Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472539
• Subject: XM_017003394.1
• Aligned Length: 1653
• Identities: 1313
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGTTGACTTCAAAGTTATCCAAAGAACAAACACTAATAAAACAACACAAGCAAGTGTGGTGGCAGGAATACCA  74

Query    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3
                                                                                   |||
Sbjct   75  GAGGCTGAATGAAGTCAGATGTAAAATGGAATCTGAAATAAAATCCCTTCTCAATGAAGAGAACATTGGAAATG  148

Query    4  AATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTT------------------------------------------------  29
            ||||||||||||||||||||||||||                                                
Sbjct  149  AATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTTGAGCAAGAGCTATCAGAACAACAGTGCACATATCTTAAAAATGTAATA  222

Query   30  --------------------------------------------------------------------------  29
                                                                                      
Sbjct  223  AATCCTATTCAGCAGCTGAGAGCAGATCTAAAATACAGACAGCATCACACTTTGCAGCATTCACACCCACATAT  296

Query   30  ------------------------------GGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGAC  73
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAGTTTAACTCCATGAAAGTATTGGAAGAGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGAC  370

Query   74  TTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAA  147
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAA  444

Query  148  GAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATC  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATC  518

Query  222  TTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGG  295
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGG  592

Query  296  AAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCT  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCT  666

Query  370  GGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGA  443
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGA  740

Query  444  TTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATT  517
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATT  814

Query  518  GGAATAAAAATAGGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATG  591
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGAATAAAAATAAGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATG  888

Query  592  GAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAA------------  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            
Sbjct  889  GAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGAAGTGATTCT  962

Query  654  ---------------------------GGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAA  700
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTCAGAGATAACCAATATCATTATTTGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAA  1036

Query  701  TGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAA  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAA  1110

Query  775  AGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAG  848
            |||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAG  1184

Query  849  AGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAAT  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAAT  1258

Query  923  ATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAA  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAA  1332

Query  997  GAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGAT  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGAT  1406

Query 1071  GTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCT  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCT  1480

Query 1145  TCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAA  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAA  1554

Query 1219  GCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGA  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGA  1628

Query 1293  CATGGAGTCTACTGTATTGAAAATA  1317
            ||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1629  CATGGAGTCTACTGTATTTAAAATA  1653