Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472308
• Subject: XM_017007036.1
• Aligned Length: 1891
• Identities: 1731
• Gaps: 125

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGGCC----------GGC---------GCTCGGGCCGCCG  22
                                             ||.|||          |||         ||||.||||..|.
Sbjct    1  ATGGCAGCGGGACCGGCGGCTCTAAGTCGTCTTATCGCCAGACCTGGAGGGCTTCCTGTCAGCTCAGGCCATCC  74

Query   23  CCGCC----------GCTGCCTCGGCGGGGTCCTCGGCCTCTTCAGGC--AACCAGCCGCCTCAGGAGCT----  80
            ||.||          ||||.|...||||     |.||..||||   ||  |.||.|||..||||     |    
Sbjct   75  CCACCCTAAGCACTGGCTGGCAGTGCGG-----TGGGAATCTT---GCCGACCCTGCCATCTCA-----TTCCC  135

Query   81  ----GGGGCTTGGGGAGCT---GCTGGAGGAGTTCTCC---CGGACTCAGTACC-----GGGCCAAGGATGGCA  139
                |.||.||.||.||||   ||...|  ||||.|||   .|.|.||.||.||     |..|||       ||
Sbjct  136  CCACGTGGTTTTGGCAGCTTTAGCACCA--AGTTTTCCAGTGGAATTCTGTTCCATCCTGCACCA-------CA  200

Query  140  G----CGG----GACCGGCGGCTC------TAAGGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCC  199
            |    |.|    |||      |||      ||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  GAACTCTGATTTGAC------CTCAGAGATTACCGTTGAGCGCATTGAGAAGAGATGTCTGGAGCTGTTTGGCC  268

Query  200  GAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTC  273
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  GAGACTACTGTTTCAGCGTGATTCCAAACACGAATGGGGATATCTGTGGCCACTATCCCCGGCACATCGTGTTC  342

Query  274  CTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCT  347
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  CTGGAGTATGAGAGTTCTGAGAAGGAGAAAGACACGTTTGAGAGTACCGTACAGGTGAGCAAGTTGCAAGACCT  416

Query  348  CATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACA  421
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CATCCACCGCAGCAAGATGGCCCGGTGCAGAGGACGGTTTGTCTGCCCAGTAATCCTGTTCAAGGGCAAGCACA  490

Query  422  TTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGG  495
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  TTTGCAGGTCGGCCACACTGGCTGGATGGGGAGAGCTGTATGGACGCTCAGGCTACAACTATTTTTTCTCAGGG  564

Query  496  GGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCA  569
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GGTGCAGATGATGCCTGGGCAGATGTGGAGGACGTCACGGAGGAGGACTGTGCTCTTCGAAGTGGTGACACGCA  638

Query  570  TCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGA  643
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  TCTTTTTGATAAGGTCAGAGGCTATGACATCAAGCTGCTTCGATACCTGTCAGTCAAATACATCTGTGACCTGA  712

Query  644  TGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTAT  717
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  TGGTGGAGAACAAGAAGGTGAAGTTTGGCATGAATGTAACCTCCTCTGAGAAGGTGGACAAAGCCCAGCGCTAT  786

Query  718  GCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACAT  791
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  GCCGACTTCACTCTCCTCTCCATCCCGTATCCAGGCTGTGAATTTTTCAAGGAATATAAAGATCGGGATTACAT  860

Query  792  GGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTC  865
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  GGCAGAAGGGCTCATATTTAACTGGAAGCAGGACTACGTTGATGCCCCATTGAGCATCCCCGACTTCCTGACTC  934

Query  866  ACTCTCTGAACATTGACTGGAGCCAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTG  939
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  ACTCTCTGAACATTGACTGGAGCCAGTATCAGTGTTGGGATCTGGTGCAACAAACACAAAACTACCTGAAGCTG  1008

Query  940  CTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCC  1013
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  CTGCTTTCCTTAGTTAACAGTGATGATGACAGCGGGCTGCTGGTACACTGTATCTCAGGCTGGGATCGGACCCC  1082

Query 1014  CCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGA  1087
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  CCTCTTCATCTCCCTCCTGCGCCTTTCCTTGTGGGCTGATGGGCTCATCCACACGTCCCTGAAGCCCACTGAGA  1156

Query 1088  TCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAG  1161
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  TCCTCTACCTCACTGTGGCCTATGACTGGTTCCTCTTCGGGCACATGTTGGTAGATCGGCTCAGCAAAGGGGAG  1230

Query 1162  GAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAG  1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  GAGATTTTCTTCTTCTGCTTCAATTTTTTGAAGCATATTACCTCCGAGGAGTTCTCTGCTCTGAAGACCCAGAG  1304

Query 1236  GAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTG  1309
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  GAGGAAGAGTTTGCCAGCCCGGGATGGAGGCTTCACCCTGGAAGACATCTGCATGCTGAGACGAAAGGACCGTG  1378

Query 1310  GCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACC  1383
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  GCAGCACCACCAGCCTTGGCAGCGACTTCTCCCTGGTCATGGAGAGTTCCCCAGGAGCCACTGGGAGCTTCACC  1452

Query 1384  TATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCC  1457
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  TATGAGGCCGTGGAGCTGGTCCCAGCAGGAGCGCCAACTCAGGCAGCTTGGAGGAAGAGCCACTCATCCTCTCC  1526

Query 1458  ACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGCCACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCA  1531
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  ACAGAGTGTCCTCTGGAACCGGCCACAACCCTCAGAGGACCGCTTGCCTTCCCAGCAGGGGCTGGCGGAAGCCA  1600

Query 1532  GGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCAAACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCC  1605
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601  GGTCTTCCAGCTCCTCTTCCTCAAACCATTCTGATAACTTTTTCAGGATGGGTAGCAGTCCCCTGGAGGTCCCC  1674

Query 1606  AAACCCAGGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTA  1679
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675  AAACCCAGGCTTGCAGCCCTGAGTGATCGAGAGACTCGGCTGCAGGAGGTGCGCTCAGCCTTCTTGGCTGCGTA  1748

Query 1680  CAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTG  1753
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1749  CAGCAGCACAGTGGGGCTTCGGGCAGTAGCCCCCAGTCCTTCCGGTGCCATCGGGGGCCTGCTGGAGCAATTTG  1822

Query 1754  CCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1794
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1823  CCCGTGGTGTTGGACTCCGGAGCATCAGCAGCAATGCCTTG  1863