Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472034
• Subject: XM_005249993.2
• Aligned Length: 2232
• Identities: 2196
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  --------------------------AT----------GGAAGGTGGGGACCAAAGTGAGGAAGAGCCGAGGGA  38
                                      ||          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGAGAGGGATCGAGAAATGGCACATTCAGGGGACAGGAAGGTGGGGACCAAAGTGAGGAAGAGCCGAGGGA  74

Query   39  ACGCAGCCAGGCAGGTGGAATGGGAACTCTCTGGAGCCAAGAGAGCACTCCAGAAGAGAGGCTGCCCGTGGAAG  112
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACGCAGCCAGGCAGGTGGAATGGGAACTCTCTGGAGCCAAGAGAGCACTCCAGAAGAGAGGCTGCCCGTGGAAG  148

Query  113  GGAGCAGGCCATGGGCAGTGGCCAGGCGGGTGCTGACAGCTATCCTGATTTTGGGCCTGCTCCTTTGTTTTTCT  186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGAGCAGGCCATGGGCAGTGGCCAGGCGGGTGCTGACAGCTATCCTGATTTTGGGCCTGCTCCTTTGTTTTTCT  222

Query  187  GTGCTTTTGTTCTACAACTTCCAGAACTGTGGCCCTCGCCCCTGTGAGACATCTGTGTGTTTGGATCTCCGGGA  260
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCTTTTGTTCTACAACTTCCAGAACTGTGGCCCTCGCCCCTGTGAGACATCTGTGTGTTTGGATCTCCGGGA  296

Query  261  TCATTACCTGGCCTCTGGGAACACAAGTGTGGCCCCCTGCACCGACTTCTTCAGCTTTGCCTGTGGAAGGGCCA  334
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCATTACCTGGCCTCTGGGAACACAAGTGTGGCCCCCTGCACCGACTTCTTCAGCTTTGCCTGTGGAAGGGCCA  370

Query  335  AAGAGACCAATAATTCTTTTCAGGAGCTTGCCACAAAGAACAAAAACCGACTTCGGAGAATACTGGAGGTCCAG  408
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGAGACCAATAATTCTTTTCAGGAGCTTGCCACAAAGAACAAAAACCGACTTCGGAGAATACTGGAGGTCCAG  444

Query  409  AATTCCTGGCACCCAGGCTCTGGGGAGGAGAAAGCCTTCCAGTTCTACAACTCCTGCATGGATACACTTGCCAT  482
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AATTCCTGGCACCCAGGCTCTGGGGAGGAGAAAGCCTTCCAGTTCTACAACTCCTGCATGGATACACTTGCCAT  518

Query  483  TGAAGCTGCAGGGACTGGTCCCCTCAGACAAGTTATTGAGGAGCTTGGAGGCTGGCGCATCTCTGGTAAATGGA  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAGCTGCAGGGACTGGTCCCCTCAGACAAGTTATTGAGGAGCTTGGAGGCTGGCGCATCTCTGGTAAATGGA  592

Query  557  CTTCCTTAAACTTTAACCGAACGCTGAGACTTCTGATGAGTCAGTATGGCCATTTCCCTTTCTTCAGAGCCTAC  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTTCCTTAAACTTTAACCGAACGCTGAGACTTCTGATGAGTCAGTATGGCCATTTCCCTTTCTTCAGAGCCTAC  666

Query  631  CTAGGACCTCATCCTGCCTCTCCACACACACCAGTCATCCAGATAGACCAGCCAGAGTTTGATGTTCCCCTCAA  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTAGGACCTCATCCTGCCTCTCCACACACACCAGTCATCCAGATAGACCAGCCAGAGTTTGATGTTCCCCTCAA  740

Query  705  GCAAGATCAAGAACAGAAGATCTATGCCCAGATCTTTCGGGAATACCTGACTTACCTGAATCAGCTGGGAACCT  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAAGATCAAGAACAGAAGATCTATGCCCAGATCTTTCGGGAATACCTGACTTACCTGAATCAGCTGGGAACCT  814

Query  779  TGCTGGGAGGAGACCCAAGCAAGGTGCAAGAACACTCTTCCTTGTCAATCTCCATCACTTCACGGCTGTTCCAG  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTGGGAGGAGACCCAAGCAAGGTGCAAGAACACTCTTCCTTGTCAATCTCCATCACTTCACGGCTGTTCCAG  888

Query  853  TTTCTGAGGCCCCTGGAGCAGCGGCGGGCACAGGGCAAGCTCTTCCAGATGGTCACTATCGACCAGCTCAAGGA  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTCTGAGGCCCCTGGAGCAGCGGCGGGCACAGGGCAAGCTCTTCCAGATGGTCACTATCGACCAGCTCAAGGA  962

Query  927  AATGGCCCCCGCCATCGACTGGTTGTCCTGCTTGCAAGCGACATTCACACCGATGTCCCTGAGCCCTTCTCAGT  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AATGGCCCCCGCCATCGACTGGTTGTCCTGCTTGCAAGCGACATTCACACCGATGTCCCTGAGCCCTTCTCAGT  1036

Query 1001  CCCTCGTGGTCCATGACGTGGAATATTTGAAAAACATGTCACAACTGGTGGAGGAGATGCTGCTAAAGCAGAGG  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCTCGTGGTCCATGACGTGGAATATTTGAAAAACATGTCACAACTGGTGGAGGAGATGCTGCTAAAGCAGAGG  1110

