Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472530
• Subject: NM_001349237.2
• Aligned Length: 2109
• Identities: 1869
• Gaps: 240

Alignment

Query    1  ATGGCGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACTGCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCAGCTACGGGGGATCCTGGACTCTCTAAACTGCAGTTTGCCCCTTTTAGTAGTGCCTTGGATGTTGG  74

Query   75  GTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGTATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTTTGGCATGAGTTGACCCAGAAGAAGCTGAACGAGTATCGGCTGGATGAAGCTCCCAAGGACATTAAGGGTT  148

Query  149  ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGCTTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATTACTACAATGGTGACTCTGCTGGGCTGCCAGCTCGCTTAACATTGGAGTTCAGTGCTTTTGACATGAGTGCT  222

Query  223  CCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACTGTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCACCCCAGCCCGTTGCTGCCCAGCTATTGGAACACTGTATAACACCAACACACTCGAGTCTTTCAAGACTGC  296

Query  297  AGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGATATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGATAAGAAGCTCCTTTTGGAACAAGCAGCAAATGAGATATGGGAATCCATAAAATCAGGCACTGCTCTTGAAA  370

Query  371  ACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTTGCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACCCTGTACTCCTCAACAAGTTCCTCCTCTTGACATTTGCAGATCTAAAGAAGTACCACTTCTACTATTGGTTT  444

Query  445  TGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCTCATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGCTATCCTGCCCTCTGTCTTCCAGAGAGTTTACCTCTCATTCAGGGGCCAGTGGGTTTGGATCAAAGGTTTTC  518

Query  519  ACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATAATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  ACTAAAACAGATTGAAGCACTAGAGTGTGCATATGATAATCTTTGTCAAACAGAAGGAGTCACAGCTCTTCCTT  592

Query  593  ACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTTTCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTTCTTAATCAAGTATGATGAGAACATGGTGCTGGTTTCCTTGCTTAAACACTACAGTGATTTCTTCCAAGGT  666

Query  667  CAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTGTAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAAAGGACGAAGATAACAATTGGTGTATATGATCCCTGTAACTTAGCCCAGTACCCTGGATGGCCTTTGAGGAA  740

Query  741  TTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTTTCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTTTTGGTCCTAGCAGCCCACAGATGGAGTAGCAGTTTCCAGTCTGTTGAAGTTGTTTGCTTCCGTGACCGTA  814

Query  815  CCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATCTTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCATGCAGGGGGCGAGAGACGTTGCCCACAGCATCATCTTCGAAGTGAAGCTTCCAGAAATGGCATTTAGCCCA  888

Query  889  GATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GATTGTCCTAAAGCAGTTGGATGGGAAAAGAACCAGAAAGGAGGCATGGGACCAAGGATGGTGAACCTCAGTGA  962

Query  963  ATGTATGGACCCTAAAAGGTTAGCTGAGTCATCAGTGGATCTAAATCTCAAACTGATGTGTTGGAGATTGGTTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATGTATGGACCCTAAAAGGTTAGCTGAGTCATCAGTGGATCTAAATCTCAAACTGATGTGTTGGAGATTGGTTC  1036

Query 1037  CTACTTTAGACTTGGACAAGGTTGTGTCTGTCAAATGTCTGCTGCTTGGAGCCGGCACCTTGGGTTGCAATGTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTACTTTAGACTTGGACAAGGTTGTGTCTGTCAAATGTCTGCTGCTTGGAGCCGGCACCTTGGGTTGCAATGTA  1110

Query 1111  GCTAGGACGTTGATGGGTTGGGGCGTGAGACACATCACATTTGTGGACAATGCCAAGATCTCCTACTCCAATCC  1184
            |||||||||||||                                                             
Sbjct 1111  GCTAGGACGTTGA-------------------------------------------------------------  1123

Query 1185  TGTGAGGCAGCCTCTCTATGAGTTTGAAGATTGCCTAGGGGGTGGTAAGCCCAAGGCTCTGGCAGCAGCGGACC  1258
                                                                                      
Sbjct 1124  --------------------------------------------------------------------------  1123

