Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472243
• Subject: XM_006502055.2
• Aligned Length: 1137
• Identities: 848
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGGAGGGGAACAGGGATGAGGCTGAGAAATGTGTCGAGATCGCCCGGGAGGCCCTGAACGCCGGCAACCGCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGGCCCAGCGCTTCCTGCAGAAGGCCGAGAAGCTCTACCCACTGCCCTCGGCCCGCGCACTATTGGAAATAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTATGAAAAATGGAAGCACGGCTGGAAATAGCCCTCATTGCCGAAAACCATCAGGTAGTGGCGATCAAAGCAAG  222
              ||||||||.||.|||||.|||||||.||||.|.||||||||||||||..|.||.||..||||.||.||||||
Sbjct    1  --ATGAAAAACGGCAGCACCGCTGGAAGTAGCACGCATTGCCGAAAACCTCCTGGGAGCAGCGACCAGAGCAAG  72

Query  223  CCTAATTGCACAAAGGACAGCACATCTGGTAGTGGTGAAGGTGGAAAAGGCTATACCAAAGACCAAGTAGATGG  296
            ||.|..||...|||||||.||||.||||||..|||.|||||.||.||||.|||||||||||||||||||||.||
Sbjct   73  CCCAGCTGTGGAAAGGACGGCACTTCTGGTGCTGGGGAAGGCGGGAAAGTCTATACCAAAGACCAAGTAGAGGG  146

Query  297  AGTTCTCAGCATAAACAAATGTAAAAATTACTATGAAGTACTTGGAGTTACGAAAGATGCTGGTGATGAAGATT  370
            .||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  147  CGTGCTCAGCATAAACAAATGTAAAAATTACTACGAAGTCCTCGGAGTTACAAAAGATGCTGGTGATGAAGATT  220

Query  371  TGAAAAAAGCTTATAGAAAGCTTGCTTTGAAGTTTCATCCAGACAAAAACCATGCACCTGGAGCAACAGATGCT  444
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||
Sbjct  221  TGAAAAAAGCTTATAGGAAGCTTGCTTTGAAGTTTCATCCAGACAAAAACCACGCCCCTGGAGCCACGGATGCT  294

Query  445  TTTAAAAAGATTGGAAATGCTTATGCTGTTTTAAGTAATCCAGAAAAGCGAAAACAGTATGACCTCACGGGCAA  518
            ||.||||||||||||||.|||||.||.||..||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  295  TTCAAAAAGATTGGAAACGCTTACGCCGTCCTAAGCAATCCAGAGAAACGAAAACAGTATGACCTCACAGGCAG  368

Query  519  TGAAGAACAAGCATGTAACCACCAAAACAATGGCAGATTTAATTTCCATAGAGGTTGTGAAGCTGATATAACTC  592
            ||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||..|.||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct  369  TGAAGAGCAAGCCTGTAACCACCAGAACAACGGCAGGTTCAATTTCCACCGGGGCTGTGAGGCCGACATAACTC  442

Query  593  CAGAAGACTTGTTTAATATATTTTTTGGGGGTGGATTTCCTTCAGGTAGTGTACATTCTTTTTCAAATGGAAGA  666
            |.||||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.
Sbjct  443  CCGAAGACCTGTTCAATATCTTCTTTGGCGGTGGATTTCCTTCAGGTAGTGTACATTCATTTTCAAATGGCCGG  516

Query  667  GCTGGTTATAGCCAACAACATCAGCATCGACATAGTGGACATGAAAGAGAAGAGGAAAGAGGAGATGGAGGTTT  740
            ||||.|||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||..||||||||.||
Sbjct  517  GCTGCTTACAGCCATCAACATCAGCACCGACACAGTGGGCATGAAAGAGAAGAAGAAAGAGCGGATGGAGGCTT  590

Query  741  TTCTGTGTTTATCCAGCTGATGCCCATAATTGTATTGATCCTCGTGTCATTATTAAGCCAGTTGATGGTCTCTA  814
            .|||||.||.||.|||||.||||||||.|||||..|||||||.|||||.||.|||||||||.||||||||||.|
Sbjct  591  CTCTGTCTTCATTCAGCTCATGCCCATCATTGTGCTGATCCTTGTGTCCTTGTTAAGCCAGCTGATGGTCTCGA  664

Query  815  ATCCTCCTTATTCCTTATATCCCAGATCTGGAACTGGGCAAACTATTAAAATGCAAACAGAAAACTTGGGTGTT  888
            |.|||||.||.||||||||.||||||||||||.|.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  665  ACCCTCCGTACTCCTTATACCCCAGATCTGGATCAGGACAAACTATTAAAATGCAGACAGAAAACTTGGGTGTT  738

Query  889  GTTTATTATGTCAACAAGGACTTCAAAAATGAATATAAAGGAATGTTATTACAAAAGGTAGAAAAGAGTGTGGA  962
            ||||||||.||||..||||||||.||||..|||||||||||||...||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  739  GTTTATTACGTCAGTAAGGACTTTAAAAGCGAATATAAAGGAACACTATTACAAAAAGTAGAAAAGAGTGTGGA  812

Query  963  GGAAGATTATGTGACTAATATTCGAAATAACTGCTGGAAAGAAAGACAACAAAAAACAGATATGCAGTATGCAG  1036
            .||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AGAGGATTACGTGACTAATATTCGAAATAACTGCTGGAAAGAAAGACAGCAGAAAACAGATATGCAGTATGCAG  886

Query 1037  CAAAAGTATACCGTGATGATCGACTCCGAAGGAAGGCAGATGCCTTGAGCATGGACAACTGTAAAGAATTAGAG  1110
            |.|||||.|||||||||||.|..||.||.||||||||.||||||.||||||||||.|||||.||.||..|||||
Sbjct  887  CCAAAGTGTACCGTGATGAGCAGCTGCGGAGGAAGGCGGATGCCCTGAGCATGGAGAACTGCAAGGAGCTAGAG  960

Query 1111  CGGCTTACCAGTCTTTATAAAGGAGGA  1137
            |||||.||||||||.||.||.||.|||
Sbjct  961  CGGCTGACCAGTCTCTACAAGGGGGGA  987