Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472365
• Subject: XM_006530650.3
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1050
• Gaps: 282

Alignment

Query    1  ATGGCCACCGACTCGTGGGCCCTGGCGGTGGACGAGCAGGAAGCGGCTGTCAAGTCGATGACCAATTTGCAGAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CAAGGAAGAGAAAGTCAAAGCAGATACCAATGGTATTATCAAAACCAGTACCACTGCCGAGAAAACAGATGAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGAGAAAGAGGACAGAGCTGCCCAGTCCTTACTCAACAAGCTGATCAGAAGCAACCTTGTTGATAACACAAAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  CAAGTGGAAGTCCTGCAACGGGATCCAAACTCCCCTCTGTACTCGGTGAAGTCGTTTGAAGAGCTTCGGCT---  293
                                                            |.|||     |.||.|.| |.||   
Sbjct    1  ------------------------------------------------ATGTC-----AGGAACAT-GTCTAAT  20

Query  294  ---GAAACCACAGCTTCTCCAGGGAGTCTATGCCATGGGCTTCAATCGACCCTCCAAGATACAAGAGAACGCAT  364
               ||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||..
Sbjct   21  TAGGAAACCTCAGCTTCTCCAAGGAGTCTACGCCATGGGCTTCAATCGACCGTCCAAGATCCAGGAGAATGCTC  94

Query  365  TACCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAATCTGATTGCCCAGTCTCAGTCTGGCACTGGTAAAACAGCTGCC  438
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct   95  TGCCCATGATGCTTGCTGAACCCCCACAGAACCTGATTGCACAGTCCCAGTCTGGTACTGGGAAAACAGCTGCC  168

Query  439  TTTGTCTTAGCCATGCTCAGCCGAGTGGAGCCATCAGACAGATACCCCCAGTGTCTGTGCCTCTCCCCAACATA  512
            ||||||.||||.|||||||||.|||||||.|||.||||||||||.||.||||||.|||||||.|||||||||||
Sbjct  169  TTTGTCCTAGCTATGCTCAGCAGAGTGGAACCAGCAGACAGATATCCTCAGTGTTTGTGCCTGTCCCCAACATA  242

Query  513  TGAGCTGGCGCTTCAAACAGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAATTTTACCCAGAACTGAAGCTTGCCTATG  586
            |||||||||..|.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||.||.||||
Sbjct  243  TGAGCTGGCATTACAAACTGGAAAAGTGATTGAGCAGATGGGCAAGTTTCACCCAGAATTGAAGCTAGCTTATG  316

Query  587  CCGTTCGAGGCAATAAATTGGAAAGAGGCCAGAAGATCAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCTGGGACCGTG  660
            |.||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  317  CTGTTCGAGGCAATAAATTGGAGAGAGGTCAGAAGGTGAGTGAGCAGATTGTCATTGGCACCCCCGGGACCGTC  390

Query  661  CTGGACTGGTGCTCCAAGCTCAAGTTCATTGATCCCAAGAAAATCAAGGTGTTTGTTCTGGATGAGGCTGATGT  734
            .|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  391  TTGGACTGGTGCTCCAAGCTGAAGTTCATTGACCCCAAGAAGATCAAGGTGTTTGTTCTGGACGAGGCTGATGT  464

Query  735  CATGATAGCCACTCAGGGCCACCAAGATCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGGAACTGCCAGATGC  808
            .||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  465  GATGATAGCGACTCAGGGCCACCAAGACCAGAGCATCCGCATCCAGAGGATGCTGCCCAGAAACTGCCAGATGC  538

Query  809  TGCTTTTCTCCGCCACCTTTGAAGACTCTGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAAGTGGTCCCAGACCCAAATGTTATC  882
            ||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||..|.|||
Sbjct  539  TGCTTTTCTCGGCCACCTTTGAAGACTCGGTGTGGAAGTTTGCCCAGAAGGTGGTCCCAGACCCCAACATCATC  612

Query  883  AAACTGAAGCGTGAGGAAGAGACCCTGGATACCATCAAGCAGTACTATGTCCTGTGCAGCAGCAGAGACGAGAA  956
            ||.||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||..|.||||||.|||||
Sbjct  613  AAGCTAAAGCGTGAGGAGGAGACTCTGGACACCATCAAACAGTACTACGTCCTCTGCAATAACAGAGAGGAGAA  686

Query  957  GTTCCAGGCCTTGTGTAACCTCTACGGGGCCATCACCATTGCTCAAGCCATGATCTTCTGCCATACTCGCAAAA  1030
            ||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  687  GTTCCAGGCCCTGTGCAACCTGTATGGGGCCATCACCATCGCCCAAGCCATGATCTTCTGCCATACCCGCAAAA  760

Query 1031  CAGCTAGTTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAAGGCCACCAGGTGGCTCTGCTGAGTGGGGAGATGATGGTG  1104
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  761  CAGCTAGCTGGCTGGCAGCAGAGCTCTCAAAAGAGGGCCACCAGGTGGCCCTGCTGAGTGGAGAGATGATGGTG  834

Query 1105  GAGCAGAGGGCTGCGGTGATTGAGCGCTTCCGAGAGGGCAAAGAGAAGGTTTTGGTGACCACCAACGTGTGTGC  1178
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  835  GAGCAGAGGGCTGCGGTGATCGAGCGCTTCCGAGAAGGCAAAGAGAAGGTTCTGGTGACCACCAACGTGTGTGC  908

Query 1179  CCGCGGCATTGATGTTGAACAAGTGTCTGTCGTCATCAACTTTGATCTTCCCGTGGACAAGGACGGGAATCCTG  1252
            |||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.||.|
Sbjct  909  CCGTGGTATCGATGTTGAACAGGTGTCTGTCGTCATCAATTTTGACCTCCCTGTGGACAAGGATGGGAACCCAG  982

Query 1253  ACAATGAGACCTACCTGCACCGGATCGGGCGCACGGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGCCTGGCAGTGAACATGGTG  1326
            ||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  983  ACAATGAGACCTACCTGCACCGCATTGGGCGCACTGGCCGCTTTGGCAAGAGGGGTCTGGCGGTGAACATGGTG  1056

Query 1327  GACAGCAAGCACAGCATGAACATCCTGAACAGAATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGATTGGACAC  1400
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1057  GACAGCAAGCACAGCATGAATATCCTCAACAGGATCCAGGAGCATTTTAATAAGAAGATAGAAAGACTGGACAC  1130

Query 1401  AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATAGCCAAC  1434
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1131  AGATGATTTGGACGAGATTGAGAAAATCGCCAAC  1164