Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472194
• Subject: XM_017028745.2
• Aligned Length: 1374
• Identities: 1317
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGGCCAGCGACGGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAG------------  62
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct    1  ATGGCCAGCGACGGGGCCAGGAAGCAATTCTGGAAGCGCAGCAACAGCAAGCTCCCGGGCAGCATCCAGCACGT  74

Query   63  ---------------------------------------------TTTGCTCAGGTCCACGGCCAAGATGCCGA  91
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTATGGTGCCCAGCACCCCCCCTTTGATCCACTGTTACATGGCACTTTGCTCAGGTCCACGGCCAAGATGCCGA  148

Query   92  CCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCAGCGATGCCTGGGACGCT  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCACACCAGTGAAGGCCAAGAGGGTCAGCACCTTCCAGGAGTTTGAGAGCAATACCAGCGATGCCTGGGACGCT  222

Query  166  GGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTGGTCATGGAGACGGCCAA  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GGGGAGGACGACGATGAGCTCCTGGCCATGGCGGCGGAGAGCCTGAACTCCGAGGTGGTCATGGAGACGGCCAA  296

Query  240  CCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCCAGGGCTTCAGCAGAAGC  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGTGTGCTGCGTAACCACAGCCAGCGGCAGGGGCGGCCCACGCTGCAGGAGGGGCCAGGGCTTCAGCAGAAGC  370

Query  314  CCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGTCGGTCAGTGAGAGCCAC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAGGCCCGAGGCAGAGCCGCCCTCACCCCCCAGCGGCGACCTCCGGCTGGTGAAGTCGGTCAGTGAGAGCCAC  444

Query  388  ACGTCCTGTCCTGCAGAGGAATTACGGAGGTTGAGCTGGTCCGGAATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTG  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACGTCCTGTCCTGCAGAGGAATTACGGAGGTTGAGCTGGTCCGGAATCCCTAAGCCAGTGCGTCCAATGACGTG  518

Query  462  GAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCCAATGTAGACCGGAGACCAGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAAT  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GAAGCTCCTCTCAGGTTACCTTCCCGCCAATGTAGACCGGAGACCAGCCACTCTCCAGAGAAAACAAAAAGAAT  592

Query  536  ATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGATTCTAGGAACGACGAAGTTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCAC  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATTTTGCATTTATTGAGCACTATTACGATTCTAGGAACGACGAAGTTCACCAGGACACATACAGGCAGATCCAC  666

Query  610  ATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAGCGTTGATCCTGCAGCCCAAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTT  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAGACATCCCTCGCATGAGCCCTGAAGCGTTGATCCTGCAGCCCAAGGTGACGGAGATTTTTGAAAGGATCTT  740

Query  684  GTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCCAGTGGATACGTTCAGGGTATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTG  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GTTCATATGGGCGATCCGCCACCCAGCCAGTGGATACGTTCAGGGTATAAATGATCTCGTCACTCCTTTCTTTG  814

Query  758  TGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGCAGAGGAGGTGGACACGGTGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTG  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGGTCTTCATTTGTGAATACATAGAGGCAGAGGAGGTGGACACGGTGGACGTCTCCGGCGTGCCCGCAGAGGTG  888

Query  832  CTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACTGGTGCATGAGCAAGCTGCTGGATGGCATTCAGGACAACTACACCTT  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTGCAACATCGAGGCCGACACCTACTGGTGCATGAGCAAGCTGCTGGATGGCATTCAGGACAACTACACCTT  962

Query  906  TGCCCAACCTGGGATTCAAATGAAAGTGAAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACC  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGCCCAACCTGGGATTCAAATGAAAGTGAAAATGTTAGAAGAACTCGTGAGCCGGATTGATGAGCAAGTGCACC  1036

Query  980  GGCACCTGGACCAACACGAAGTGAGATACCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAG  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GGCACCTGGACCAACACGAAGTGAGATACCTGCAGTTTGCCTTCCGCTGGATGAACAACCTGCTGATGAGGGAG  1110

Query 1054  GTGCCCCTGCGTTGTACCATCCGCCTGTGGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTT  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTGCCCCTGCGTTGTACCATCCGCCTGTGGGACACCTACCAGTCTGAACCGGACGGCTTTTCTCATTTCCACTT  1184

Query 1128  GTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCGTGAGATGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGC  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GTACGTGTGCGCTGCTTTTCTCGTGAGATGGAGGAAGGAAATACTAGAAGAAAAAGATTTTCAAGAGCTGCTGC  1258

Query 1202  TCTTCCTCCAGAACCTGCCCACAGCCCACTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGC  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TCTTCCTCCAGAACCTGCCCACAGCCCACTGGGATGATGAGGACATCAGCCTGTTGCTGGCCGAGGCCTACCGC  1332

Query 1276  CTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGCCCCCAATCACTACAAGAAA  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTCAAGTTTGCTTTTGCCGACGCCCCCAATCACTACAAGAAA  1374