Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472100
• Subject: XM_005259209.3
• Aligned Length: 1642
• Identities: 1183
• Gaps: 290

Alignment

Query    1  ATGACCACATTCA----------------------------AGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGG  46
            ||||.| .|||||                            ||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct    1  ATGATC-GATTCAGGAGAAAAGAAGCCTGGGCGGAGAGCAGAGGAGGCAGTGACCTTCAAGGATGTGGCTGTGA  73

Query   47  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTGGAGAAC  120
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   74  TCTTCACTGAGGAGGAGCTGGGGCTGCTGGACCCTGCCCAGAGGAAGCTGTACCGAGATGTGATGCTTGAGAAC  147

Query  121  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTGGGGCATCAACCGTTCCACCAAGATACTTGCCACTTCCTAAGGGAAGAAAAGTT  194
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  148  TTCAGGAACCTGCTCTCAGTG-----------------------------------------------------  168

Query  195  TTGGATGATGGGGACAGCAACCCAAAGAGAAGGGAATTCAGGAGGCAAGATCCAAACTGAGTTGGAGTCTGTTC  268
                                                    |||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  169  ----------------------------------------GGAGGCAAGATCCAAACTGAGATGGAGACTGTTC  202

Query  269  CAGAAGCAGGAGCACATGAAGAGTGGTCCTGCCAGCAAATCTGGGAACAAATTGCAAAAGACTTAACCAGGTCT  342
            |||||||||||.||||||||||.|..||||||.|||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||
Sbjct  203  CAGAAGCAGGAACACATGAAGAATTTTCCTGCAAGCAAATTTGGGAACAAATTGCAAGTGACTTAACCAGGTCT  276

Query  343  CAGGACTCTATCATAAATAACTCTCAGTTCTTTGAAAATGGTGATGTCCCCTCCCAGGTTGAAGCAGGACTACC  416
            ||.||..|.|.|||||.||||||||||||.||||||.|.|.|||...||||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  277  CAAGATACCACCATAAGTAACTCTCAGTTATTTGAACAAGATGACAACCCCTCCCAGATTAAAGCAAGACTATC  350

Query  417  CACAATTCATACAGGACAGAAACCTTCCCAGGGTGGGAAGTGTAAACAGTCCTTCAGTGATGTTCCCATCTTTG  490
            .|||.||||.|||.||.|.|||||||.||||||||..||.||||||||||.|||||||||||||.||.||||||
Sbjct  351  TACAGTTCACACAAGAGAAAAACCTTTCCAGGGTGAAAATTGTAAACAGTTCTTCAGTGATGTTTCCTTCTTTG  424

Query  491  ATCTTCCTCAGCAGTTATACTCAGAAGAGAAGTCTTATACATGTGATGAGTGTGGAAAAAGCATCTGTTACATC  564
            |||||||||||||||||||.||||.||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  425  ATCTTCCTCAGCAGTTATATTCAGGAGAGAAGTCTCATACCTGTGATGAGTGTGGAAAAAGCTTCTGTTACATC  498

Query  565  TCAGCTCTTCATGTTCATCAGAGAGTCCACGTGGGAGAGAAACTCTTTATGTGTGATGTGTGTGGCAAGGAATT  638
            |||||.||||||.||||||||||.||||||.||||||.||||..||.||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct  499  TCAGCCCTTCATATTCATCAGAGGGTCCACATGGGAGTGAAATGCTATAAGTGTGATGTGTGTGGTAAGGAATT  572

Query  639  TAGTCAAAGCTCACATCTGCAAACTCATCAGAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAATGTG  712
            ||||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  573  TAGTCAGAGCTCACGTCTGCAAACTCATCAAAGAGTCCACACTGGAGAGAAACCATTCAAATGTGAGCAGTGTG  646

Query  713  GGAAAGGTTTCAGTCGTAGATCAGCACTTAATGTTCATCATAAATTACACACAGGAGAGAAACCTTACATTTGT  786
            |||||||.|||||..||||||||||||||||.||||||...||||||||||...|||||||||||||.|.||||
Sbjct  647  GGAAAGGCTTCAGATGTAGATCAGCACTTAAAGTTCATTGCAAATTACACATGAGAGAGAAACCTTATAATTGT  720

