Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472102
• Subject: XM_011521403.2
• Aligned Length: 2728
• Identities: 2618
• Gaps: 110

Alignment

Query    1  ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA  74

Query   75  GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTG---------  139
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct   75  GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGTGCCAGCAG  148

Query  140  ------------------------GTTGCAACAGATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCC  189
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATGTAGCATCACCTGAAAGCGGCAGTTGCAACAGATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCC  222

Query  190  AAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAGTTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGT  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAGTTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGT  296

Query  264  CCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTACGGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACC  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTACGGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACC  370

Query  338  TCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTACGGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTC  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTACGGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTC  444

Query  412  TGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGGGACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTG  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGGGACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTG  518

Query  486  TGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGACTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAG  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGACTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAG  592

Query  560  AGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCTTAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAG  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCTTAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAG  666

Query  634  GATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGGATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACC  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGGATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACC  740

Query  708  AGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCATTGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAAC  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCATTGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAAC  814

Query  782  CGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAAGGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTAT  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAAGGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTAT  888

Query  856  GTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATCCCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGA  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATCCCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGA  962

Query  930  CAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGAAATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTC  1003
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGAAATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTC  1036

Query 1004  ATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCTTCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCT  1077
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCTTCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCT  1110

Query 1078  AAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGCCTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTT  1151
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGCCTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTT  1184

Query 1152  GCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGGGGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACC  1225
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGGGGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACC  1258

Query 1226  TGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGCTGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATG  1299
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGCTGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATG  1332

Query 1300  GAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAGCTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCT  1373
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAGCTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCT  1406

Query 1374  CCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCTACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGC  1447
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCTACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGC  1480

Query 1448  ACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGCTTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCT  1521
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGCTTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCT  1554

Query 1522  CTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCCAACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCT  1595
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCCAACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCT  1628

Query 1596  GCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGATTTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAG  1669
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGATTTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAG  1702

Query 1670  ATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGGAAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTA  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGGAAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTA  1776

Query 1744  ATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTATCTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCG  1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTATCTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCG  1850

Query 1818  GTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGAGAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCC  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGAGAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCC  1924

Query 1892  CTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGGAAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATG  1965
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGGAAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATG  1998

Query 1966  TTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGCCGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGA  2039
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  TTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGCCGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGA  2072

Query 2040  ACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACATGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATA  2113
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACATGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATA  2146

Query 2114  CAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACTATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCC  2187
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACTATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCC  2220

Query 2188  CTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATTCACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAA  2261
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATTCACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAA  2294

Query 2262  AGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGAGCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACC  2335
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGAGCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACC  2368

Query 2336  TTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATACGCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAG  2409
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATACGCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAG  2442

Query 2410  AAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTCCATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACA  2483
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  AAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTCCATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACA  2516

Query 2484  CCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAAGGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAA--------  2549
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct 2517  CCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAAGGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGGAGGT  2590

Query 2550  --------------------------------------------------------------CAGTGCATTTGC  2561
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 2591  GCCGCTGCCAGAGAAGTGGTCACTTAGAAGCAGTCCTCACTCCCAAGCCATTTTCTTCCCTGCAGTGCATTTGC  2664

Query 2562  AAGATACCCCAATGGAGTGGTCGTCCATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT  2625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct 2665  AAGATACCCCAATGGAGTGGTCGTCCATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGC-------  2721