Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472523
• Subject: XM_011536192.2
• Aligned Length: 1063
• Identities: 940
• Gaps: 116

Alignment

Query    1  ATGCCTGCTTGGGTGATAGATAAATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTAT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATACACTATCCAAATGAAGTCATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATAT-GAGA  147
                                  ||.|     ||  |||  ||  |.|||.|.||.| |||       || ||.|
Sbjct    1  ----------------------ATGG-----GT--ACG--GC--GAGTACACCCGA-AGA-------ATCGAAA  33

Query  148  AGTGGTTATGGAGCTACAGCTTTAAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCC  221
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   34  GGTGGTTATGGAGCTACAGCTTTAAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCC  107

Query  222  TCTGACTCTGGGTCGGGATGTCTCTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAG  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  108  TCTGACTCTGGGTCGGGATGTCTCTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAG  181

Query  296  ATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCTCCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAG  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  182  ATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCTCCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAG  255

Query  370  GTCTCTCACAAACCCAAATCACTCACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTC  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  256  GTCTCTCACAAACCCAAATCACTCACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTC  329

Query  444  TGCTATAAACAAAGTTGGTGGCCTGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAG  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  330  TGCTATAAACAAAGTTGGTGGCCTGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAG  403

Query  518  GCGGAGTTGGTACTTTTGCTATACAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGAT  591
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  404  GCGGAGTTGGTACTTTTGCTATACAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGAT  477

Query  592  GCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCTTGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTT  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  478  GCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCTTGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTT  551

Query  666  GAAATCCTTAAAACCATTTGATTTTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTC  739
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  552  GAAATCCTTAAAACCATTTGATTTTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTC  625

Query  740  TCAAGAAATGGTCAGGAGCCACCTATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATA  813
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  626  TCAAGAAATGGTCAGGAGCCACCTATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATA  699

Query  814  GCAGATGGCATGTTGCAGACAGGAGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTA  887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  700  GCAGATGGCATGTTGCAGACAGGAGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTA  773

Query  888  TCGCTGGGCATTTTTCATGGCCAGTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCC  961
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  774  TCGCTGGGCATTTTTCATGGCCAGTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCC  847

Query  962  GGCCAGTTATTGAACAAACCTTTCCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCA  1035
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  848  GGCCAGTTATTGAACAAACCTTTCCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCA  921

Query 1036  CGAGGAAAGACTGTAATTAATGTTGTT  1062
            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  922  CGAGGAAAGACTGTAATTAATGTTGTT  948