Query 1259  GGCTCCAGAAAATATTCCCCGGTGTGAATGCCAGAGGATTCAACATGAGCATACCTATGCCTGGGCATCCAGTG  1332
                                    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1124  ------------------------TGAATGCCAGAGGATTCAACATGAGCATACCTATGCCTGGGCATCCAGTG  1173

Query 1333  AACTTCTCCAGTGTCACTCTGGAGCAAGCCCGCAGAGATGTGGAGCAACTGGAGCAGCTCATCGAAAGCCATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174  AACTTCTCCAGTGTCACTCTGGAGCAAGCCCGCAGAGATGTGGAGCAACTGGAGCAGCTCATCGAAAGCCATGA  1247

Query 1407  TGTCGTCTTCCTATTGATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTGCCGTCATTGCTGCAAGCAAGAGAAAGC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1248  TGTCGTCTTCCTATTGATGGACACCAGGGAGAGCCGGTGGCTTCCTGCCGTCATTGCTGCAAGCAAGAGAAAGC  1321

Query 1481  TGGTCATCAATGCTGCTTTGGGATTTGACACATTTGTTGTCATGAGACATGGTCTGAAGAAACCAAAGCAGCAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1322  TGGTCATCAATGCTGCTTTGGGATTTGACACATTTGTTGTCATGAGACATGGTCTGAAGAAACCAAAGCAGCAA  1395

Query 1555  GGAGCTGGGGACTTGTGTCCAAACCACCCTGTGGCATCTGCTGACCTCCTGGGCTCATCGCTTTTTGCCAACAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1396  GGAGCTGGGGACTTGTGTCCAAACCACCCTGTGGCATCTGCTGACCTCCTGGGCTCATCGCTTTTTGCCAACAT  1469

Query 1629  CCCTGGTTACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCCCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1470  CCCTGGTTACAAGCTTGGCTGCTACTTCTGCAATGATGTGGTGGCCCCAGGAGATTCAACCAGAGACCGGACCT  1543

Query 1703  TGGACCAGCAGTGCACTGTGAGTCGTCCAGGACTGGCCGTGATTGCAGGAGCCCTGGCCGTGGAATTGATGGTA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544  TGGACCAGCAGTGCACTGTGAGTCGTCCAGGACTGGCCGTGATTGCAGGAGCCCTGGCCGTGGAATTGATGGTA  1617

Query 1777  TCTGTTTTGCAGCATCCAGAAGGGGGCTATGCCATTGCCAGCAGCAGTGACGATCGGATGAATGAGCCTCCAAC  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1618  TCTGTTTTGCAGCATCCAGAAGGGGGCTATGCCATTGCCAGCAGCAGTGACGATCGGATGAATGAGCCTCCAAC  1691

Query 1851  CTCTCTTGGGCTTGTGCCTCACCAG-------------------------------------------------  1875
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct 1692  CTCTCTTGGGCTTGTGCCTCACCAGATCCGGGGATTTCTTTCACGGTTTGATAATGTCCTTCCCGTCAGCCTGG  1765

Query 1876  --------------------------------GTTCTTGATCAATATGAACGAGAAGGATTTAACTTCCTAGCC  1917
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1766  CATTTGACAAATGTACAGCTTGTTCTTCCAAAGTTCTTGATCAATATGAACGAGAAGGATTTAACTTCCTAGCC  1839

Query 1918  AAGGTGTTTAATTCTTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACTGGTCTTACATTGCTGCATCAAGAAACCCAAGC  1991
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  AAGGTGTTTAATTCTTCACATTCCTTCTTAGAAGACTTGACTGGTCTTACATTGCTGCATCAAGAAACCCAAGC  1913

Query 1992  TGCTGAGATCTGGGACATGAGCGATGATGAGACCATC  2028
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1914  TGCTGAGATCTGGGACATGAGCGATGATGAGACCATC  1950