Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472523
- Subject:
- XM_017011376.2
- Aligned Length:
- 1188
- Identities:
- 738
- Gaps:
- 450
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGAATTTCTGAAGACTTGTGTACTTAGAAGAAATGCATGCACTGCGGTTTGCTTCTGGAGAAGCAAAGTTGT 74
Query 1 ----------------------------------------------------ATGCCTGCTTGGGTGATAGATA 22
||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAAAAGCCTTCAGTTAGAAGGATTAGTACTACCTCTCCTAGGAGCACTGTCATGCCTGCTTGGGTGATAGATA 148
Query 23 AATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC 96
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AATATGGGAAGAATGAAGTGCTTCGATTCACTCAGAACATGATGATGCCTATCATACACTATCCAAATGAAGTC 222
Query 97 ATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCTACAGCTTT 170
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTGTCAAAGTTCACGCTGCCAGTGTAAATCCTATAGACGTTAATATGAGAAGTGGTTATGGAGCTACAGCTTT 296
Query 171 AAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATATGAAGCGTGATCCTTTACACGTGAAAATCAAAGGAGAAGAATTTCCTCTGACTCTGGGTCGGGATGTCT 370
Query 245 CTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT 318
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTGGCGTGGTGATGGAATGTGGGCTTGATGTGAAATACTTCAAGCCTGGAGATGAGGTCTGGGCTGCAGTTCCT 444
Query 319 CCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGGTCTCTCACAAACCCAAATCACT 392
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCTTGGAAACAAGGCACTCTTTCAGAGTTTGTTGTAGTCAGTGGGAATGAGGTCTCTCACAAACCCAAATCACT 518
Query 393 CACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCTGCTATAAACAAAGTTGGTGGCC 466
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CACTCATACTCAAGCTGCCTCTTTGCCATATGTGGCTCTCACAGCCTGGTCTGCTATAAACAAAGTTGGTGGCC 592
Query 467 TGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGGCGGAGTTGGTACTTTTGCTATA 540
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TGAATGACAAGAATTGCACAGGAAAACGTGTTCTAATCTTAGGCGCTTCAGGCGGAGTTGGTACTTTTGCTATA 666
Query 541 CAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATGCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCT 614
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CAGGTAATGAAAGCATGGGATGCTCATGTGACAGCAGTTTGCTCCCAAGATGCCAGTGAACTTGTAAGGAAGCT 740
Query 615 TGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTGAAATCCTTAAAACCATTTGATT 688
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGGTGCAGACGATGTAATTGATTACAAATCTGGAAGTGTGGAAGAGCAGTTGAAATCCTTAAAACC-------- 806
Query 689 TTATCCTTGATAATGTTGGCGGATCCACTGAAACATGGGCTCCAGATTTTCTCAAGAAATGGTCAGGAGCCACC 762
Sbjct 807 -------------------------------------------------------------------------- 806
Query 763 TATGTGACTTTGGTGACTCCTTTCCTCCTGAACATGGACCGATTGGGCATAGCAGATGGCATGTTGCAGACAGG 836
Sbjct 807 -------------------------------------------------------------------------- 806
Query 837 AGTCACTGTAGGTTCAAAGGCATTAAAGCATTTCTGGAAAGGAGTCCATTATCGCTGGGCATTTTTCATGGCCA 910
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 807 ----------------------------CATTTCTGGAAAGGAGTCCATTATCGCTGGGCATTTTTCATGGCCA 852
Query 911 GTGGCCCATGTTTAGATGACATTGCAGAACTGGTGGATGCGGGAAAGATCCGGCCAGTTATTGAACAAACCTTT 984
||||||||||||
Sbjct 853 GTGGCCCATGTT-------------------------------------------------------------- 864
Query 985 CCTTTTTCTAAAGTTCCAGAAGCCTTCCTGAAGGTGGAAAGAGGACACGCACGAGGAAAGACTGTAATTAATGT 1058
Sbjct 865 -------------------------------------------------------------------------- 864
Query 1059 TGTT 1062
Sbjct 865 ---- 864