Query 1075  GACTTTCTGCAGAGCCACATGATCTTAGGGCTGGTGGTGACCCTTTCTCCAGCCCTGGACAGTCAATTCCAGGA  1148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GACTTTCTGCAGAGCCACATGATCTTAGGGCTGGTGGTGACCCTTTCTCCAGCCCTGGACAGTCAATTCCAGGA  1184

Query 1149  GGCACGCAGAAAGCTCAGCCAGAAACTGCGGGAACTGACAGAGCAACCACCCATGCCTGCCCGCCCACGATGGA  1222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GGCACGCAGAAAGCTCAGCCAGAAACTGCGGGAACTGACAGAGCAACCACCCATGCCTGCCCGCCCACGATGGA  1258

Query 1223  TGAAGTGCGTGGAGGAGACAGGCACGTTCTTCGAGCCCACGCTGGCGGCTTTGTTTGTTCGTGAGGCCTTTGGC  1296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGAAGTGCGTGGAGGAGACAGGCACGTTCTTCGAGCCCACGCTGGCGGCTTTGTTTGTTCGTGAGGCCTTTGGC  1332

Query 1297  CCGAGCACCCGAAGTGCTGCCATGAAATTATTCACTGCGATCCGGGATGCCCTCATCACTCGCCTCAGAAACCT  1370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCGAGCACCCGAAGTGCTGCCATGAAATTATTCACTGCGATCCGGGATGCCCTCATCACTCGCCTCAGAAACCT  1406

Query 1371  TCCCTGGATGAATGAGGAGACCCAGAACATGGCCCAGGACAAGGTTGCTCAACTGCAGGTGGAGATGGGGGCTT  1444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TCCCTGGATGAATGAGGAGACCCAGAACATGGCCCAGGACAAGGTTGCTCAACTGCAGGTGGAGATGGGGGCTT  1480

Query 1445  CAGAATGGGCCCTGAAGCCAGAGCTGGCCCGACAAGAATACAACGATATACAGCTTGGATCGAGCTTCCTGCAG  1518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CAGAATGGGCCCTGAAGCCAGAGCTGGCCCGACAAGAATACAACGATATACAGCTTGGATCGAGCTTCCTGCAG  1554

Query 1519  TCTGTCCTGAGCTGTGTCCGGTCCCTCCGAGCTAGAATTGTCCAGAGCTTCTTGCAGCCTCACCCCCAACACAG  1592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  TCTGTCCTGAGCTGTGTCCGGTCCCTCCGAGCTAGAATTGTCCAGAGCTTCTTGCAGCCTCACCCCCAACACAG  1628

Query 1593  GTGGAAGGTGTCCCCTTGGGACGTCAATGCTTACTATTCGGTATCTGACCATGTGGTAGTCTTTCCAGCTGGAC  1666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GTGGAAGGTGTCCCCTTGGGACGTCAATGCTTACTATTCGGTATCTGACCATGTGGTAGTCTTTCCAGCTGGAC  1702

Query 1667  TCCTCCAACCCCCATTCTTCCACCCTGGCTATCCCAGAGCCGTGAACTTTGGCGCTGCTGGCAGCATCATGGCC  1740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TCCTCCAACCCCCATTCTTCCACCCTGGCTATCCCAGAGCCGTGAACTTTGGCGCTGCTGGCAGCATCATGGCC  1776

Query 1741  CACGAGCTGTTGCACATCTTCTACCAGCTCTTACTGCCTGGGGGCTGCCTCGCCTGTGACAACCATGCCCTCCA  1814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  CACGAGCTGTTGCACATCTTCTACCAGCTCTTACTGCCTGGGGGCTGCCTCGCCTGTGACAACCATGCCCTCCA  1850

Query 1815  GGAAGCTCACCTGTGCCTGAAGCGCCATTATGCTGCCTTTCCATTACCTAGCAGAACCTCCTTCAATGACTCCC  1888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GGAAGCTCACCTGTGCCTGAAGCGCCATTATGCTGCCTTTCCATTACCTAGCAGAACCTCCTTCAATGACTCCC  1924

Query 1889  TCACATTCTTAGAGAATGCTGCAGACGTTGGGGGGCTAGCCATCGCGCTGCAGGCATACAGCAAGAGGCTGTTA  1962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TCACATTCTTAGAGAATGCTGCAGACGTTGGGGGGCTAGCCATCGCGCTGCAGGCATACAGCAAGAGGCTGTTA  1998

Query 1963  CGGCACCATGGGGAGACTGTCCTGCCCAGCCTGGACCTCAGCCCCCAGCAGATCTTCTTTCGAAGCTATGCCCA  2036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CGGCACCATGGGGAGACTGTCCTGCCCAGCCTGGACCTCAGCCCCCAGCAGATCTTCTTTCGAAGCTATGCCCA  2072

Query 2037  GGTGATGTGTAGGAAGCCCAGCCCCCAGGACTCTCACGACACTCACAGCCCTCCACACCTCCGAGTCCACGGGC  2110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GGTGATGTGTAGGAAGCCCAGCCCCCAGGACTCTCACGACACTCACAGCCCTCCACACCTCCGAGTCCACGGGC  2146

Query 2111  CCCTCAGCAGCACCCCAGCCTTTGCCAGGTATTTCCGCTGTGCACGTGGTGCTCTCTTGAACCCCTCCAGCCGC  2184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCTCAGCAGCACCCCAGCCTTTGCCAGGTATTTCCGCTGTGCACGTGGTGCTCTCTTGAACCCCTCCAGCCGC  2220

Query 2185  TGCCAGCTCTGG  2196
            ||||||||||||
Sbjct 2221  TGCCAGCTCTGG  2232