Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472089
• Subject: XR_949163.3
• Aligned Length: 3441
• Identities: 2421
• Gaps: 1020

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  GGAGTTTCACTTTGTAACTTTTAAGTGGTCGGAACACGCCCCGCGCTGCTGGGTCCCGCCAGACACGCCGCCGC  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGCAGGAAAGTCTACAGTTTGGTACCCCAGGACTCGCTGGTCAGGAAAGCCCTGCAGGACATGAGTGTTAGGCC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CGACGCCTGGCCCTTGGCAGCTTGGGAGGTGGCTGGGGCTGCTTTTGCCTTTGCCAGAGACAGCTCCAACTGAG  222

Query    1  --------------------------------------------------------------ATGATGGACTCC  12
                                                                          ||||||||||||
Sbjct  223  GACCTCTCCAACGGGCCCATCCACAGTCCTTCCTTCCCCTAGTGTCTGGGAAGACAGGCGCGATGATGGACTCC  296

Query   13  CCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGACCGGCCCAACGA  86
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGTTCCTGGAGCTGTGGCAGTCCAAGGCAGTGTCCATCAGGGAGCAGCTGGGACTCGGGGACCGGCCCAACGA  370

Query   87  CTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCATCCCCACTGTCC  160
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCTATTGCTACAACTCGGCCAAAAACAGCACCGTGCTCCAGGGGGTCACCTTTGGTGGCATCCCCACTGTCC  444

Query  161  TGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGATTCTGGGACTAT  234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTCATAGACGTCAGCTGCTTCCTGTTCTTAATCTTGGTGTTTTCTATTATAAGAAGAAGATTCTGGGACTAT  518

Query  235  GGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGACTTCCTCCTCAGG  308
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGCCGCATTGCCCTGGTGTCAGAAGCAGACAGCGAGTCCAGATTTCAGAGATTGTCATCGACTTCCTCCTCAGG  592

Query  309  TCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGCATGATGACCAGA  382
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAACAAGACTTTGAAAATGAGCTGGGATGCTGTCCCTGGCTGACTGCCATCTTCCGTCTGCATGATGACCAGA  666

Query  383  TCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTCCTGTTGGTGGTG  456
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCTGGAATGGTGTGGGGAGGACGCCATCCACTACCTGTCCTTCCAGAGGCACATCATCTTCCTGTTGGTGGTG  740

Query  457  GTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAAAGACCCGTATAG  530
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTCAGCTTTTTGTCCCTGTGTGTCATCCTGCCTGTCAACCTCTCAGGGGACTTGCTGGACAAAGACCCGTATAG  814

Query  531  TTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCATCTTTGCTGTCA  604
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTTTGGGAGGACAACAATAGCAAACCTACAGACTGACAATGACCTCCTTTGGCTGCACACCATCTTTGCTGTCA  888

Query  605  TTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAGGAGAACCTGGTG  678
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TTTACCTCTTCCTCACTGTGGGTTTCATGCGGCACCACACTCAGTCCATTAAGTACAAAGAGGAGAACCTGGTG  962

Query  679  AGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCACTTCCGGGACGC  752
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGCGGACCCTGTTCATCACAGGACTCCCCAGAGATGCCAGGAAGGAGACTGTGGAGAGCCACTTCCGGGACGC  1036

Query  753  GTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACCTGTGCAAGGAGA  826
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GTATCCCACGTGTGAGGTGGTTGATGTGCAGCTGTGCTACAACGTGGCCAAACTGATCTACCTGTGCAAGGAGA  1110

Query  827  AAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGGACCCTCATCAAC  900
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAAGAAGACTGAGAAGAGCCTGACCTATTACACAAACCTGCAGGTGAAGACAGGCCAGCGGACCCTCATCAAC  1184

Query  901  CCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCATCTCTTACTACAC  974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCAAGCCCTGTGGCCAGTTTTGCTGCTGTGAAGTGCTGGGCTGTGAGTGGGAAGACGCCATCTCTTACTACAC  1258

Query  975  ACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGCCCCTGGGAATGG  1048
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACGGATGAAGGACAGGCTGCTGGAGAGGATCACAGAGGAAGAACGCCACGTCCAGGACCAGCCCCTGGGAATGG  1332

Query 1049  CCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGCAAGTGTCAGAGC  1122
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CCTTCGTCACCTTCCAGGAGAAGTCCATGGCCACCTACATCCTGAAAGATTTCAATGCCTGCAAGTGTCAGAGC  1406

Query 1123  CTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTGGACAGTCACCTT  1196
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CTTCAGTGCAAAGGTGAGCCCCAGCCGTCCTCCCATAGCAGGGAGCTCTATACCTCCAAGTGGACAGTCACCTT  1480

Query 1197  TGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGCTACAGTGGCTGG  1270
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TGCTGCTGACCCTGAGGACATCTGCTGGAAGAACCTCTCTATCCAGGGCCTCCGCTGGTGGCTACAGTGGCTGG  1554

Query 1271  GCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCCACCATGGACAAG  1344
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCATCAACTTCACCCTCTTCCTGGGGCTATTTTTCCTGACCACACCCTCCATCATCCTGTCCACCATGGACAAG  1628

Query 1345  TTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCACCCTCCTGCTCTG  1418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTAATGTCACCAAACCCATCCATGCGCTGAATAACCCGATCATCAGCCAGTTCTTCCCCACCCTCCTGCTCTG  1702

