Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472148
- Subject:
- XM_006724225.4
- Aligned Length:
- 1273
- Identities:
- 974
- Gaps:
- 299
Alignment
Query 1 ATGGCAGGGAAAGTAAAATGGGTCACTGATATCGAGAAGTCAGTGCTGATCAATAACTTTGAAAAGAGAGGATG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGTCCAAGTGACAGAAAACGAGGACTGGAATTTTTACTGGATGAGTGTGCAAACCATCCGAAATGTGTTCAGCG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 TTGAAGCTGGATATCGGCTCTCAGATGACCAAATAGTCAACCATTTTCCAAACCACTATGAACTGACCCGGAAG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GACCTGATGGTGAAGAACATCAAAAGATACAGGAAGGAGCTGGAGAAAGAAGGGAGTCCTCTGGCAGAAAAAGA 296
|
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------A 1
Query 297 TGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGG----ACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTG 366
|||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2 TGAAAATGGAAAATACCTCTATCTGGGTTTACTTTGTTCCAGTCACCTATATGCTGCCCGCTGACTACAACCTG 75
Query 367 TTTGTAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGG 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 76 TTTGTAGAGGAGTTCCGGAAGAGCCCGTCCAGCACCTGGATCATGAAGCCTTGTGGCAAGGCCCAGGGAAAGGG 149
Query 441 CATCTTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTC 514
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 150 CATCTTCCTTATCAACAAGCTCTCACAGATCAAAAAGTGGTCCCGGGACAGCAAGACATCTTCGTTTGTGTCTC 223
Query 515 AATCTAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGAC 588
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 224 AATCTAATAAGGAAGCCTACGTGATCTCTCTCTATATTAACAACCCGTTACTAATTGGCGGGAGGAAGTTCGAC 297
Query 589 CTGCGCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTT 662
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 298 CTGCGCTTGTACGTTCTGGTGTCCACGTACCGTCCACTGCGCTGTTACATGTACAAGCTTGGGTTTTGCCGGTT 371
Query 663 CTGCACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCC 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 372 CTGCACAGTGAAATACACCCCGAGTACCAGTGAGCTGGACAACATGTTCGTTCATCTCACCAACGTCGCCATCC 445
Query 737 AGAAACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAG 810
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 446 AGAAACACGGGGAGGACTACAACCACATCCATGGGGGCAAGTGGACAGTGAGTAACCTGCGGCTCTACCTGGAG 519
Query 811 AGCACCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGC 884
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 520 AGCACCCGCGGCAAGGAGGTGACCAGCAAGCTGTTCGACGAGATCCACTGGATCATCGTGCAGTCCCTGAAGGC 593
Query 885 TGTGGCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGC 958
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 594 TGTGGCGCCGGTGATGAACAATGACAAGCACTGCTTTGAATGCTATGGCTACGACATCATCATCGACGACAAGC 667
Query 959 TGAAGCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAG 1032
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 668 TGAAGCCCTGGCTGATCGAGGTGAATGCGTCCCCGTCTCTCACGTCCAGCACTGCCAATGACCGAATCCTCAAG 741
Query 1033 TACAACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTC 1106
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 742 TACAACCTGATTAATGACACCCTCAACATCGCCGTCCCGAATGGTGAAATCCCAGACTGCAAATGGAACAAGTC 815
Query 1107 GCCACCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACC 1180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 816 GCCACCTAAGGAAGTCCTCGGCAATTACGAGATTCTGTATGATGAAGAATTGGCCCAGGGTGACGGGGCTGACC 889
Query 1181 GGGAGCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTC 1254
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 890 GGGAGCTGAGAAGCCGTCAGGGTCAGTCTCTGGGGCCCAGAGCAGGCCGATCGAGAGACTCGGGGAGAGCGGTC 963
Query 1255 CTCACCACCTGGAAG 1269
|||||||||||||||
Sbjct 964 CTCACCACCTGGAAG 978