Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472207
• Subject: NM_001039347.1
• Aligned Length: 1908
• Identities: 1739
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCGGAGTTGCGGCCTGGCTGCCTTTTGCCCGGGCTGCGGCCATCGGGTGGATGCCGGTGGCCAACTG  74
            ||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCAGGAGTTGCAGCCTGGCTGCCTTTTGCCCGGGCTGCGGCCATTGGATGGATGCCAGTGGCCAACTG  74

Query   75  CCCCATGCCCCTGGCCCCGGCCGACAAGAACAAGCGGCAGGATGAGCTGATTGTCCTCAACGTGAGTGGGCGGA  148
            ||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||..
Sbjct   75  CCCCATGCCCCTAGCTCCAGCGGACAAGAACAAGCGGCAAGACGAGCTGATCGTCCTCAACGTAAGTGGACGAC  148

Query  149  GGTTCCAGACCTGGAGGACCACGCTGGAGCGCTACCCGGACACCCTGCTGGGCAGCACGGAGAAGGAGTTCTTC  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  149  GGTTCCAGACCTGGAGGACCACTCTGGAGCGCTATCCCGACACCTTGCTGGGTAGCACAGAGAAGGAGTTCTTC  222

Query  223  TTCAACGAGGACACCAAGGAGTACTTCTTCGACCGGGACCCCGAGGTGTTCCGCTGCGTGCTCAACTTCTACCG  296
            |||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct  223  TTCAATGAGGACACGAAGGAGTACTTCTTTGACCGTGACCCGGAAGTGTTCCGTTGTGTGCTTAACTTCTACCG  296

Query  297  CACGGGGAAGCTGCACTACCCGCGCTACGAGTGCATCTCTGCCTACGACGACGAGCTGGCCTTCTACGGCATCC  370
            |||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CACCGGGAAGCTGCACTACCCACGCTATGAATGCATCTCTGCCTACGACGATGAACTGGCCTTCTATGGCATCC  370

Query  371  TCCCGGAGATCATCGGGGACTGCTGCTACGAGGAGTACAAGGACCGCAAGAGGGAGAACGCCGAGCGGCTCATG  444
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.||||||||||||
Sbjct  371  TCCCCGAGATCATCGGAGACTGCTGCTACGAGGAGTACAAAGACCGCAAGCGGGAGAATGCGGAGCGGCTCATG  444

Query  445  GACGACAACGACTCGGAGAACAACCAGGAGTCCATGCCCTCGCTCAGCTTCCGCCAGACCATGTGGCGGGCCTT  518
            ||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GATGACAATGACTCTGAAAACAACCAGGAGTCCATGCCCTCTCTCAGCTTCCGTCAGACCATGTGGCGGGCCTT  518

Query  519  CGAGAACCCCCACACCAGCACGCTGGCCCTGGTCTTCTACTACGTGACTGGCTTCTTCATCGCTGTCTCGGTCA  592
            |||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  519  CGAGAACCCACACACCAGCACCCTGGCACTGGTCTTCTACTATGTGACTGGCTTCTTCATTGCCGTCTCGGTCA  592

Query  593  TCACCAACGTGGTGGAGACGGTGCCGTGCGGCACGGTCCCGGGCAGCAAGGAGCTGCCGTGCGGGGAGCGCTAC  666
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct  593  TCACCAATGTGGTGGAGACGGTGCCTTGCGGCACCGTGCCTGGGAGCAAGGAGCTGCCGTGTGGAGAGCGCTAT  666

Query  667  TCGGTGGCCTTCTTCTGCCTGGACACGGCGTGCGTCATGATCTTCACCGTGGAGTACCTCCTGCGGCTCTTCGC  740
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  667  TCGGTGGCTTTCTTTTGCCTGGACACTGCCTGTGTAATGATCTTCACAGTGGAGTACCTCCTCCGACTCTTTGC  740

Query  741  GGCTCCCAGCCGCTACCGCTTCATCCGCAGCGTCATGAGCATCATCGACGTGGTGGCCATCATGCCCTACTACA  814
            |||.||||||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct  741  GGCACCCAGCAGATACCGCTTCATCCGCAGTGTGATGAGCATTATCGACGTTGTGGCCATCATGCCCTATTACA  814

Query  815  TCGGTCTGGTCATGACCAACAACGAGGACGTGTCCGGCGCCTTCGTCACGCTCCGGGTCTTCCGCGTCTTCAGG  888
            |.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  TTGGCCTGGTCATGACCAACAATGAGGACGTGTCTGGGGCATTTGTCACACTCCGGGTCTTCCGTGTCTTCAGG  888

Query  889  ATCTTCAAGTTTTCCCGCCACTCCCAGGGCCTGCGGATCCTGGGCTACACACTGAAGAGCTGTGCCTCCGAACT  962
            |||||||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  ATCTTCAAGTTCTCCCGACATTCCCAGGGTCTACGGATCCTGGGCTACACCCTGAAGAGCTGTGCCTCAGAACT  962

