Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000472351
Subject:
NM_175362.2
Aligned Length:
3472
Identities:
2983
Gaps:
45

Alignment

Query    1  ---------------------ATGGATGACTACATGGAGACGCTGAAGGATGAAGAGGACGCCTTGTGGGAGAA  53
                                 ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|||||.||
Sbjct    1  ATGCCAGGAGGAGGGCCAGCTATGGATGACTACATGGAGACGCTGAAGGATGAAGAGGAGGCCCTATGGGATAA  74

Query   54  TGTGGAGTGTAACCGGCACATGCTCAGCCGCTATATCAACCCTGCCAAGCTCACGCCCTACCTGCGTCAGTGTA  127
            .|||||.||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|
Sbjct   75  CGTGGAATGCAACCGGCACATGCTGAGCCGTTACATCAACCCCGCCAAGCTCACCCCCTACCTGCGCCAGTGCA  148

Query  128  AGGTCATTGATGAGCAGGATGAAGATGAAGTGCTTAATGCCCCTATGCTGCCATCCAAGATCAACCGAGCAGGC  201
            |||||||.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||
Sbjct  149  AGGTCATCGATGAGCAAGATGAAGACGAGGTGCTCAATGCGCCCATGCTGCCGTCCAAGATCAACCGTGCAGGC  222

Query  202  CGGCTGTTGGACATTCTACATACCAAGGGGCAAAGGGGCTATGTGGTCTTCTTGGAGAGCCTAGAATTTTATTA  275
            ||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||.||.|||||.||
Sbjct  223  CGATTGTTGGACATTCTTCACACCAAGGGACAAAGGGGCTATGTGGTCTTCCTGGAGAGCCTGGAGTTTTACTA  296

Query  276  CCCAGAACTGTACAACTTGGTGACTGGGAAAGAGCCCACTCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC  349
            |||||||||.|||||..||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCCAGAACTTTACAAACTGGTGACTGGAAAGGAACCCACCCGGAGATTCTCCACCATTGTGGTGGAGGAAGGCC  370

Query  350  ACGAGGGCCTCACGCACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAGCTGCAGCAGCAGATGAAGGCCAAGGACCTGCAA  423
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||.|||||||||||.||.
Sbjct  371  ATGAGGGCCTCACACACTTCCTGATGAACGAGGTCATCAAACTGCAGCAGCAAGTGAAAGCCAAGGACCTTCAG  444

Query  424  CGCTGCGAGCTGCTGGCCAGGTTGCGGCAGCTGGAGGATGAGAAGAAGCAGATGACGCTGACGCGCGTGGAGCT  497
            |||||.|||||||||||||.||..|||||.|||||||||||||||||||||.|||..||||..||.||||||||
Sbjct  445  CGCTGTGAGCTGCTGGCCAAGTCCCGGCAACTGGAGGATGAGAAGAAGCAGCTGAGCCTGATACGGGTGGAGCT  518

Query  498  GCTAACCTTCCAGGAGCGGTACTACAAGATGAAGGAAGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTGGTCAAGGTGA  571
            |||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  519  GCTGACCTTCCAGGAGCGATACTACAAGATGAAGGAGGAGCGGGACAGCTACAATGACGAGCTCGTCAAGGTCA  592

Query  572  AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCACAGCTCAGTGAGGAGAAGAACATGGCGGTCATGAGGAGC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  593  AGGACGACAACTACAACTTAGCCATGCGCTACGCCCAGCTCAGTGAGGAGAAAAACATGGCGGTGATGAGGAGC  666

Query  646  CGAGACCTCCAACTCGAGATCGATCAGCTAAAGCACCGGTTGAATAAGATGGAGGAGGAATGTAAGCTGGAGAG  719
            ||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||..||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  CGCGACCTCCAACTCGAGATCGACCAGCTCAAACACCGACTGAACAAGATGGAGGAGGAATGCAAGCTGGAGAG  740

