Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472315
• Subject: XM_011246431.2
• Aligned Length: 1332
• Identities: 1188
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGTCCAGCTCCTACGATGAGGCCTCACTGGCGCCAGAGGAGACCACCGACAGCTTCTGGGAGGTGGGGAACTA  74
            |||||..||||||||||||||||||         |||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGGCTCCTACGATGAGGCCT---------CAGAGGAGATCACAGATAGCTTCTGGGAGGTGGGGAACTA  65

Query   75  CAAGCGGACCGTGAAGCGCATCGATGACGGCCACCGTCTATGCAACGACCTGATGAACTGCGTGCAGGAGCGCG  148
            |||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct   66  CAAGCGGACGGTGAAGCGCATCGACGATGGGCACCGCCTGTGCAACGACCTCATGAGCTGCGTGCAGGAGCGCG  139

Query  149  CCAAGATCGAGAAGGCGTACGGGCAGCAGCTCACCGACTGGGCCAAGCGTTGGCGCCAGCTCATCGAGAAAGGC  222
            ||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  140  CCAAGATCGAGAAGGCATACGCGCAGCAGCTCACCGACTGGGCCAAGCGCTGGCGCCAGCTCATCGAGAAAGGT  213

Query  223  CCACAGTATGGCAGCCTGGAGCGGGCCTGGGGTGCCATAATGACAGAGGCAGACAAGGTGAGCGAGCTGCACCA  296
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  214  CCTCAGTATGGCAGCCTGGAGCGGGCGTGGGGCGCCATGATGACAGAAGCAGATAAGGTCAGCGAGCTGCACCA  287

Query  297  GGAGGTGAAGAACAATCTGCTGAATGAGGACCTGGAGAAGGTGAAGAACTGGCAGAAGGACGCCTATCACAAGC  370
            ||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  288  GGAGGTGAAGAACAGCCTGCTGAATGAGGACCTGGAGAAAGTCAAGAACTGGCAGAAGGATGCCTATCACAAGC  361

Query  371  AGATCATGGGTGGCTTCAAGGAGACGAAGGAGGCTGAAGATGGCTTCCGCAAGGCCCAGAAGCCTTGGGCCAAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.
Sbjct  362  AGATCATGGGTGGCTTCAAGGAGACGAAAGAGGCCGAGGATGGCTTCCGAAAGGCCCAGAAGCCCTGGGCTAAA  435

Query  445  AAGATGAAGGAGCTGGAGGCAGCCAAGAAGGCCTACCATTTGGCTTGCAAAGAGGAAAAGCTGGCCATGACACG  518
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||.||||||||||||.||
Sbjct  436  AAGATGAAGGAGCTAGAGGCGGCCAAGAAGGCCTATCACTTGGCTTGTAAGGAGGAAAGGCTGGCCATGACCCG  509

Query  519  GGAGATGAACAGCAAGACGGAGCAATCGGTCACACCTGAGCAGCAAAAGAAGCTGCAGGACAAAGTGGACAAGT  592
            ||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.||...|||||||||||||||.|
Sbjct  510  GGAGATGAACAGTAAGACAGAGCAGTCGGTCACCCCTGAACAGCAGAAGAAACTTGTGGACAAAGTGGACAAAT  583

Query  593  GCAAGCAGGATGTGCAGAAGACACAGGAGAAGTATGAGAAAGTGCTGGAAGATGTGGGCAAGACCACACCCCAG  666
            |||..|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  584  GCAGACAGGATGTGCAAAAGACTCAGGAGAAGTATGAGAAGGTGCTGGAAGATGTGGGCAAGACCACACCACAG  657

Query  667  TACATGGAGAACATGGAGCAGGTGTTTGAGCAATGCCAGCAATTTGAGGAAAAGCGGCTGGTCTTCCTCAAGGA  740
            |||||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct  658  TACATGGAGGGCATGGAGCAGGTGTTTGAGCAGTGCCAGCAGTTTGAGGAGAAGCGGCTGGTCTTCCTGAAGGA  731

Query  741  GGTGCTGCTGGACATCAAACGGCACCTCAACCTGGCTGAGAACAGCAGCTACATCCATGTGTACCGTGAGCTGG  814
            .||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct  732  AGTCCTGCTGGATATCAAACGGCATCTCAACCTAGCGGAGAACAGCAGCTACATGCATGTCTACCGAGAACTGG  805

Query  815  AGCAGGCCATCCGGGGGGCTGATGCCCAGGAAGACCTCAGATGGTTCCGCAGCACCAGTGGCCCCGGCATGCCC  888
            |||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  806  AGCAGGCCATCCGGGGGGCCGATGCCCAGGAGGACCTCAGGTGGTTCCGCAGCACCAGTGGCCCCGGGATGCCC  879

Query  889  ATGAACTGGCCCCAGTTTGAGGAGTGGAACCCAGACCTTCCTCACACCACCACCAAGAAGGAGAAACAGCCTAA  962
            |||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||..||||||||||||||||||||||
Sbjct  880  ATGAACTGGCCGCAGTTCGAGGAGTGGAACCCAGACCTCCCGCACACCACTGCCAAGAAGGAGAAACAGCCTAA  953

Query  963  GAAGGCAGAGGGAGTGGCGCTGACCAATGCCACTGGGGCGGTAGAGTCCACATCCCAGGCTGGGGACCGCGGCA  1036
            ||||||||||||.|...|.||||.|||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  954  GAAGGCAGAGGGGGCCACCCTGAGCAATGCCACTGGGGCTGTAGAATCCACATCCCAGGCTGGGGACCGTGGCA  1027

Query 1037  GTGTTAGCAGCTACGACAGAGGCCAGCCCTACGCCACCGAGTGGTCAGACGACGAGAGTGGGAACCCCTTTGGG  1110
            |||||||||||||.|||.|||||||..|.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||
Sbjct 1028  GTGTTAGCAGCTATGACCGAGGCCAAACATATGCCACCGAGTGGTCAGACGATGAGAGCGGAAACCCCTTCGGG  1101

Query 1111  GGCAGTGAGACCAACGGGGGCGCCAACCCCTTTGAGGACGACTCCAAGGGAGTGCGCGTGCGGGCACTCTACGA  1184
            ||||.||||.||||.||.||||||||||||||.|||||.||..||||||||||.||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1102  GGCAATGAGGCCAATGGTGGCGCCAACCCCTTCGAGGATGATGCCAAGGGAGTTCGTGTACGGGCACTCTATGA  1175

Query 1185  CTATGACGGCCAGGAGCAGGACGAGCTCAGCTTTAAGGCCGGAGACGAACTCACCAAGCTGGGCGAGGAGGATG  1258
            |||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1176  CTACGACGGTCAGGAGCAGGATGAGCTCAGCTTCAAGGCCGGAGATGAGCTCACCAAGCTCGGAGAGGAAGACG  1249

Query 1259  AGCAGGGCTGGTGCCGTGGGCGGCTGGACAGCGGGCAGCTGGGCCTCTACCCTGCCAACTACGTGGAGGCTATC  1332
            |.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1250  AACAGGGTTGGTGCCGCGGGCGGCTGGACAGCGGACAGCTGGGCCTCTATCCTGCCAACTACGTTGAGGCTATA  1323