Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: NM_006300.4
• Aligned Length: 1614
• Identities: 1262
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGGTCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct    1  ATGACCACATTCAAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGTTCTTCACTGAGGAGGAACTGGGGCTACT  74

Query   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAACTTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCAAGACGTGATGCTTGAGAACTTCACGAACCTGCTGTCAGTGGGGCATC  148

Query  149  AACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGA  222
            ||||.|||||||      |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  AACCATTCCACC------CTTTCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTTTTGGATGATGGAGACAGCAACCCAAAGA  216

Query  223  GAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTCCAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTC  296
            |||||.||||||||.|||||||                  ||.||.|.|||||||||.||||||||||.||..|
Sbjct  217  GAAGGAAATTCAGGCGGCAAGA------------------CTATTGCGGAAGCAGGACCACATGAAGACTGCCC  272

Query  297  CTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCTCAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGT  370
            .||||||||||||||||||||||.|||||..|||||||||..||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct  273  TTGCCAGCAAATCTGGGAACAAACTGCAAGTGACTTAACCCAGTCTCAAGACTCCATCATAAATAATTCTCACT  346

Query  371  TCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACCCACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCC  444
            ||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|.||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  347  TCTTTGAACAAGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAGGCAGGACTATCTATAATTCATACAGGACAGAAACCTTCA  420

Query  445  CAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTGATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGA  518
            |||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||..||||||.|||
Sbjct  421  CAGAATGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTGCCATCTTTGATCCTCCTCAGCAGTTCCACTCAGGAGA  494

Query  519  GAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATCTCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCC  592
            |||||||.|||||||..|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|.||||.||||||||.|
Sbjct  495  GAAGTCTCATACATGCAATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATCTCAGCTCTTCGTATTCACCAGAGAGTTC  568

Query  593  ACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATTTAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCAT  666
            ||.||.||||||||||||.||.||||||..||.||||.||||||||.|||||.||||||..|||||||||||.|
Sbjct  569  ACTTGAGAGAGAAACTCTCTAAGTGTGACATGCGTGGTAAGGAATTCAGTCAGAGCTCATGTCTGCAAACTCGT  642

Query  667  CAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACT  740
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|||||.|...|||
Sbjct  643  GAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTGGGAAAGGCTTCAGATGTAGAGCGATACT  716

Query  741  TAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGTGAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATG  814
            |.|.|||||....||||||||||||||||||||||||||.|||||||||..||||||||.||||||||||||.|
Sbjct  717  TCAAGTTCACTGCAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTATATTTGTGAGAAATGTGGGAGGGCCTTCATTCACG  790

Query  815  ATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACCATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACC  888
            |||.|||||||.||.|||||.|||.|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||.|
Sbjct  791  ATTTCCAGCTTCAGAAACATCAGATAATTCATACTGGGGAGAAGCCGTTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGC  864

Query  889  TTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAGGAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATG  962
            ||||...||||||||||                                                         
Sbjct  865  TTCTGCCTTAGGTCAAG---------------------------------------------------------  881

Query  963  TGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGAT  1036
                                       .||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct  882  ---------------------------TCTTAATAGGCATTGCATGGTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAAT  928

Query 1037  GTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAAGCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAA  1110
            .||||.||||||||||||||||.|.||.|||.||||||||..|||||||||||.|..|.|||||||||.|||||
Sbjct  929  CTGAGGAGTGTGGAAAAGGCTTCACTGATAGCCTAGATTTGCATAAGCATCAGATAATTCACACAGGACAGAAA  1002

Query 1111  CCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATGCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAG  1184
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 1003  CCGTACAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCATATCTTTTGATCCATCAGCGAATCCACAG  1076

Query 1185  TGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTATACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGA  1258
            ||||||||||                                                                
Sbjct 1077  TGGAGAAAAA----------------------------------------------------------------  1086

Query 1259  GATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGAC  1332
                                |||||.|.||||||||||||||||||||||||..|||.|||||....||||.||
Sbjct 1087  --------------------CCATACAGATGTGAGGAGTGTGGGAAGGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTAAC  1140

Query 1333  TTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTC  1406
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||
Sbjct 1141  TTGCACCAGAGGGTCCATACTGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGGAATGTGGGAAGAGCTTTAGCCGGGCTTC  1214

Query 1407  AAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTCAAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTG  1480
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1215  AAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCGGAAAAAACCCTTCAAATGTGAGGATTGTGGAAAGAGGCTTG  1288

Query 1481  TACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGAAAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGG  1554
            |||||.||.|.|.|.||||||||||.|...|||||.|.|.|||.||||||.||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1289  TACACCGGTCTTTCTGTAAAGACCAACAAGGAGACCACAATGGAGAAAACTCATCCAAATGTGAGGACTGTGGG  1362

Query 1555  AGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTATTTCTAAATGACACA  1614
            |..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||.|..
Sbjct 1363  AAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTATTTTTAAATGATATG  1422