Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472412
- Subject:
- NM_025936.3
- Aligned Length:
- 1980
- Identities:
- 1723
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGACGTACTGGTGTCTGAGTGCTCCGCGCGGCTGCTGCAGCAGGAAGAAGAGATTAAATCTCTGACTGCTGA 74
|||||||..||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||...||||||||..|||||||||||||
Sbjct 1 ATGGACGGTCTGGTGGCTCAGTGCTCCGCGCGGTTGCTGCAGCAGGAAAGGGAGATTAAGGCTCTGACTGCTGA 74
Query 75 AATTGACCGGTTGAAAAACTGTGGCTGTTTAGGAGCTTCTCCAAATTTGGAGCAGTTACAAGAAGAAAATTTAA 148
.||.||||||.||||.|||||||||||.||.|.|||||||||||.||||||.|||||||.||||||||||||||
Sbjct 75 GATCGACCGGCTGAAGAACTGTGGCTGCTTGGAAGCTTCTCCAAGTTTGGAACAGTTACGAGAAGAAAATTTAA 148
Query 149 AATTAAAGTATCGACTGAATATTCTTCGAAAGAGTCTTCAGGCAGAAAGGAACAAACCAACTAAAAATATGATT 222
||||.||||||.|.||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||..||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 AATTGAAGTATAGGCTGAATATTCTTCGAAGGAGTCTTCAGGAAGAAAGGAGAAAACCAACTAAAAACATGATT 222
Query 223 AACATTATTAGCCGCCTACAAGAGGTCTTTGGTCATGCAATTAAGGCTGCATATCCAGATTTGGAAAATCCTCC 296
|||||.|..||||||||.||.||.||||||||...|||.||||.|||||||||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 223 AACATCAACAGCCGCCTGCAGGAAGTCTTTGGCTGTGCCATTAGGGCTGCATATCCAGACTTGGAGAACCCTCC 296
Query 297 TCTGCTAGTGACACCAAGTCAGCAGGCCAAGTTTGGGGACTATCAGTGTAATAGTGCTATGGGTATTTCTCAGA 370
.|||.|.||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 CCTGATCGTGACACCAAGTCAGCAGCCCAAGTTTGGAGACTATCAGTGTAATAGTGCCATGGGTATTTCTCAGA 370
Query 371 TGCTCAAAACCAAGGAACAGAAAGTTAATCCAAGAGAAATTGCTGAAAACATTACCAAACACCTCCCAGACAAT 444
|||||||..|.||||||||||||||.|.|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||..|||||
Sbjct 371 TGCTCAAGGCAAAGGAACAGAAAGTCAGTCCCAGAGAAATCGCAGAAAACATTACCAAACACCTGCCGAACAAT 444
Query 445 GAATGTATTGAAAAAGTTGAAATTGCTGGTCCTGGTTTTATTAATGTCCACTTAAGAAAGGATTTTGTATCAGA 518
.|||.||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.|||||
Sbjct 445 AAATATATTGACAAAGTTGAAATTGCGGGTCCTGGTTTCATTAATGTGCACCTGAGAAAAGACTTTGTGTCAGA 518
Query 519 ACAATTGACCAGTCTTCTAGTGAATGGAGTTCAACTACCTGCTCTGGGAGAGAATAAAAAGGTTATAGTTGACT 592
|||..|.||||||||.||||||||||||||.||.||.||||..||.|||||.||..|.||||||||||||||||
Sbjct 519 ACAGCTAACCAGTCTCCTAGTGAATGGAGTCCAGCTGCCTGTGCTTGGAGACAAGGAGAAGGTTATAGTTGACT 592
Query 593 TTTCCTCCCCTAATATAGCTAAAGAGATGCATGTAGGCCACCTGAGGTCAACTATCATAGGAGAGAGTATAAGC 666
|||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 593 TTTCCTCTCCCAACATAGCTAAGGAGATGCATGTTGGCCACCTCAGGTCAACCATCATAGGAGAGAGCATGAGC 666
Query 667 CGCCTCTTTGAATTTGCAGGGTATGACGTGCTCAGGTTAAATCATGTAGGAGACTGGGGGACCCAGTTTGGCAT 740
||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 667 CGCCTCTTTGAATTTGCAGGATACGATGTGCTAAGGTTAAACCATGTAGGAGATTGGGGAACCCAGTTTGGCAT 740
Query 741 GCTCATCGCTCACCTGCAAGACAAATTTCCAGATTATCTAACAGTTTCACCTCCTATTGGGGATCTTCAGGTCT 814
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||.||
Sbjct 741 GCTCATCGCTCACCTGCAAGATAAATTTCCGGATTATCTGACAGTTTCACCTCCTATTGGGGATCTGCAGGCCT 814
Query 815 TTTATAAGGAATCTAAGAAGAGGTTTGATACTGAGGAGGAATTTAAGAAGCGAGCATATCAGTGTGTAGTTCTG 888
|||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.||
Sbjct 815 TTTATAAGGAATCTAAGAAGAGGTTTGATGCTGATGAGGAGTTTAAGAAGCGAGCCTATCAGTGTGTCGTTTTG 888
Query 889 CTCCAGGGTAAAAACCCAGATATTACAAAAGCTTGGAAGCTTATCTGTGATGTCTCCCGCCAAGAGTTAAATAA 962
||.|||.||||||||||||||||.|..|||||.|||||.||.||||||||.||.|||||..|||||||.||.||
Sbjct 889 CTGCAGAGTAAAAACCCAGATATCATGAAAGCCTGGAACCTCATCTGTGACGTGTCCCGGGAAGAGTTTAAGAA 962
Query 963 AATCTATGATGCATTGGACGTCTCTTTAATAGAGAGAGGGGAATCCTTCTATCAAGATAGGATGAATGATATTG 1036
|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 963 AATCTATGATGCATTGGACATCACTTTAATAGAGAGAGGAGAATCCTTCTATCAAGATAGGATGAAGGACATTG 1036
Query 1037 TAAAGGAATTTGAAGATAGAGGATTTGTGCAGGTGGATGATGGCAGAAAGATTGTATTTGTCCCAGGGTGTTCC 1110
||||||||||||||||||.|||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.