Query  720  AAATCAGTCTCTAAAACTGAAGAATGACATTGA-AATCGGCCCAAG-ATGAGCAG--TCTGGAACTGGAGCGGG  789
            |||||||||.||.||.||.|||||||||||.|| ||.|||||||.| |.||||||  .|||||.||||||| ||
Sbjct  741  AAATCAGTCCCTCAAGCTCAAGAATGACATCGAGAACCGGCCCAGGAAGGAGCAGGTCCTGGAGCTGGAGC-GG  813

Query  790  GAGAATGAAATGCTGAAGACCAAAAACCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCCGGGAAGCGCAGCCTGCCAGA  863
            ||||||||.|||||||||||.||||..||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||
Sbjct  814  GAGAATGAGATGCTGAAGACGAAAATTCAGGAGCTGCAGTCCATCATCCAGGCTGGCAAGCGCAGCCTCCCTGA  887

Query  864  CTCAGACAAGGCCATCCTGGACATCTTGGAACACGACCGCAAGGAGGCCCTGGAGGACAGGCAGGAGCTGGTCA  937
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|||||||.|||||||
Sbjct  888  CTCAGACAAGGCCATCTTGGACATCCTGGAACATGACCGGAAGGAGGCGCTAGAGGACCGGCAGGAACTGGTCA  961

Query  938  ACAGGATCTACAACCTGCAGGAGGAGGCCCGCCAGGCAGAGGAGCTGCGAGACAAGTACCTGGAGGAGAAGGAG  1011
            |||..||.||||||||.||.|||||.|.|||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct  962  ACAAAATTTACAACCTACAAGAGGAAGTCCGCCAGGCGGAGGAGCTGCGGGATAAGTACCTGGAGGAGAAGGAA  1035

Query 1012  GACCTGGAGCTCAAGTGCTCGACCCTGGGAAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACGGTCATGCT  1085
            ||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1036  GACCTGGAACTCAAGTGTTCAACCCTGGGGAAGGACTGTGAAATGTACAAGCACCGCATGAACACAGTTATGCT  1109

Query 1086  GCAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAAGCTCAGACACAGTACTCGC  1159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 1110  GCAGCTGGAGGAGGTGGAGCGGGAGCGGGACCAGGCCTTCCACTCCCGAGATGAGGCACAGACACAGTACTCAC  1183

Query 1160  AGTGCTTAATCGAAAAGGACAAGTACAGGAAGCAGATCCGCGAGCTGGAGGAGAAGAACGACGAGATGAGGATC  1233
            |||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.||.
Sbjct 1184  AGTGCTTAATCGAGAAGGACAAGTACCGGAAGCAGATCCGGGAGCTGGAGGAGAAGAACGATGAGATGCGTATT  1257

Query 1234  GAGATGGTGCGGCGGGAGGCCTGCATCGTCAACCTGGAGAGCAAGCTGCGGCGCCTCTCCAAGGACAGCAACAA  1307
            |||||||||.||.||||||||||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||.|..||.
Sbjct 1258  GAGATGGTGAGGAGGGAGGCCTGTATTGTCAACCTGGAAAGCAAGCTCCGGCGCCTGTCCAAGGACAACGGCAG  1331

Query 1308  CCTGGACCAGAGTCTGCCCAGGAACCTGCCAGTAACCATCATCTCTCAGGACTTTGGGGATGCCAGCCCCAGGA  1381
            |||.||||||||||||||.||..||||.||||..|||||||||||.|||.||.||||.||..||||||||||||
Sbjct 1332  CCTCGACCAGAGTCTGCCTAGACACCTTCCAGCCACCATCATCTCACAGAACCTTGGAGACACCAGCCCCAGGA  1405

Query 1382  CCAATGGTCAAGAAGCTGACGATTCTTCCACCTCGGAGGAGTCACCTGAAGACAGCAAGTACTTCCTGCCCTAC  1455
            |||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1406  CCAATGGCCAGGAAGCTGATGATTCTTCAACCTCAGAAGAGTCTCCCGAAGACAGCAAGTACTTTCTGCCTTAC  1479

