Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472018
• Subject: XM_011512840.3
• Aligned Length: 1063
• Identities: 965
• Gaps: 80

Alignment

Query    1  ATGGTCAGGAGAGTTCAGCCGGATCGGAAACAGTTGCCACTGGTCCTACTGAGATTGCTCTGCCTTCTCAGCAC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||
Sbjct    1  ATGGTCAGGAGAGTTCAGCCGGATCGGAAACAGTTGCCACTGGTCCTACTGAGATTGCTCTGCCTTCTTCCCAC  74

Query   75  AGGACTGCCTGTTCGCAGCGTGGATTTTAACCGAGGCACGGACAACATCACCGTGAGGCAGGGGGACACAGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGGACTGCCTGTTCGCAGCGTGGATTTTAACCGAGGCACGGACAACATCACCGTGAGGCAGGGGGACACAGCCA  148

Query  149  TCCTCAGGTGCGTTGTAGAAGACAAGAACTCAAAGGTGGCCTGGTTGAACCGTTCTGGCATCATTTTTGCTGGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCCTCAGGTGCGTTGTAGAAGACAAGAACTCAAAGGTGGCCTGGTTGAACCGTTCTGGCATCATTTTTGCTGGA  222

Query  223  CATGACAAGTGGTCTCTGGACCCACGGGTTGAGCTGGAGAAACGCCATTCTCTGGAATACAGCCTCCGAATCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CATGACAAGTGGTCTCTGGACCCACGGGTTGAGCTGGAGAAACGCCATTCTCTGGAATACAGCCTCCGAATCCA  296

Query  297  GAAGGTGGATGTCTATGATGAGGGTTCCTACACTTGCTCAGTTCAGACACAGCATGAGCCCAAGACCTCCCAAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGGTGGATGTCTATGATGAGGGTTCCTACACTTGCTCAGTTCAGACACAGCATGAGCCCAAGACCTCCCAAG  370

Query  371  TTTACTTGATCGTACAAGTCCCACCAAAGATCTCCAATATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGGCAGCAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTACTTGATCGTACAAGTCCCACCAAAGATCTCCAATATCTCCTCGGATGTCACTGTGAATGAGGGCAGCAAC  444

Query  445  GTGACTCTGGTCTGCATGGCCAATGGCCGTCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACCAACTGGAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGACTCTGGTCTGCATGGCCAATGGCCGTCCTGAACCTGTTATCACCTGGAGACACCTTACACCAACTGGAAG  518

Query  519  GGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTTGGCATCACCAGGGAGCAGTCAGGCAAATATGAGTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAATTTGAAGGAGAAGAAGAATATCTGGAGATCCTTGGCATCACCAGGGAGCAGTCAGGCAAATATGAGTGCA  592

Query  593  AAGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCTCCCACTATCACA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGCTGCCAACGAGGTCTCCTCGGCGGATGTCAAACAAGTCAAGGTCACTGTGAACTATCCTCCCACTATCACA  666

Query  667  GAATCCAAGAGCAATGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCACTCAAATGTGAGGCCTCGGCAGTGCCTGCACC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAATCCAAGAGCAATGAAGCCACCACAGGACGACAAGCTTCACTCAAATGTGAGGCCTCGGCAGTGCCTGCACC  740

Query  741  TGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACTAGGATAAATAGTGCCAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACGGAGGGCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGACTTTGAGTGGTACCGGGATGACACTAGGATAAATAGTGCCAATGGCCTTGAGATTAAGAGCACGGAGGGCC  814

Query  815  AGTCTTCCCTGACGGTGACCAACGTCACTGAGGAGCACTACGGCAACTACACCTGTGTGGCTGCCAACAAGCTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTCTTCCCTGACGGTGACCAACGTCACTGAGGAGCACTACGGCAACTACACCTGTGTGGCTGCCAACAAGCTG  888

Query  889  GGGGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCAGACCTGGGTCGGTGAGAGGAATAAATGGATCCATCAGTCTGGC  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|            ||       ||..||.||   |
Sbjct  889  GGGGTCACCAATGCCAGCCTAGTCCTTTTCAAACGTGTTT------------TA-------CCCACAATC---C  940

Query  963  CGTACCAC-------------TGTGGCT-GC------------TGGCAGCATCTCTGCTCTGCC-------TTC  1003
            |..|||.|             ||||.|| ||            |||.||      |||.|  ||       |||
Sbjct  941  CCCACCCCATTCAAGTTTACTTGTGCCTAGCTCTTCTTCATAATGGAAG------TGCAC--CCAGAGACATTC  1006

Query 1004  TCAGCA------AATGT----------  1014
            ||| ||      |..||          
Sbjct 1007  TCA-CATTGAGGACCGTAGGTTCAGAA  1032