Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472464
- Subject:
- NM_003471.3
- Aligned Length:
- 1271
- Identities:
- 1113
- Gaps:
- 115
Alignment
Query 1 ATGCAAGTCTCCATA-----GCCTGCACAGAGCA----------CAATTTG--------AA--------GAGTC 43
||||| |||..||| |||||..|||| || |||..|| || ||.||
Sbjct 1 ATGCA--TCTGTATAAACCTGCCTGTGCAGA-CATCCCGAGCCCCAAGCTGGGTCTGCCAAAATCCAGTGAATC 71
Query 44 GG------AATGGTGAGGACCGACTTCTGAGCAAGCAGAGCTCCACCGCCCCCAATGTGGTAA-ACGCAGCC-C 109
|| ||||..||.|.| |.|.|||||.| ||| || ||.||||| |
Sbjct 72 GGCTCTAAAATGTAGATGGC---------ACCTAGCAGTG----ACC--------------AAGACTCAGCCTC 118
Query 110 GGGC------CAAATTCC------GCACGGTCGCTATCATCGCGCGCAGCC-------------TGGGGACGTT 158
.||| |||| || ||.|.|| .|.|||||| |||..|.|||
Sbjct 119 AGGCGGCCTGCAAA--CCTGTGAGGCCCAGT-----------GGAGCAGCCGAACAGAAATATGTGGAAAAGTT 179
Query 159 --CACGCCTCAGCATCACATTTCTCTCAAAGAGTCCACCGCAAAGC--AGACTGGCATGAAATATAGGAATCTT 228
.||| |...|||...|||||..|..|.||..|||| ||.||| ||||.||||||..|||.|||||||||
Sbjct 180 TCTACG--TGTTCATGGAATTTCGTTGCAGGAAACCAC--CAGAGCAGAGACGGGCATGGCATACAGGAATCTT 249
Query 229 GGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTTCAGATGA 302
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 250 GGAAAATCAGGACTCAGAGTTTCTTGCTTGGGTCTTGGAACATGGGTGACATTTGGAGGTCAAATTTCAGATGA 323
Query 303 GGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCTATGCTG 376
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 324 GGTTGCTGAACGGCTGATGACCATCGCCTATGAAAGTGGTGTTAACCTCTTTGATACTGCCGAAGTCTATGCTG 397
Query 377 CTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGTCATAACA 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 398 CTGGAAAGGCTGAAGTGATTCTGGGGAGCATCATCAAGAAGAAAGGCTGGAGGAGGTCCAGTCTGGTCATAACA 471
Query 451 ACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAGGATTGAA 524
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 472 ACCAAACTCTACTGGGGTGGAAAAGCTGAAACAGAAAGAGGGCTGTCAAGAAAGCATATTATTGAAGGATTGAA 545
Query 525 GGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAACACTCCCA 598
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 546 GGGCTCCCTCCAGAGGCTGCAGCTCGAGTATGTGGATGTGGTCTTTGCAAATCGACCGGACAGTAACACTCCCA 619
Query 599 TGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCGAGATGG 672
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 620 TGGAAGAAATTGTCCGAGCCATGACACATGTGATAAACCAAGGCATGGCGATGTACTGGGGCACCTCGAGATGG 693
Query 673 AGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTGAACAAGC 746
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 694 AGTGCTATGGAGATCATGGAAGCCTATTCTGTAGCAAGACAGTTCAATATGATCCCACCGGTCTGTGAACAAGC 767
Query 747 TGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTGTTGGCG 820
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 768 TGAGTACCATCTTTTCCAGAGAGAGAAAGTGGAGGTCCAGCTGCCAGAGCTCTACCACAAAATAGGTGTTGGCG 841
Query 821 CAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGTTCCAGG 894
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 842 CAATGACATGGTCTCCACTTGCCTGTGGAATCATCTCAGGAAAATACGGAAACGGGGTGCCTGAAAGTTCCAGG 915
Query 895 GCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAACAAGCT 968
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 916 GCTTCACTGAAGTGCTACCAGTGGTTGAAAGAAAGAATTGTAAGTGAAGAAGGGAGAAAACAGCAAAACAAGCT 989
Query 969 AAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGCCTGAGAA 1042
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 990 AAAAGACCTTTCCCCAATTGCGGAGCGTCTGGGATGCACACTACCTCAGCTAGCTGTTGCGTGGTGCCTGAGAA 1063
Query 1043 ACGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCCATTCAG 1116
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064 ATGAAGGTGTGAGTTCTGTGCTCCTGGGATCATCCACTCCTGAACAACTCATTGAAAACCTTGGTGCCATTCAG 1137
Query 1117 GTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAGCAAGAA 1190
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138 GTTCTCCCAAAGATGACATCACATGTGGTAAATGAGATTGATAACATACTGCGCAACAAGCCCTACAGCAAGAA 1211
Query 1191 GGACTATAGATCA 1203
|||||||||||||
Sbjct 1212 GGACTATAGATCA 1224