Sbjct 1037 TAAAGGAATTTGAAGATAAAGGGTTTGTGCAAGTGGATGATGGCAGAAAAATTGTGTTCGTGCCTGGGTGTTCT 1110
Query 1111 ATACCATTAACCATAGTAAAATCAGATGGAGGTTATACCTATGATACATCTGACCTGGCTGCTATTAAACAAAG 1184
.|.||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1111 GTGCCATTAACGATAGTGAAATCAGATGGGGGCTATACCTATGACACATCTGACCTGGCTGCCATCAAACAGAG 1184
Query 1185 ACTATTTGAGGAAAAAGCAGATATGATTATCTATGTTGTGGACAATGGACAATCTGTGCACTTCCAGACAATAT 1258
|||.|||||.|||||||||.|.|.||||||.|||||.|||||||||||||||.||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1185 ACTGTTTGAAGAAAAAGCAAACAAGATTATTTATGTGGTGGACAATGGACAAGCTATACACTTCCAGACAATAT 1258
Query 1259 TTGCTGCTGCTCAAATGATTGGTTGGTATGACCCTAAAGTAACTCGAGTCTTCCATGCTGGATTTGGTGTGGTG 1332
|||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||.|||...|||.|..|||||||||||.||.
Sbjct 1259 TTGCTGCTGCTCAGATGATTGGCTGGTATGACCCGAAAGTAACTCTAGTGACCCACGTGGGATTTGGTGTCGTC 1332
Query 1333 CTAGGGGAAGACAAGAAAAAGTTTAAAACACGTTCGGGTGAAACAGTGCGCCTCATGGATCTTCTGGGAGAAGG 1406
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||.||||||
Sbjct 1333 CTAGGAGAAGACAAGAAGAAATTTAAAACACGTTCAGGTGAAACTGTGCGCCTTATGGACCTGCTGGAAGAAGG 1406
Query 1407 ACTAAAACGATCCATGGACAAGTTGAAGGAAAAAGAAAGAGACAAGGTCTTAACTGCAGAGGAATTGAATGCTG 1480
.||.|||||.||||||||||||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||.||.|
Sbjct 1407 GCTGAAACGGTCCATGGACAAGCTAAAGGAGAAAGAGAGAGACAAGGTCTTAACTGAAGAGGAATTGAAAGCAG 1480
Query 1481 CTCAGACATCCGTTGCATATGGCTGCATCAAATATGCTGACCTTTCCCATAACCGGTTGAATGACTACATCTTC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||..|.|||||||||||||||
Sbjct 1481 CTCAGACATCCGTTGCATATGGCTGCATCAAATACGCCGACCTTTCTCATAATCGCCTCAATGACTACATCTTC 1554
Query 1555 TCCTTTGACAAAATGCTAGATGACAGAGGAAATACAGCTGCTTACTTGTTGTATGCCTTCACTAGAATCAGGTC 1628
|||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||.|..|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1555 TCCTTTGACAAGATGCTGGATGACAGAGGGAACACAGCTGCTTACCTACTGTATGCCTTCACCAGAATCAGGTC 1628
Query 1629 TATTGCACGTCTGGCCAATATTGATGAAGAAATGCTCCAAAAAGCTGCTCGAGAAACCAAGATTCTTTTGGATC 1702
||||||.||.||.|||||.||||||||.|..|||||.||.|.|||.|||||.|||||||||||..|||||||.|
Sbjct 1629 TATTGCGCGCCTCGCCAACATTGATGAGGCGATGCTACAGAGAGCCGCTCGGGAAACCAAGATCATTTTGGACC 1702
Query 1703 ATGAGAAGGAATGGAAACTAGGCCGGTGCATTTTACGGTTCCCTGAGATTCTGCAAAAGATTTTAGATGACTTA 1776
||||.|||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||.|.
Sbjct 1703 ATGAAAAGGAGTGGAAGCTGGGGCGGTGCATCTTACGGTTCCCCGAGATCCTCCAGAAGATCTTAGACGACCTG 1776
Query 1777 TTTCTCCACACTCTCTGTGATTATATATATGAGCTGGCAACTGCTTTCACAGAGTTCTATGATAGCTGCTACTG 1850
|||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1777 TTTCTCCACACCCTCTGTGACTACATTTACGAGCTGGCAACCACCTTCACAGAGTTCTACGATAGCTGCTACTG 1850
Query 1851 TGTGGAGAAAGATAGACAGACTGGAAAAATATTGAAGGTGAACATGTGGCGTATGCTGCTATGTGAAGCAGTAG 1924
|||||||||||||.||||||||||.|||.|||||||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|
Sbjct 1851 TGTGGAGAAAGATCGACAGACTGGGAAAGTATTGAAAGTGAACATGTGGCGGATGCTCCTGTGTGAGGCCGTGG 1924
Query 1925 CTGCTGTCATGGCCAAGGGGTTTGATATCCTGGGAATAAAACCTGTCCAAAGGATG 1980
||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925 CTGCTGTCATGGCCAAGGGGTTCGATATACTGGGGATAAAACCCGTCCAAAGGATG 1980