Query  787  GAGGCATGTGGGAAGGCCTTCATTCATGATTCCCAGCTTAAGGAACATAAGAGAATCCATACTGGGGAGAAACC  860
            |||..||||||||||||.|||||.||..|||.|||||||.||.|||||.|.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct  721  GAGAAATGTGGGAAGGCTTTCATGCACAATTTCCAGCTTCAGAAACATCACAGAATTCATACTGGGGAGAAGCC  794

Query  861  ATTCAAATGTGATATATGTGGTAAGACCTTCTATTTTAGGTCAAGACTTAAGAGCCATTCCATGGTTCACACAG  934
            ||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|.||||||||||                             
Sbjct  795  ATTCAAATGTGAAATATGTGGTAAGAGCTTCTGTCTTAGGTCAAG-----------------------------  839

Query  935  GAGAAAAACCATTTAGGTGTGATACATGTGATAAGAGCTTTCATCAGAGATCAGCACTTAATAGGCATTGCATG  1008
                                                                   .||||||||||||||||||
Sbjct  840  -------------------------------------------------------TCTTAATAGGCATTGCATG  858

Query 1009  GTCCACACAGGAGAGAAACCGTACAGATGTGAGCAGTGTGGAAAAGGCTTTATTGGTAGGCTAGATTTTTATAA  1082
            ||||||||||.||||||||.|||||.||.|||..|||.|||||.|||.||.||||.||||||||||||..||||
Sbjct  859  GTCCACACAGCAGAGAAACTGTACAAATCTGAAAAGTATGGAAGAGGTTTCATTGATAGGCTAGATTTGCATAA  932

Query 1083  GCATCAGGTGGTCCACACAGGAGAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAGATGGTCCTCAT  1156
            |||||||.||.|.||.|..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  933  GCATCAGATGATTCATATGGGACAGAAACCATATAATTGTAAAGAATGTGGGAAGAGCTTCAAATGGTCCTCAT  1006

Query 1157  GCCTTTTGAACCATCAGCGAGTCCACAGTGGAGAAAAAAGCTTCAAATGTGAAGAATGTGGGAAGGGATTTTAT  1230
            ..||||||..||||||.||||||||||.||||                                          
Sbjct 1007  ATCTTTTGGTCCATCAACGAGTCCACACTGGA------------------------------------------  1038

Query 1231  ACAAATTCACAACTGTCTTCCCATCAGAGATCCCACAGTGGTGAAAAGCCATATAAATGTGAGGAGTGTGGGAA  1304
                                                      |||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  ------------------------------------------GAAAAGCCATACAAATGTGAGGAGTGTGGGAA  1070

Query 1305  GGGCTATGTTACTAAGTTTAATCTTGACTTGCACCAGAGGGTCCACACGGGAGAGAGACCTTATAATTGTAAGG  1378
            ||||||..|||.|||||....|||||||||.|||||.||...||||||||||||||||.|||||||.|||.|..
Sbjct 1071  GGGCTACATTAGTAAGTCAGGTCTTGACTTCCACCATAGAACCCACACGGGAGAGAGATCTTATAACTGTGATA  1144

Query 1379  AATGTGGGAAGAACTTTAGCCGGGCCTCAAGTATTTTGAATCATAAGAGACTCCACTGCCAGAAAAAACCATTC  1452
            |.||.|||||||.||||||.|..||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||.|||||.
Sbjct 1145  ACTGCGGGAAGAGCTTTAGACATGCTTCTAGTATTTTGAATCATAAGAAACTCCACTGCCAAAGAAAGCCATTG  1218

Query 1453  AAATGTGAGGACTGTGGAAAGAGGCTTGTACACAGGACATACCGTAAAGACCAGCCGAGAGACTATAGTGGGGA  1526
            ||||||||.|||||||||||||||||||||..|.||.|||||.||||||||||.|..||||||.|.|||||.||
Sbjct 1219  AAATGTGAAGACTGTGGAAAGAGGCTTGTATGCCGGTCATACTGTAAAGACCAACAAAGAGACCACAGTGGAGA  1292

Query 1527  AAACCCATCCAAATGTGAGGATTGTGGGAGACGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATACTTTTATCATTAT  1600
            |||||||||||||||||||||.|||||||..||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1293  AAACCCATCCAAATGTGAGGACTGTGGGAAGCGCTACAAGAGGCGCTTGAATCTGGATATAATTTTATCATTAT  1366

Query 1601  TTCTAAATGACACA  1614
            ||.|||||||||.|
Sbjct 1367  TTTTAAATGACATA  1380