Query 1419  GTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGACCAAGTCGGGGG  1492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTCCTTCTCGGCCCTGCTCCCCTCCATTGTCTACTACTCTACACTGCTGGAGTCTCACTGGACCAAGTCGGGGG  1776

Query 1493  AAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCCTCCCTGGGTCTC  1566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AAAACCAGATCATGATGACCAAAGTCTACATATTCTTGATCTTCATGGTGCTGATCCTGCCCTCCCTGGGTCTC  1850

Query 1567  ACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAGGTTGGAGTGCGT  1640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  ACCAGTCTAGATTTTTTCTTCCGGTGGCTCTTTGACAAAACTTCCTCGGAGGCCTCCATCAGGTTGGAGTGCGT  1924

Query 1641  CTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCAATGGCATGGAGC  1714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTTCCTGCCTGACCAGGGTGCCTTCTTTGTGAACTATGTCATCGCCTCGGCCTTCATCGGCAATGGCATGGAGC  1998

Query 1715  TGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCTGACCGCAGGAAT  1788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TGCTGCGGCTGCCAGGTCTCATCCTCTATACCTTCCGCATGATCATGGCCAAGACGGCTGCTGACCGCAGGAAT  2072

Query 1789  GTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGTCTTCACTGTCAT  1862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTCAAGCAGAACCAGGCCTTCCAGTACGAGTTTGGAGCCATGTATGCATGGATGCTGTGTGTCTTCACTGTCAT  2146

Query 1863  CGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCAAGCACATGGTGG  1936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CGTGGCCTACAGCATCACTTGTCCCATCATCGCGCCATTTGGCCTCATCTACATCCTGCTCAAGCACATGGTGG  2220

Query 1937  ACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCCGCTGTGAACCAG  2010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACCGGCACAACCTCTACTTCGTCTACCTCCCAGCCAAGCTGGAGAAGGGGATCCACTTTGCCGCTGTGAACCAG  2294

Query 2011  GCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGGTATGAAGGCCCC  2084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCCTTGGCAGCCCCCATCCTGTGCCTCTTCTGGCTCTACTTCTTTTCCTTCCTGCGCCTGGGTATGAAGGCCCC  2368

Query 2085  CGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCTGCTTTGGATGCT  2158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  CGCCACTCTGTTCACCTTCCTGGTGCTGCTGCTCACCATCCTGGTCTGCCTGGCTCACACCTGCTTTGGATGCT  2442

Query 2159  TCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAGGCAGAGGCCCAC  2232
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  TCAAGCACCTCAGCCCTCTGAACTACAAAACAGAAGAGCCTGCAAGTGACAAAGGAAGTGAGGCAGAGGCCCAC  2516

Query 2233  ATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGACAGCACTGTCTCC  2306
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  ATGCCCCCACCGTTCACACCCTACGTGCCTCGGATTCTGAACGGCTTGGCCTCGGAGAGGACAGCACTGTCTCC  2590

Query 2307  GCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGACAGTGCTTGGCGC  2380
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  GCAGCAGCAGCAGCAGCAGACCTATGGTGCCATCCACAACATCAGCGGGACTATCCCTGGACAGTGCTTGGCGC  2664

Query 2381  AGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCC---------------------------------  2421
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 2665  AGAGCGCCACGGGCAGTGTGGCTGCTGCCCCCCAGGAGGCCTGAGGCTGGGTCTCACTGCTCTGAAAAGACACA  2738

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 2739  ACCAGAATGGCCTGGGGCTCAGGCCCTTGGCTGAGTGGGAATGCGTTGGGACTGCCCAGCTGAGCTATCAGGAC  2812

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 2813  TTAAACAGGCACAATCAAAACCATCTCAGTCAGAAGTCAGAGCGTGGTACCTGGGAGAGAACCCCGAGGGGCAT  2886

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 2887  CTGGAGTGTTGGGGCCATGTTGGTGATATGGACGTACTTCACTTGTGAAAATTCTCACCAAAATGTTCACAAGT  2960

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 2961  TCTTTTGAAGGAGAGGGGATGTGGGGAGGGAGAAGAGGTTATATGAGATTGTCTTTAATGTTTTGTACTTTTTG  3034

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 3035  CATTTTTAAGCTTTTTGACAACATGTATTTTATAATCAGAGAAAAATGCTGACTTTTATAAAGTGCCATTATTA  3108

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 3109  TGATTATGAGCTGCCTCGTGTGTGTGGGCATGGGTTTGCCATGAAAACTATGAAGAACTTTGAGATGGGCAAGA  3182

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 3183  CAATTCCTGGGTGTCTTCTGGACAAGATCTAGGGAGTTACCTAGCAGACCTTCCGGACTGACGTGATGCTACAG  3256

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 3257  GGGTCCCATCTTTCCTTGTCATTGAGCTATTTTACAGTTCTGTGAATTGTAAAGAACTGAGGGTAATGCGAATG  3330

Query 2422  --------------------------------------------------------------------------  2421
                                                                                      
Sbjct 3331  ACTCTTGTTCATAGAGGCAAATGAATTTTGTCCCATGGAGATTTAATTGATATTACTCTGTGGATGTTGACAAG  3404

Query 2422  -------------------------------------  2421
                                                 
Sbjct 3405  TTTTGTGTCTGTTAGCAAATTAATTTCAGTGTTCTTA  3441