Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472243
• Subject: XM_017008628.2
• Aligned Length: 1144
• Identities: 853
• Gaps: 278

Alignment

Query    1  ATGGAGGGGAACAGGGATGAGGCTGAGAAATGTGTCGAGATCGCCCGGGAGGCCCTGAACGCCGGCAACCGCGA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GAAGGCCCAGCGCTTCCTGCAGAAGGCCGAGAAGCTCTACCCACTGCCCTCGGCCCGCGCACTATTGGAAATAA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TTATGAAAAATGGAAGCACGGCTGGAAATAGCCCTCATTGCCGAAAACCATCAGGTAGTGGCGATCAAAGCAAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CCTAATTGCACAAAGGACAGCACATCTGGTAGTGGTGAAGGTGGAAAAGGCT-------ATACCAAAGACCAAG  289
                                                  |.|.|||.|||.||       ||||           
Sbjct    1  --------------------------------------ATGGGGAGAAGTCTTGCAATAATAC-----------  25

Query  290  TAGATGGAGTTCTCAGCATAAACAAATGTAAAAATTACTATGAAGTACTTGGAGTTACGAAAGATGCTGGTGAT  363
            |..||..|.|.|..|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   26  TGCATCCATTGCATAACATAAACAAATGTAAAAATTACTATGAAGTACTTGGAGTTACGAAAGATGCTGGTGAT  99

Query  364  GAAGATTTGAAAAAAGCTTATAGAAAGCTTGCTTTGAAGTTTCATCCAGACAAAAACCATGCACCTGGAGCAAC  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  100  GAAGATTTGAAAAAAGCTTATAGAAAGCTTGCTTTGAAGTTTCATCCAGACAAAAACCATGCACCTGGAGCAAC  173

Query  438  AGATGCTTTTAAAAAGATTGGAAATGCTTATGCTGTTTTAAGTAATCCAGAAAAGCGAAAACAGTATGACCTCA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  174  AGATGCTTTTAAAAAGATTGGAAATGCTTATGCTGTTTTAAGTAATCCAGAAAAGCGAAAACAGTATGACCTCA  247

Query  512  CGGGCAATGAAGAACAAGCATGTAACCACCAAAACAATGGCAGATTTAATTTCCATAGAGGTTGTGAAGCTGAT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  248  CGGGCAATGAAGAACAAGCATGTAACCACCAAAACAATGGCAGATTTAATTTCCATAGAGGTTGTGAAGCTGAT  321

Query  586  ATAACTCCAGAAGACTTGTTTAATATATTTTTTGGGGGTGGATTTCCTTCAGGTAGTGTACATTCTTTTTCAAA  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  322  ATAACTCCAGAAGACTTGTTTAATATATTTTTTGGGGGTGGATTTCCTTCAGGTAGTGTACATTCTTTTTCAAA  395

Query  660  TGGAAGAGCTGGTTATAGCCAACAACATCAGCATCGACATAGTGGACATGAAAGAGAAGAGGAAAGAGGAGATG  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  396  TGGAAGAGCTGGTTATAGCCAACAACATCAGCATCGACATAGTGGACATGAAAGAGAAGAGGAAAGAGGAGATG  469

Query  734  GAGGTTTTTCTGTGTTTATCCAGCTGATGCCCATAATTGTATTGATCCTCGTGTCATTATTAAGCCAGTTGATG  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  470  GAGGTTTTTCTGTGTTTATCCAGCTGATGCCCATAATTGTATTGATCCTCGTGTCATTATTAAGCCAGTTGATG  543

Query  808  GTCTCTAATCCTCCTTATTCCTTATATCCCAGATCTGGAACTGGGCAAACTATTAAAATGCAAACAGAAAACTT  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  544  GTCTCTAATCCTCCTTATTCCTTATATCCCAGATCTGGAACTGGGCAAACTATTAAAATGCAAACAGAAAACTT  617

Query  882  GGGTGTTGTTTATTATGTCAACAAGGACTTCAAAAATGAATATAAAGGAATGTTATTACAAAAGGTAGAAAAGA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  618  GGGTGTTGTTTATTATGTCAACAAGGACTTCAAAAATGAATATAAAGGAATGTTATTACAAAAGGTAGAAAAGA  691

Query  956  GTGTGGAGGAAGATTATGTGACTAATATTCGAAATAACTGCTGGAAAGAAAGACAACAAAAAACAGATATGCAG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  692  GTGTGGAGGAAGATTATGTGACTAATATTCGAAATAACTGCTGGAAAGAAAGACAACAAAAAACAGATATGCAG  765

Query 1030  TATGCAGCAAAAGTATACCGTGATGATCGACTCCGAAGGAAGGCAGATGCCTTGAGCATGGACAACTGTAAAGA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  766  TATGCAGCAAAAGTATACCGTGATGATCGACTCCGAAGGAAGGCAGATGCCTTGAGCATGGACAACTGTAAAGA  839

Query 1104  ATTAGAGCGGCTTACCAGTCTTTATAAAGGAGGA  1137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  840  ATTAGAGCGGCTTACCAGTCTTTATAAAGGAGGA  873