Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472241
• Subject: XM_011537847.2
• Aligned Length: 1944
• Identities: 1761
• Gaps: 183

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGGCGAGCGGCGCAG  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCCCGCAAGGCAAGCGAGAATGTGGAGTACACGCTGCGGAGCCTGAGCAGCCTGATGGGCGAGCGGCGCAG  74

Query   18  GAAGCAGCCGGAGCCGGACGCGGCGAGCGCGGCCGGGGAGTGCAGCCTCCTGGCTGCCGCCGAATCGAGCACCA  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCAGCCGGAGCCGGACGCGGCGAGCGCGGCCGGGGAGTGCAGCCTCCTGGCTGCCGCCGAATCGAGCACCA  148

Query   92  GCCTGCAGAGCGCGGGCGCGGGCGGCGGCGGCGTCGGGGACCTGGAGCGCGCGGCGCGGCGGCAGTTCCAGCAG  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCTGCAGAGCGCGGGCGCGGGCGGCGGCGGCGTCGGGGACCTGGAGCGCGCGGCGCGGCGGCAGTTCCAGCAG  222

Query  166  GACGAGACCCCCGCCTTCGTGTACGTGGTGGCCGTCTTCTCCGCGCTGGGCGGCTTCCTGTTTGGCTATGACAC  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACGAGACCCCCGCCTTCGTGTACGTGGTGGCCGTCTTCTCCGCGCTGGGCGGCTTCCTGTTTGGCTATGACAC  296

Query  240  CGGGGTGGTGTCAGGGGCCATGCTGCTGCTCAAGCGGCAGCTCAGTCTGGACGCGCTGTGGCAGGAGCTGCTGG  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGGGTGGTGTCAGGGGCCATGCTGCTGCTCAAGCGGCAGCTCAGTCTGGACGCGCTGTGGCAGGAGCTGCTGG  370

Query  314  TGTCCAGCACGGTGGGGGCGGCTGCCGTCTCGGCGCTGGCCGGAGGCGCCCTCAACGGCGTCTTCGGCCGCCGC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGTCCAGCACGGTGGGGGCGGCTGCCGTCTCGGCGCTGGCCGGAGGCGCCCTCAACGGCGTCTTCGGCCGCCGC  444

Query  388  GCTGCCATCCTCCTGGCCAGTGCCCTCTTCACCGCCGGCTCCGCGGTGCTGGCTGCGGCCAACAACAAGGAGAC  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCTGCCATCCTCCTGGCCAGTGCCCTCTTCACCGCCGGCTCCGCGGTGCTGGCTGCGGCCAACAACAAGGAGAC  518

Query  462  ACTGCTCGCCGGCCGCCTGGTCGTGGGACTCGGCATCGGCATTGCTTCTATGACAGTGCCAGTGTACATTGCGG  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTGCTCGCCGGCCGCCTGGTCGTGGGACTCGGCATCGGCATTGCTTCTATGACAGTGCCAGTGTACATTGCGG  592

Query  536  AGGTCTCACCACCCAATTTAAGAGGCCGATTAGTCACCATTAATACCCTCTTCATCACAGGAGGGCAGTTCTTT  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGTCTCACCACCCAATTTAAGAGGCCGATTAGTCACCATTAATACCCTCTTCATCACAGGAGGGCAGTTCTTT  666

Query  610  GCAAGTGTTGTTGATGGAGCCTTCAGTTATCTCCAGAAGGATGGATGGAGGTACATGTTGGGACTTGCAGCAGT  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAAGTGTTGTTGATGGAGCCTTCAGTTATCTCCAGAAGGATGGATGGAGGTACATGTTGGGACTTGCAGCAGT  740

Query  684  TCCGGCGGTTATACAGTTTTTTGGCTTTCTCTTTTTGCCTGAAAGCCCTCGATGGCTTATTCAGAAAGGACAGA  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCGGCGGTTATACAGTTTTTTGGCTTTCTCTTTTTGCCTGAAAGCCCTCGATGGCTTATTCAGAAAGGACAGA  814

Query  758  CTCAGAAGGCCCGTAGAATTTTATCTCAGATGCGTGGTAACCAGACCATTGATGAGGAATATGATAGCATCAAA  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTCAGAAGGCCCGTAGAATTTTATCTCAGATGCGTGGTAACCAGACCATTGATGAGGAATATGATAGCATCAAA  888

Query  832  AACAACATTGAAGAGGAGGAAAAAGAGGTTGGCTCAGCTGGACCTGTGATCTGCAGAATGCTGAGTTATCCCCC  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AACAACATTGAAGAGGAGGAAAAAGAGGTTGGCTCAGCTGGACCTGTGATCTGCAGAATGCTGAGTTATCCCCC  962

