Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472102
- Subject:
- XM_017022037.1
- Aligned Length:
- 2628
- Identities:
- 2570
- Gaps:
- 51
Alignment
Query 1 ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCACGACGCTTTCGAGCCAGTGCCGATCCTAGAAAAGCTGCCTCTGCAAATCGACTGTCTGGCTGCCTGGGA 74
Query 75 GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGGTTGCAACA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAATGGCTTCTTGTGGGAACCAAACAAGGACATCTTCTTCTCTATAGGATTCGGAAGGACGTTGGTTGCAACA 148
Query 149 GATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCCAAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GATTTGAAGTGACACTAGAGAAATCCAATAAGAACTTCTCCAAAAAGATTCAGCAGATCCATGTGGTTTCCCAG 222
Query 223 TTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGTCCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TTTAAGATTCTGGTCAGCTTGTTAGAAAATAACATTTATGTCCATGACCTATTGACATTTCAACAAATCACTAC 296
Query 297 GGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTAC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGTTTCAAAGGCAAAGGGAGCATCACTGTTTACTTGTGACCTCCAGCACACAGAGACCGGTGAGGAGGTGTTAC 370
Query 371 GGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 GGATGTGTGTGGCAGTAAAAAAGAAGCTGCAGCTCTATTTCTGGAAGGACAGGGAATTTCATGAATTGCAGGGG 444
Query 445 GACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GACTTTAGTGTGCCAGATGTGCCCAAGTCCATGGCGTGGTGTGAAAATTCTATCTGTGTGGGTTTCAAGAGAGA 518
Query 519 CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTACTACCTAATAAGGGTGGATGGAAAGGGGTCCATCAAAGAGCTCTTTCCAACAGGAAAACAGCTGGAGCCCT 592
Query 593 TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAGTTGCACCTCTGGCAGATGGAAAAGTGGCTGTGGGCCAGGATGATCTCACCGTGGTACTCAATGAGGAAGGG 666
Query 667 ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATCTGCACACAGAAATGTGCCCTGAACTGGACGGACATACCAGTGGCCATGGAGCACCAGCCTCCCTACATCAT 740
Query 741 TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCAGTGTTGCCTCGATATGTTGAGATCCGAACATTTGAACCGAGGCTTCTGGTCCAAAGCATTGAATTGCAAA 814
Query 815 GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCCCCGTTTCATTACCTCAGGAGGATCAAACATTATCTATGTGGCCAGCAATCATTTTGTTTGGAGACTCATC 888
Query 889 CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTGTCCCCATGGCAACCCAAATCCAACAACTTCTCCAGGACAAGCAGTTTGAATTGGCTCTGCAGCTCGCAGA 962
Query 963 AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AATGAAAGATGATTCTGACAGTGAAAAGCAGCAACAAATTCATCACATCAAGAACTTGTATGCCTTCAACCTCT 1036
Query 1037 TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCTGCCAGAAGCGTTTTGATGAGTCCATGCAGGTCTTTGCTAAACTTGGCACAGATCCCACCCATGTGATGGGC 1110
Query 1111 CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGTACCCTGACCTGCTGCCCACAGACTACAGAAAGCAGTTGCAGTATCCCAACCCATTGCCTGTGCTCTCCGG 1184
Query 1185 GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GGCTGAATTGGAGAAGGCTCACTTAGCTCTGATTGACTACCTGACACAGAAACGAAGTCAATTGGTAAAGAAGC 1258
Query 1259 TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TGAATGACTCTGATCACCAGTCAAGCACCTCACCGCTCATGGAAGGCACTCCCACCATCAAATCCAAGAAGAAG 1332
Query 1333 CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTGCTACAAATCATCGACACCACCCTGCTCAAGTGCTATCTCCATACAAATGTGGCCCTGGTGGCCCCCTTGCT 1406
Query 1407 ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 ACGCCTGGAGAACAATCACTGCCACATCGAGGAGAGCGAGCACGTGCTAAAGAAGGCTCACAAGTACAGTGAGC 1480
Query 1481 TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTATCATCCTGTATGAGAAGAAGGGGCTCCACGAGAAAGCTCTGCAGGTGCTCGTGGACCAGTCCAAGAAAGCC 1554
Query 1555 AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AACTCCCCTCTGAAAGGCCACGAGAGGACAGTGCAGTATCTGCAGCATCTGGGCACAGAAAACCTGCATTTGAT 1628
Query 1629 TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTTCTCCTACTCAGTGTGGGTGCTGAGAGACTTCCCAGAAGATGGCCTGAAGATATTTACTGAAGATCTCCCGG 1702
Query 1703 AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 AAGTGGAGTCTCTGCCACGTGATCGAGTCCTCGGCTTCTTAATAGAGAATTTTAAGGGTCTGGCTATTCCTTAT 1776
Query 1777 CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 CTGGAACACATCATCCATGTTTGGGAGGAGACAGGCTCTCGGTTCCACAACTGCCTGATCCAGCTATACTGTGA 1850
Query 1851 GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 GAAGGTGCAAGGTCTGATGAAGGAGTATCTCCTGTCCTTCCCTGCAGGCAAAACCCCAGTCCCAGCTGGAGAGG 1924
Query 1925 AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AAGAGGGTGAGCTGGGAGAATACCGGCAAAAGCTCCTCATGTTCTTGGAGATTTCCAGCTACTATGATCCAGGC 1998
Query 1999 CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CGGCTCATCTGTGATTTTCCCTTTGATGGCCTCTTAGAAGAACGAGCTCTCCTGTTGGGGCGCATGGGGAAACA 2072
Query 2073 TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGAACAAGCTCTTTTCATTTATGTCCACATCTTGAAGGATACAAGGATGGCTGAGGAGTACTGCCACAAACACT 2146
Query 2147 ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 ATGACCGAAACAAAGATGGCAACAAAGATGTGTATCTGTCCCTGCTTCGGATGTACCTGTCGCCCCCCAGCATT 2220
Query 2221 CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 CACTGCCTGGGGCCAATCAAGCTGGAACTACTGGAGCCAAAAGCCAACCTCCAGGCCGCTCTGCAGGTCCTCGA 2294
Query 2295 GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 GCTACACCACAGCAAACTGGACACCACCAAGGCCCTCAACCTTCTGCCAGCAAACACTCAGATCAATGACATAC 2368
Query 2369 GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 GCATCTTCCTGGAAAAGGTCTTGGAAGAAAATGCACAAAAGAAACGGTTCAATCAAGTGCTCAAGAACCTTCTC 2442
Query 2443 CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 CATGCAGAATTCCTGAGGGTCCAGGAAGAGCGGATTTTACACCAGCAGGTGAAGTGCATCATCACAGAGGAGAA 2516
Query 2517 GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGTGCATTTGCAA-GATACCCCAATGG--AGTGGTCGTCC 2587
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.| || ||.|.| |||| ..|||..||||
Sbjct 2517 GGTGTGCATGGTGTGTAAGAAGAAGATTGGGAACAGAG-------AAGGAGAAC---ATGGCTGCTGGCTGTCC 2580
Query 2588 ATTACTTCTGTTCCAAAGAGGTAAACCCAGCTGACACT 2625
Sbjct 2581 -------------------------------------- 2580