCTCGGGTTGAGCTGGAGAAGCGCCATGCTCTGGAATACAGCCTCCGAATCCA  296

Query  297  GAAGGTGGATGTCTATGATGAGGGTTCCTACACTTGCTCAGTTCAGACACAGCATGAGCCCAAGACCTCCCAAG  370
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGGTGGATGTCTATGATGAAGGATCCTACACATGCTCAGTTCAGACACAGCATGAGCCCAAGACCTCCCAAG  370

Query  371  TTTACTTGATCGTACAAGTCCCACCAAAGATCTCCAATATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGGCAGCAAC  444
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  371  TTTACTTGATCGTACAAGTTCCACCAAAGATCTCCAACATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGGCAGCAAT  444

Query  445  GTGACTCTGGTCTGCATGGCCAATGGCCGTCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACCAACT-GGAA  517
            ||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
Sbjct  445  GTAACCCTGGTCTGCATGGCCAATGGGCGCCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACC-ACTAGGAA  517

Query  518  GGGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTTGGCATCACCAGGGAGCAGTCAGGCAAATATGAGTGC  591
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  518  GAGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTAGGCATCACCAGGGAACAGTCAGGCAAATATGAGTGC  591

Query  592  AAAGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCTCCCACTATCAC  665
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  592  AAGGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCACCCACTATCAC  665

Query  666  AGAATCCAAGAGCAATGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCACTCAAATGTGAGGCCTCGGCAGTGCCTGCAC  739
            .||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct  666  GGAGTCGAAGAGCAACGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCCCTCAAATGTGAAGCCTCAGCGGTGCCTGCAC  739

Query  740  CTGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACTAGGATAAATAGTGCCAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACGGAGGGC  813
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  740  CTGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACCAGGATAAACAGTGCAAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACTGAGGGC  813

Query  814  CAGTCTTCCCTGACGGTGACCAACGTCACTGAGGAGCACTACGGCAACTACACCTGTGTGGCTGCCAACAAGCT  887
            |||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CAGTCCTCCCTGACGGTGACCAATGTCACTGAGGAACACTATGGCAACTATACCTGTGTGGCTGCCAACAAGCT  887

Query  888  GGGGGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCA------------------------------------------  919
            .||.||||||||||||||||||||||||||||                                          
Sbjct  888  CGGTGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCAAGCGTGTTTTACCCACAGTCCCCCACCCCATTCAAGAAATTG  961

Query  920  ---------------------------GACCTGGGTCGGTGAGAGGAATAAATGGATCCATCAGTCTGGCCGTA  966
                                       ||||.|||||||||||||||||.||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  962  GCACCACCGTGCACTTCAAGCCAAAAGGACCCGGGTCGGTGAGAGGAATCAACGGATCCGTCAGTCTGGCCGTA  1035

Query  967  CCACTGTGGCTGCTGGCAGCATCTCTGCTCTGCCTTCTCAGCAAATGT  1014
            ||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  CCACTGTGGCTGCTGGCAGCGTCCCTGTTCTGCCTTCTCAGCAAATGT  1083