Query  963  GGGCTTTCTTCTCTTCTCCCTCACCATGGCCATCATCATCTTTGCCACTGTGATGTTTTATGCCGAGAAGGGCT  1036
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  963  GGGCTTTCTTCTCTTCTCCCTTACCATGGCCATCATCATCTTTGCCACTGTGATGTTTTATGCTGAGAAGGGCT  1036

Query 1037  CCTCGGCCAGCAAGTTCACAAGCATCCCTGCCTCGTTTTGGTACACCATTGTCACCATGACCACACTGGGATAC  1110
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1037  CCTCTGCCAGCAAGTTCACAAGCATCCCTGCATCTTTCTGGTACACCATAGTCACCATGACTACACTGGGATAT  1110

Query 1111  GGAGACATGGTTCCTAAGACGATTGCAGGGAAGATCTTCGGCTCCATCTGCTCCTTGAGTGGCGTCCTGGTCAT  1184
            |||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||.|.||.||.|||||||||||
Sbjct 1111  GGAGACATGGTGCCTAAGACAATCGCAGGGAAGATATTTGGCTCCATCTGCTCCCTCAGCGGTGTCCTGGTCAT  1184

Query 1185  TGCCCTGCCAGTCCCTGTGATTGTTTCCAACTTTAGCCGGATTTACCACCAGAATCAGAGAGCTGATAAACGCA  1258
            |||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1185  TGCCCTGCCGGTCCCTGTGATAGTCTCCAACTTTAGCAGGATCTACCACCAGAATCAGAGAGCAGATAAACGCA  1258

Query 1259  GGGCACAAAAGAAGGCCCGCCTTGCCAGGATCCGTGTGGCCAAAACAGGCAGTTCGAATGCATACCTGCACAGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1259  GGGCACAAAAGAAGGCCCGCCTTGCCAGGATCCGGGTGGCCAAAACGGGAAGCTCCAATGCCTACCTGCACAGC  1332

Query 1333  AAGCGCAACGGGCTCCTCAACGAGGCGCTGGAGCTGACGGGCACCCCAGAAGAGGAGCACATGGGCAAGACCAC  1406
            ||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGCGCAATGGGCTCCTCAATGAGGCCCTGGAGCTGACGGGCACCCCAGAAGAGGAGCAGATGGGCAAGACCAC  1406

Query 1407  CTCACTCATCGAGAGCCAGCATCATCACCTGCTGCACTGCCTGGAAAAAACCACTAACCACGAGTTTATTGATG  1480
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1407  CTCACTCATCGAGAGCCAGCACCACCACCTGCTACACTGCTTAGAAAAGACCACTAACCATGAGTTTATTGATG  1480

Query 1481  AGCAGATGTTTGAGCAGAACTGCATGGAGAGTTCAATGCAGAACTACCCATCCACAAGAAGTCCCTCACTGTCC  1554
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||
Sbjct 1481  AGCAGATGTTTGAGCAGAACTGCATGGAGAGCTCGATGCAGAACTACCCCTCCACCAGAAGTCCTTCTCTGTCC  1554

Query 1555  AGCCACCCAGGCCTCACTACCACCTGCTGCTCCCGTCGTAGTAAGAAGACCACACACCTGCCCAATTCTAACCT  1628
            ||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1555  AGCCACTCGGGCCTCACCACCACCTGCTGCTCCCGTCGTAGCAAGAAGACCACACACCTGCCCAACTCTAACCT  1628

Query 1629  GCCAGCTACTCGCCTGCGCAGCATGCAAGAGCTCAGCACGATCCACATCCAGGGCAGTGAGCAGCCCTCCCTCA  1702
            |||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629  GCCTGCCACCCGCCTGCGCAGCATGCAGGAGCTCAGCACGCTCCACATCCAGGGCAGCGAGCAGCCCTCCCTCA  1702

Query 1703  CAACCAGTCGCTCCAGCCTTAATTTGAAAGCAGACGACGGACTGAGACCAAACTGCAAAACATCCCAGATCACC  1776
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1703  CCACCAGTCGCTCCAGCCTTAATTTGAAAGCAGACGATGGACTGAGACCAAACTGCAAAACATCCCAGATTACC  1776

Query 1777  ACAGCCATCATCAGCATCCCCACTCCCCCAGCGCTAACCCCAGAGGGGGAAAGTCGGCCACCCCCTGCCAGCCC  1850
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACGGCCATCATCAGCATCCCCACCCCCCCAGCTCTGACCCCCGAGGGAGAAAGTCGGCCACCCCCTGCCAGCCC  1850

Query 1851  AGGCCCCAACACGAACATTCCTTCCATAGCCAGCAATGTTGTCAAGGTCTCCGCCTTG  1908
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 1851  AGGCCCCAACACGAACATTCCTTCCATAACCAGCAATGTCGTCAAGGTCTCTGCCTTG  1908