Query 1456  CATCCGCCCCAGCGCAGGATGAACCTGAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCCTGAAGCG  1529
            ||.||.||||.||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.
Sbjct 1480  CACCCACCCCGGCGCCGGATGAACCTAAAGGGCATCCAGCTGCAGAGAGCCAAATCCCCCATCAGCATGAAGCA  1553

Query 1530  AACATCAGATTTTCAAGCCAAGGGGCACGAGGAAGAAGGCACGGACGCCAGCCCTAGCTCCTGCGGATCTCTGC  1603
            |.||||.||.|||||||.||||||||||||.||.||...|||.||||.||||||.||.||||.|.|.||.||||
Sbjct 1554  AGCATCTGAGTTTCAAGTCAAGGGGCACGAAGAGGATTTCACAGACGGCAGCCCCAGTTCCTCCCGCTCGCTGC  1627

Query 1604  CCATCACCAACTCCTTCACCAAGATGCAGCCCCCCCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACCGCCGAGCCC  1677
            |..||||||.|||.|||.||||||||||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 1628  CTGTCACCAGCTCTTTCTCCAAGATGCAACCCCATCGGAGCCGCAGCAGCATCATGTCAATCACGGCAGAGCCC  1701

Query 1678  CCGGGAAACGACTCCATCGTCAGACGCTACAAGGAGGACGCGCCCCATCGCAGCACAGTCGAAGAAGACAATGA  1751
            ||||||||.||||||||.||||||||||..|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.||
Sbjct 1702  CCGGGAAATGACTCCATAGTCAGACGCTGTAAGGAAGATGCGCCACACCGGAGCACGGTGGAAGAAGACAACGA  1775

Query 1752  CAGCGGCGGGTTTGACGCCTTAGATCTGGATGATGACAGTCACGAACGCTACTCCTTCGGACCCTCCTCCATCC  1825
            .|||.|.||||||||.||||||||.||.||.|||||.|.|||||||||.||.|||||.|||||..|||||||||
Sbjct 1776  TAGCTGTGGGTTTGATGCCTTAGACCTTGACGATGAAAATCACGAACGTTATTCCTTTGGACCTCCCTCCATCC  1849

Query 1826  ACTCCTCCTCCTCCTCCCACCAATCCGAGGGCCTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTCAGG  1899
            |||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.
Sbjct 1850  ACTCCTCCTCCTCTTCACACCAGTCAGAGGGACTGGATGCCTACGACCTGGAGCAGGTCAACCTCATGTTACGA  1923

Query 1900  AAGTTCTCTCTGGAAAGACCCTTCCGGCCTTCGGTCACCTCTGTGGGGCACGTGCGGGGCCCAGGGCCCTCGGT  1973
            |||||||||.|||||||.|||||||||||.||||||||.||||.|||.||||||||||||.|.|||||||.|||
Sbjct 1924  AAGTTCTCTTTGGAAAGGCCCTTCCGGCCATCGGTCACATCTGGGGGTCACGTGCGGGGCACCGGGCCCTTGGT  1997

Query 1974  GCAGCACACGACGCTGAATGGCGACAGCCTCACCTCCCAGCTCACCCTGCTGGGGGGCAACGCGCGAGGGAGCT  2047
            .||||||||.||.|||||||||||..|.||||.|.|.|||||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 1998  CCAGCACACAACTCTGAATGGCGATGGGCTCATCACGCAGCTCACCCTTCTGGGCGGCAATGCACGCGGGAGCT  2071

Query 2048  TCGTGCACTCGGTCAAGCCTGGCTCTCTGGCCGAGAAAGCCGGCCTCCGTGAGGGCCACCAGCTGCTGCTGCTA  2121
            ||.|.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||..|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 2072  TCATTCACTCTGTCAAGCCAGGCTCACTGGCTGAGAGGGCCGGACTGCGTGAGGGCCACCAACTCCTGCTGCTG  2145

