Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000472365
Subject:
NM_001014451.3
Aligned Length:
1440
Identities:
1283
Gaps:
102

Alignment

Query    1  ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAA---GCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCA  71
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||   |||||||   |||||.|||.|||.|||||
Sbjct    1  ATGGCCACTGACTCATGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCTGCGGCTG---AGTCGTTGAGCAACTTGCA  71

Query   72  GATCAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGG---TATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAG  142
            ..|.||||||||||||.|||||.|||||||||||||   |.||.||||.||||.|.|||.|||.|||||.||||
Sbjct   72  TCTTAAGGAAGAGAAAATCAAACCAGATACCAATGGTGCTGTTGTCAAGACCAATGCCAATGCAGAGAAGACAG  145

Query  143  ATGAAGAGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAAC  216
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  ATGAAGAAGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAAC  219

Query  217  ACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCG  290
            |||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  220  ACAAACCAAGTGGAAGTCCTGCAGCGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCTTTTGAAGAGCTTCG  293

Query  291  GCTGAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCAT  364
            |||                                                                       
Sbjct  294  GCT-----------------------------------------------------------------------  296

Query  365  TACCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCC  438
                                  |||||||||..|.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  297  ----------------------CCCACAGAACTTAATTGCCCAATCTCAGTCTGGTACTGGTAAAACAGCTGCC  348

Query  439  TTTGTCTTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATA  512
            ||.||..|.||||||||.||||.|||.||.||..||.|||.|||||||||||||||.||.|||||||||||.||
Sbjct  349  TTCGTGCTGGCCATGCTTAGCCAAGTAGAACCTGCAAACAAATACCCCCAGTGTCTATGTCTCTCCCCAACGTA  422

Query  513  TGAGCTGGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATG  586
            ||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  423  TGAGCTCGCCCTCCAAACAGGAAAAGTGATTGAACAAATGGGCAAATTTTACCCTGAACTGAAGCTAGCTTATG  496

Query  587  CCGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTG  660
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  497  CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACTGTG  570

Query  661  CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT  734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT  644

Query  735  CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC  808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC  718

Query  809  TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATC  882
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  719  TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAACGTTATC  792

Query  883  AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA  956
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGACACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA  866

Query  957  GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA  1030
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA  940

Query 1031  CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG  1104
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG  1014

Query 1105  GAGCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC  1178
            ||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  GAACAGAGGGCTGCAGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC  1088

Query 1179  CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG  1252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG  1162

Query 1253  ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG  1326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG  1236

Query 1327  GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC  1400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC  1310

Query 1401  AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1344