Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472377
• Subject: XM_011247553.2
• Aligned Length: 789
• Identities: 667
• Gaps: 54

Alignment

Query   1  ATGGCCCGGGGCCCCAAGAAGCATCTGAAGCGGGTGGCAGCTCCAAAGCATTGGATGCTGGATAAATTGACCGG  74
                                                                 |||||||||||.|||||.||
Sbjct   1  ------------------------------------------------------ATGCTGGATAAGTTGACTGG  20

Query  75  TGTGTTTGCTCCTCGTCCATCCACCGGTCCCCACAAGTTGAGAGAGTGTCTCCCCCTCATCATTTTCCTGAGGA  148
           .|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||
Sbjct  21  CGTGTTTGCTCCTCGTCCATCCACTGGTCCTCACAAGCTGAGGGAATGCCTGCCTCTCATCATTTTCCTAAGGA  94

Query 149  ACAGACTTAAGTATGCCCTGACAGGAGATGAAGTAAAGAAGATTTGCATGCAGCGGTTCATTAAAATCGATGGC  222
           ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  95  ACAGACTTAAGTATGCCCTGACTGGAGATGAAGTAAAAAAGATTTGCATGCAGCGATTCATTAAGATTGATGGG  168

Query 223  AAGGTCCGAACTGATATAACCTACCCTGCTGGATTCATGGATGTCATCAGCATTGACAAGACGGGAGAGAATTT  296
           ||.|||.|.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 169  AAAGTCAGGACCGATATAACCTACCCTGCTGGGTTTATGGATGTCATCAGCATTGACAAGACCGGAGAGAACTT  242

Query 297  CCGTCTGATCTATGACACCAAGGGTCGCTTTGCTGTACATCGTATTACACCTGAGGAGGCCAAGTACAAGTTGT  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 243  CCGTCTGATCTATGACACCAAGGGTCGCTTTGCTGTTCATCGTATTACACCGGAGGAGGCCAAGTACAAGTTGT  316

Query 371  GCAAAGTGAGAAAGATCTTTGTGGGCACAAAAGGAATCCCTCATCTGGTGACTCATGATGCCCGCACCATCCGC  444
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||.||.||.||.
Sbjct 317  GCAAAGTGAGAAAGATCTTTGTAGGCACAAAAGGAATCCCGCACCTGGTGACCCATGATGCTCGTACTATTCGG  390

Query 445  TACCCCGATCCCCTCATCAAGGTGAATGATACCATTCAGATTGATTTAGAGACTGGCAAGATTACTGATTTCAT  518
           |||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 391  TACCCTGATCCCCTCATCAAGGTGAACGACACCATTCAGATTGATTTGGAGACAGGCAAAATAACTGACTTCAT  464

Query 519  CAAGTTCGACACTGGTAACCTGTGTATGGTGACTGGAGGTGCTAACCTAGGAAGAATTGGTGTGATCACCAACA  592
           ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 465  CAAGTTTGACACTGGGAACCTGTGTATGGTGACTGGAGGTGCTAACTTGGGAAGAATTGGTGTAATCACCAACA  538

Query 593  GAGAGAGGCACCCTGGATCTTTTGACGTGGTTCACGTGAAAGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCCACTCGACTT  666
           |||||||.||.||.||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 539  GAGAGAGACATCCCGGCTCTTTTGATGTGGTTCATGTGAAAGATGCCAATGGCAACAGCTTTGCCACTCGGCTG  612

Query 667  TCCAACATTTTTGTTATTGGCAAGGGCAACAAACCATGGATTTCTCTTCCCCGAGGAAAGGGTATCCGCCTCAC  740
           ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|||||||.||.|||||||||||
Sbjct 613  TCCAACATTTTTGTTATTGGCAAGGGTAACAAACCATGGATCTCTCTTCCCAGAGGAAAAGGAATCCGCCTCAC  686

Query 741  CATTGCTGAAGAGAGAGACAAAAGACTGGCTGCCAAACAGAGCAGTGGC  789
           |||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct 687  CATTGCTGAAGAGAGAGACAAGAGGCTTGCGGCCAAACAGAGCAGTGGG  735