Query 2122  GAAGGCTGCATCCGAGGCGAGAGGCAGAGTGTCCCGTTGGACACATGCACCAAAGAGGAAGCCCACTGGACCAT  2195
            |||||.||||||||||||||.||||||||.||.||..||||..|.|||||.|||||.||.||||..||||||||
Sbjct 2146  GAAGGTTGCATCCGAGGCGAAAGGCAGAGCGTTCCACTGGATGCGTGCACAAAAGAAGAGGCCCGTTGGACCAT  2219

Query 2196  CCAGAGGTGCAGCGGCCCCGTCACGCTGCACTACAAGGTCAACCACGAAGGGTACCGGAAGCTGGTGAAGGACA  2269
            ||||||||||||.||||.|.||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.|
Sbjct 2220  CCAGAGGTGCAGTGGCCTCATCACTCTGCATTACAAGGTCAACCATGAAGGATACCGGAAGCTGCTGAAGGAGA  2293

Query 2270  TGGAGGACGGCCTGATCACATCGGGGGACTCGTTCTACATCCGGCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGAC  2343
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 2294  TGGAGGATGGTCTGATCACATCAGGGGACTCGTTCTATATCCGCCTGAACCTGAACATCTCCAGCCAGCTGGAT  2367

Query 2344  GCCTGCACCATGTCCCTGAAGTGTGACGATGTTGTGCACGTCCGTGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTG  2417
            ||||||.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2368  GCCTGCTCCATGTCCCTCAAGTGTGACGACGTGGTGCATGTCCTAGACACCATGTACCAGGACAGGCACGAGTG  2441

Query 2418  GCTGTGCGCGCGGGTCGACCCTTTCACAGACCATGACCTGGATATGGGCACCATACCCAGCTACAGCCGAGCCC  2491
            ||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.|.|||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct 2442  GCTGTGTGCACGAGTCGACCCCTTCACTGACCAAGACCTGGACACGGGCACCATCCCCAGCTACAGCCGGGCTC  2515

Query 2492  AGCAGCTCCTCCTGGTGAAACTGCAGCGCCTGATGCACCGAGGCAGCCGGGAGGAGGTAGACGGCACCCACCAC  2565
            |.|||||.|||||||||||.||.|||||..||.|.|||.||||||.||||||.||||.||||.||.|.||||||
Sbjct 2516  AACAGCTTCTCCTGGTGAAGCTCCAGCGGTTGGTTCACAGAGGCAACCGGGAAGAGGCAGACAGCGCTCACCAC  2589

Query 2566  ACCCTGCGGGCA--CTCCGGAACACCCTGCAGCCGGAAGAAGCGCTTTCAACAAGCGACCCCCGGGTCAG-CCC  2636
            |||||||  |||  ||||||||||||||||||||.|||||...||||||.||.|||||||||||.||||| |||
Sbjct 2590  ACCCTGC--GCAGCCTCCGGAACACCCTGCAGCCCGAAGAGATGCTTTCGACGAGCGACCCCCGAGTCAGCCCC  2661

Query 2637  CGTTTCTCGGGAGCAAGCTCCTT-TTTGCCCAGCTCCTTCAGTTCGTCAG-CAGTCGAGAAAACAAGTATAAGC  2708
            ||..||||..||||.||.|.||| ||||.|||||||||.|||||.||||| |.||| ||||||||||||.||..
Sbjct 2662  CGCCTCTCCAGAGCGAGTTTCTTCTTTGGCCAGCTCCTGCAGTTTGTCAGCCGGTC-AGAAAACAAGTACAAAA  2734

Query 2709  GGATGAACAGCAACGAGCGGGTCCGCATCATCTCGGGGAGTCGCTANGGGAGCCTGGCCCGGGTCCTCGCT-GA  2781
            |.|||||||||||.|||||.||..|.||||||||.|||||||.|...||||||||..||| |||||||||| ||
Sbjct 2735  GAATGAACAGCAATGAGCGCGTGAGAATCATCTCTGGGAGTCCCCTGGGGAGCCTCTCCC-GGTCCTCGCTGGA  2807