Query  906  AACTCGCCGAGCTTTAATTGTGGGTTGTGGCCTACAAATGTTCCAGCAGCTCTCAGGCATTAACACCATCATGT  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AACTCGCCGAGCTTTAATTGTGGGTTGTGGCCTACAAATGTTCCAGCAGCTCTCAGGCATTAACACCATCATGT  1036

Query  980  ACTACAGTGCAACCATTCTGCAGATGTCTGGTGTTGAAGATGATAGACTTGCAATATGGCTGGCTTCAGTTACA  1053
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACTACAGTGCAACCATTCTGCAGATGTCTGGTGTTGAAGATGATAGACTTGCAATATGGCTGGCTTCAGTTACA  1110

Query 1054  GCCTTCACAAATTTCATTTTCACACTTGTGGGAGTCTGGCTTGTTGAGAAGGTGGGCCGCAGAAAGCTTACCTT  1127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCCTTCACAAATTTCATTTTCACACTTGTGGGAGTCTGGCTTGTTGAGAAGGTGGGCCGCAGAAAGCTTACCTT  1184

Query 1128  TGGTAGTTTAGCAGGTACCACCGTAGCACTCATTATTCTTGCCTTGGGATTTGTGCTATCAGCCCAAGTTTCCC  1201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGGTAGTTTAGCAGGTACCACCGTAGCACTCATTATTCTTGCCTTGGGATTTGTGCTATCAGCCCAAGTTTCCC  1258

Query 1202  CACGCATCACTTTTAAGCCAATAGCTCCGTCAGGTCAGAACGCCACTTGCACAAGATACAGTTACTGTAATGAA  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                
Sbjct 1259  CACGCATCACTTTTAAGCCAATAGCTCCGTCAGGTCAGAACGCCACTTGCACAAGATA----------------  1316

Query 1276  TGTATGTTGGATCCAGACTGCGGTTTCTGCTACAAGATGAACAAATCAACTGTCATTGACTCCTCCTGTGTTCC  1349
                                                                                      
Sbjct 1317  --------------------------------------------------------------------------  1316

Query 1350  AGTTAATAAAGCATCTACAAATGAGGCAGCCTGGGGCAGGTGTGAAAATGAAACCAAGTTCAAAACAGAAGATA  1423
                                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1317  ------------------------------------CAGGTGTGAAAATGAAACCAAGTTCAAAACAGAAGATA  1354

Query 1424  TATTTTGGGCTTACAATTTCTGCCCTACTCCATACTCCTGGACTGCACTTCTGGGCCTTATTTTATATCTTGTC  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1355  TATTTTGGGCTTACAATTTCTGCCCTACTCCATACTCCTGGACTGCACTTCTGGGCCTTATTTTATATCTTGTC  1428

Query 1498  TTCTTTGCACCTGGAATGGGACCAATGCCTTGGACTGTGAATTCTGAAATATATCCCCTTTGGGCAAGAAGTAC  1571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1429  TTCTTTGCACCTGGAATGGGACCAATGCCTTGGACTGTGAATTCTGAAATATATCCCCTTTGGGCAAGAAGTAC  1502

Query 1572  AGGAAATGCATGTTCATCTGGAATAAACTGGATTTTCAATGTCCTGGTTTCACTAACATTTTTACACACAGCAG  1645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1503  AGGAAATGCATGTTCATCTGGAATAAACTGGATTTTCAATGTCCTGGTTTCACTAACATTTTTACACACAGCAG  1576

Query 1646  AGTATCTTACATACTATGGAGCTTTCTTCCTCTATGCTGGATTTGCTGCTGTGGGACTCCTTTTCATCTATGGC  1719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1577  AGTATCTTACATACTATGGAGCTTTCTTCCTCTATGCTGGATTTGCTGCTGTGGGACTCCTTTTCATCTATGGC  1650

Query 1720  TGTCTTCCTGAGACCAAAGGCAAAAAATTAGAGGAAATTGAATCACTCTTTGACAACAGGCTATGTACATGTGG  1793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1651  TGTCTTCCTGAGACCAAAGGCAAAAAATTAGAGGAAATTGAATCACTCTTTGACAACAGGCTATGTACATGTGG  1724

Query 1794  CACTTCAGATTCTGATGAAGGGAGATATATTGAATATATTCGGGTAAAGGGAAGTAACTATCATCTTTCTGACA  1867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1725  CACTTCAGATTCTGATGAAGGGAGATATATTGAATATATTCGGGTAAAGGGAAGTAACTATCATCTTTCTGACA  1798

Query 1868  ATGATGCTTCTGATGTGGAA  1887
            ||||||||||||||||||||
Sbjct 1799  ATGATGCTTCTGATGTGGAA  1818