Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472305
• Subject: NM_001276358.1
• Aligned Length: 771
• Identities: 591
• Gaps: 111

Alignment

Query   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGGG  74
                                                                     |.||.|.|||      
Sbjct   1  ----------------------------------------------------------ATGAACCGCT------  10

Query  75  CCACCCTC-CAGG-------GCCCACTAAAAAAGCGCTGAAGCAG------CGATTCCTCAAGCTGCTGCCGTG  134
             .||||| ||||       |||           ||.||..||||      ||.|..|||.|.|.|.||  |||
Sbjct  11  --GCCCTCGCAGGTGCCGGAGCC-----------CGTTGGGGCAGGCAGCTCGGTCTCTCTACCAGTTG--GTG  69

Query 135  -CTGCGGGCCCCAAGCCCTGCCCTCAGTCAGTGAAAACAGCGTGGACGATGAATTTGAATTGTCCACCGTGTGT  207
            |||.|        .|.|||.|..|||         ||||||||||.|||||.||||||.|.|||||.|||||.
Sbjct  70  ACTGGG--------TCACTGTCGCCAG---------ACAGCGTGGAGGATGAGTTTGAACTATCCACGGTGTGC  126

Query 208  CACCGGCCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCGCAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCG  281
           ||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||||..||||||||||||||||||.|
Sbjct 127  CACCGGCCTGAGGGTCTGGAACAACTCCAGGAACAAACCAAGTTCACACGCAGAGAGTTGCAGGTCCTGTACAG  200

Query 282  GGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAATGAGGAGAACTTCAAGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTC  355
           .|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 201  AGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAACGAGGAGAACTTCAAGCAAATTTATTCTCAGTTCTTTC  274

Query 356  CTCAAGGAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCGGTCAGT  429
           |.||||||||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 275  CCCAAGGAGACTCCAGCAACTACGCTACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGACACCAACCATGATGGCTCTGTCAGT  348

Query 430  TTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGATGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAA  503
           ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||.||.||.|||||.|||||
Sbjct 349  TTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCAGTGATTCTTCGGGGAACCATAGATGATAGACTGAACTGGGCTTTCAA  422

Query 504  CCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAGGAAATGCTTGACATCATGAAGTCCATCTATGACA  577
           |.|.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423  CTTATATGACCTCAACAAGGATGGCTGTATCACGAAGGAGGAAATGCTCGACATCATGAAGTCCATCTATGACA  496

Query 578  TGATGGGCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAG  651
           ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497  TGATGGGCAAGTACACCTACCCTGCCCTCCGGGAGGAGGCCCCGAGGGAACACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAG  570

Query 652  ATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAAAAGGATGAGAACATCAT  725
           |||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 571  ATGGACAGAAACAAGGACGGCGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTCTTGTCAACAGGACGAGAACATCAT  644

Query 726  GAGGTCCATGCAGCTCTTTGACAATGTCATC  756
           ||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 645  GAGGTCCATGCAACTCTTTGATAATGTCATC  675