Query 2782  CGCCCACCAAGCTCTGNACTGAGAAGCAGGAAGAGCTGGACCCTGAGAGCGAGCTGGGCAAGAACCTCAGCCTC  2855
            .| |||||||.|||...||.||||||||.|||||.|||||.|||||||..|||||..||..||||||||.|||.
Sbjct 2808  TG-CCACCAAACTCCTGACCGAGAAGCATGAAGAACTGGATCCTGAGAATGAGCTCAGCCGGAACCTCACCCTG  2880

Query 2856  ATCCCCTACAGCCTGGTACGCGCCTTCTACTGCGAGCGCCGCCGGCCCGTGCTCTTCACACCCACCGTGCTGGC  2929
            |||||.|||||||||||.|||||.|||.||||.|||||||||.||||.|||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 2881  ATCCCTTACAGCCTGGTGCGCGCTTTCCACTGTGAGCGCCGCAGGCCTGTGCTCTTCACGCCCACCATGCTGGC  2954

Query 2930  CAAGACGCTGGTGCAGAGGCTGCTCAACTCGGGAGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATCGTCA  3003
            ||||||..|||||||||.||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2955  CAAGACATTGGTGCAGAAGCTGCTCAACTCAGGGGGTGCCATGGAGTTCACCATCTGCAAGTCAGATATTGTCA  3028

Query 3004  CAAGAGATGAGTTCCTCAGAAGGCAGAAGACGGAGACCATCATCTACTCCCGAGAGAAGAACCCCAACGCGTTC  3077
            |||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||.
Sbjct 3029  CAAGAGATGAGTTCCTCCGAAAGCAGAAGACAGAGACCATCATCTACTCCCGGGAAAAGAACCCCAACACCTTT  3102

Query 3078  GAATGCATCGCCCCTGCCAACATTGAAGCTGTGGCCGCCAAGAACAAGCACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGG  3151
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3103  GAATGCATCGTCCCTGCCAACATTGAGGCTGTGGCAGCCAAGAACAAACACTGCCTGCTGGAGGCTGGGATCGG  3176

Query 3152  C----TGCACAAGAGACTTGATCAAGTCCAACATCTACCCCATCGTGCTCTTCATCCGGGTGTGTGAGAAGAAC  3221
            |    |||    |.|||.|||||||||.|||..|.||||||||.|||||..|||||||||||.|.|||||||||
Sbjct 3177  CTGTGTGC----GCGACCTGATCAAGTGCAAGGTGTACCCCATAGTGCTGCTCATCCGGGTGAGCGAGAAGAAC  3246

Query 3222  ATCAAGAGGTTCAGAAAGCTGCTGCCCCGACCTGAGACGGAGGAGGAGTTCCTGCGCGTGTGCCGGCTGAAGGA  3295
            |||||..|||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||.||||.||.||
Sbjct 3247  ATCAAACGGTTCAGGAAGCTGCTGCCGCGGCCAGAGACGGAAGAGGAATTCCTGCGAGTGTGCAGGCTCAAAGA  3320

Query 3296  GAAGGAGCTGGAGGCCCTGCCGTGCCTGTACGCCACGGTGGAACCTGACATGTGGGGCAGCGTAGAGGAGCTGC  3369
            |||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||.||||.||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 3321  GAAGGAGCTGGAGGCGCTGCCCTGCCTCTACGCCACCGTGGAAGCTGAGATGTGGAGCAGCGTGGAGGAGCTGC  3394

Query 3370  TCCGCGTTGTCAAGGACAAGATCGGCGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG  3437
            |.||.||..||||.||||||||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3395  TGCGAGTCCTCAAAGACAAGATTGTAGAGGAGCAGCGCAAGACCATCTGGGTGGACGAGGACCAGCTG  3462