Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472321
• Subject: XM_011521358.1
• Aligned Length: 1182
• Identities: 1144
• Gaps: 36

Alignment

Query    1  ---------------------------------ATGTTTTGGACGTTTAAAGAATGGTTCTGGTTGGAAAGATT  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTTCACACCACTGCCAGAAGAGCTGCCAGAATGTTTTGGACGTTTAAAGAATGGTTCTGGTTGGAAAGATT  74

Query   42  CTGGCTTCCTCCAACAATAAAGTGGTCAGATCTTGAGGATCACGATGGACTCGTCTTTGTAAAACCTTCTCATT  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTGGCTTCCTCCAACAATAAAGTGGTCAGATCTTGAGGATCACGATGGACTCGTCTTTGTAAAACCTTCTCATT  148

Query  116  TATACGTGACAATTCCATATGCTTTTCTCTTGCTGATTATCAGGCGTGTATTTGAAAAATTTGTTGCTTCACCT  189
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TATACGTGACAATTCCATATGCTTTTCTCTTGCTGATTATCAGACGTGTATTTGAAAAATTTGTTGCTTCACCT  222

Query  190  CTAGCAAAATCATTTGGCATTAAAGAGACAGTTCGAAAGGTTACACCAAATACTGTCTTAGAGAATTTTTTCAA  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTAGCAAAATCATTTGGCATTAAAGAGACAGTTCGAAAGGTTACACCAAATACTGTCTTAGAGAATTTTTTCAA  296

Query  264  ACATTCCACAAGGCAACCATTGCAAACTGATATTTATGGACTGGCAAAGAAGTGTAACTTGACGGAGCGCCAGG  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ACATTCCACAAGGCAACCATTGCAAACTGATATTTATGGACTGGCAAAGAAGTGTAACTTGACGGAGCGCCAGG  370

Query  338  TGGAAAGATGGTTTAGGAGTCGGCGGAATCAAGAGAGGCCTTCCAGGCTGAAGAAATTCCAGGAAGCTTGCTGG  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGAAAGATGGTTTAGGAGTCGGCGGAATCAAGAGAGGCCTTCCAGGCTGAAGAAATTCCAGGAAGCTTGCTGG  444

Query  412  AGATTTGCATTTTACT---TGATCACTGTTGCTGGAATTGCGTTTCTTTATGATAAACCTTGGCTATATGACTT  482
            ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGATTTGCATTTTACTTAATGATCACTGTTGCTGGAATTGCGTTTCTTTATGATAAACCTTGGCTATATGACTT  518

Query  483  ATGGGAGGTTTGGAATGGCTATCCCAAACAGCCCCTGCTGCCATCCCAGTACTGGTACTACATTTTAGAAATGA  556
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ATGGGAGGTTTGGAATGGCTATCCCAAACAGCCCCTGCTGCCATCCCAGTACTGGTACTACATTTTAGAAATGA  592

Query  557  GTTTTTATTGGTCTCTGTTATTTAGACTTGGCTTTGATGTCAAGAGAAAGGATTTTCTAGCTCATATCATCCAC  630
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTTTTTATTGGTCTCTGTTATTTAGACTTGGCTTTGATGTCAAGAGAAAGGATTTTCTAGCTCATATCATCCAC  666

Query  631  CACCTGGCTGCTATTAGTCTGATGAGCTTCTCTTGGTGTGCTAATTATATTCGCAGTGGGACCCTCGTGATGAT  704
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACCTGGCTGCTATTAGTCTGATGAGCTTCTCTTGGTGTGCTAATTATATTCGCAGTGGGACCCTCGTGATGAT  740

Query  705  TGTACACGATGTGGCTGACATTTGGCTGGAGTCTGCTAAGATGTTTTCTTATGCTGGATGGACGCAGACCTGTA  778
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTACACGATGTGGCTGACATTTGGCTGGAGTCTGCTAAGATGTTTTCTTATGCTGGATGGACGCAGACCTGTA  814

Query  779  ACACCCTGTTTTTCATCTTCTCCACCATATTTTTCATCAGCCGCCTCATTGTTTTTCCTTTCTGGATTTTATAT  852
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACACCCTGTTTTTCATCTTCTCCACCATATTTTTCATCAGCCGCCTCATTGTTTTTCCTTTCTGGATTTTATAT  888

Query  853  TGCACGCTGATCTTGCCTATGTATCACCTCGAGCCTTTCTTTTCATACATCTTCCTCAACCTACAGCTCATGAT  926
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCACGCTGATCTTGCCTATGTATCACCTCGAGCCTTTCTTTTCATACATCTTCCTCAACCTACAGCTCATGAT  962

Query  927  CTTGCAGGTCCTTCACCTTTACTGGGGTTATTACATCTTGAAGATGCTCAACAGATGTATATTCATGAAGAGCA  1000
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTGCAGGTCCTTCACCTTTACTGGGGTTATTACATCTTGAAGATGCTCAACAGATGTATATTCATGAAGAGCA  1036

Query 1001  TCCAGGATGTGAGGAGTGATGACGAGGATTATGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGCTACCAAAGGC  1074
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCCAGGATGTGAGGAGTGATGACGAGGATTATGAAGAGGAAGAGGAAGAGGAAGAAGAAGAGGCTACCAAAGGC  1110

Query 1075  AAAGAGATGGATTGTTTAAAGAACGGCCTCGGGGCTGAGAGGCACCTCATTCCCAATGGCCAGCATGGCCAT  1146
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGAGATGGATTGTTTAAAGAACGGCCTCAGGGCTGAGAGGCACCTCATTCCCAATGGCCAGCATGGCCAT  1182