Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472539
• Subject: XM_017003397.1
• Aligned Length: 1335
• Identities: 1313
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ------------------ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTTGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAA  56
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGAGAACATTGGAAATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTTTGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAA  74

Query   57  AACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTC  130
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGAAAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTC  148

Query  131  TAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCA  204
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAACTGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCA  222

Query  205  TACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGA  278
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAGTTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGA  296

Query  279  CTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTA  352
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACTAAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTA  370

Query  353  TTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCT  426
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTCTGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCT  444

Query  427  CACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAA  500
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGTGACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAA  518

Query  501  TATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTT  574
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTATACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTT  592

Query  575  GTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAA  648
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGAAAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAA  666

Query  649  GCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAG  722
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCAAGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAG  740

Query  723  AGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCA  796
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct  741  AGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGAATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAA  814

Query  797  TAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAA  870
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAATGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAA  888

Query  871  CTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAG  944
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAAAGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAG  962

Query  945  GCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAG  1018
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCATGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAG  1036

Query 1019  CCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAA  1092
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTGTTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAA  1110

Query 1093  GCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGA  1166
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAAAAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGA  1184

Query 1167  ACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTT  1240
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGCACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTT  1258

Query 1241  ATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAA  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1259  ATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTCCAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAA  1332

Query 1315  ATA  1317
            |||
Sbjct 1333  ATA  1335