Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472305
• Subject: XM_006527469.2
• Aligned Length: 795
• Identities: 586
• Gaps: 144

Alignment

Query   1  ATGCGGGGCCAGGGCCGCAAGGAGAGTTTGTCCGATTCCCGAGACCTGGACGGCTCCTACGACCAGCTCACGGG  74
                                                                                |.|  
Sbjct   1  ---------------------------------------------------------------------ATG--  3

Query  75  CCACCCTCCAGGGCCCACTAAAAAAGCGCTGAA-------GCAG-----------------CGATTCCTCAAGC  124
             |||||   ||           |||.||||.|       ||.|                 |..||..|||||.
Sbjct   4  --ACCCT---GG-----------AAGGGCTGGAAATGGTGGCTGTACTTGTGGTCTTGGTTCTTTTTGTCAAGG  61

Query 125  TGCTGCCGTGCTGCGGGCCCCAAGCCC----TGCCCTC----AGTCAGT-------GAAAACAGCGTGGACGAT  183
           |.|||                  |..|    ||.||||    ||.|.||       |||.||||||||||.|||
Sbjct  62  TTCTG------------------GAACAATTTGGCCTCTTTGAGCCTGTCTCCTTGGAAGACAGCGTGGAGGAT  117

Query 184  GAATTTGAATTGTCCACCGTGTGTCACCGGCCTGAGGGTCTGGAGCAGCTGCAGGAGCAAACCAAATTCACGCG  257
           ||.||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 118  GAGTTTGAACTATCCACGGTGTGCCACCGGCCTGAGGGTCTGGAACAACTCCAGGAACAAACCAAGTTCACACG  191

Query 258  CAAGGAGTTGCAGGTCCTGTACCGGGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAATGAGGAGAACTTCA  331
           ||..||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 192  CAGAGAGTTGCAGGTCCTGTACAGAGGCTTCAAGAACGAATGTCCCAGCGGAATTGTCAACGAGGAGAACTTCA  265

Query 332  AGCAGATTTACTCCCAGTTCTTTCCTCAAGGAGACTCCAGCACCTATGCCACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGAC  405
           ||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 266  AGCAAATTTATTCTCAGTTCTTTCCCCAAGGAGACTCCAGCAACTACGCTACTTTTCTCTTCAATGCCTTTGAC  339

Query 406  ACCAACCATGATGGCTCGGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCCGTGATTCTTCGGGGAACTGTAGA  479
           |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||..||||
Sbjct 340  ACCAACCATGATGGCTCTGTCAGTTTTGAGGACTTTGTGGCTGGTTTGTCAGTGATTCTTCGGGGAACCATAGA  413

Query 480  TGACAGGCTTAATTGGGCCTTCAACCTGTATGACCTTAACAAGGACGGCTGCATCACCAAGGAGGAAATGCTTG  553
           |||.||.||.||.|||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|
Sbjct 414  TGATAGACTGAACTGGGCTTTCAACTTATATGACCTCAACAAGGATGGCTGTATCACGAAGGAGGAAATGCTCG  487

Query 554  ACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACGTACCCTGCACTCCGGGAGGAGGCCCCAAGGGAA  627
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 488  ACATCATGAAGTCCATCTATGACATGATGGGCAAGTACACCTACCCTGCCCTCCGGGAGGAGGCCCCGAGGGAA  561

Query 628  CACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGATGGTGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTC  701
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 562  CACGTGGAGAGCTTCTTCCAGAAGATGGACAGAAACAAGGACGGCGTGGTGACCATTGAGGAATTCATTGAGTC  635

Query 702  TTGTCAAAAGGATGAGAACATCATGAGGTCCATGCAGCTCTTTGACAATGTCATC  756
           |||||||.||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 636  TTGTCAACAGGACGAGAACATCATGAGGTCCATGCAACTCTTTGATAATGTCATC  690