Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472539
• Subject: XM_024452710.1
• Aligned Length: 1515
• Identities: 1313
• Gaps: 198

Alignment

Query    1  ----------------------------------------------ATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT  28
                                                          ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAATCTGAAATAAAATCCCTTCTCAATGAAGAGAACATTGGAAATGAATGTCTTTGTGACCTTACAAATTT  74

Query   29  T-------------------------------------------------------------------------  29
            |                                                                         
Sbjct   75  TGAGCAAGAGCTATCAGAACAACAGTGCACATATCTTAAAAATGTAATAAATCCTATTCAGCAGCTGAGAGCAG  148

Query   30  --------------------------------------------------------------------------  29
                                                                                      
Sbjct  149  ATCTAAAATACAGACAGCATCACACTTTGCAGCATTCACACCCACATATTGAGTTTAACTCCATGAAAGTATTG  222

Query   30  -----GGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA  98
                 |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GAAGAGGTTGACTTTGTGAAGAAACAATTGAAAACTGTCTTTGAAAGACTTAGGCTGGAGCAACAGAGAATAGA  296

Query   99  AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC  172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AAATGATCTTTCAGACTGGAGTATAAAGATTCTAGATCATTCTTTGGAAGAAAAGACTAACCCGCTTAGTGAAC  370

Query  173  TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG  246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGCCCATTGAATTAGAAAGTTTGGAATGCCCATACCCTGATTTGAAATCTTCAATTCTCAGTGAGTTCTATAAG  444

Query  247  TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT  320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTTACACAGAAATATCAGAAGAAGCTTCAAGACTTTAATCTGCAGTTGGAAGACATATACAGAAACTGTCAACT  518

Query  321  AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC  394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AAGTGAAGAAGACCACTGGATTTACCAGGCTATTTTGGATCAGTACCCTGGAGATCTCTTTGGAAGAAGGACTC  592

Query  395  TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT  468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TGTATCTGGACATGTTACAAAGATATTTTCCTCACAAATCTAGGCATGATTTGGTTGAACACGAGAAATATTGT  666

Query  469  GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAGGAAAGACTTTAT  542
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  667  GACCAATATCGCTTTGCTATAGAGCAGCAAAATATCCTGATATCAAATTGGAATAAAAATAAGAAAGACTTTAT  740

Query  543  ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA  616
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  ACAGAAGGCTGTGCTGACACTCACTGAGGCTTGTGCAACACATGAAATGGAGAGCATGTTGGCTAAGGACAAGA  814

Query  617  AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCA  690
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAAGCAACAGGAATTGTGTGCTGATCTGAAAGCCAAGGTTCGTCAATGGCGAGCCCACCAAGAAGAGGTAGCA  888

Query  691  AGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGA  764
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AGACTGGAAATGGAAATTTCTGCCAGAAGAAGAGAAAAGGAAGAGGAGAAAGAGAAACTGTGGAAGAAGAAGGA  962

Query  765  ATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAGCATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAA  838
            |||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATTGTTGCAAAGAGCAGAGAAGAAAAAAAAAATAAAAAAATACTGGGCCAAGAAAAAACAGAAGTGGCAAGAAA  1036

Query  839  TGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAA  912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGGAAATGAGAGATCTTCAGCGTCTAGAAGAACTGAAGAAATTAATCGCTGAACAGTCACTAAAAGACAGAGAA  1110

Query  913  AGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCA  986
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGGGTTAAATATAGACAAGAATTATTGGAAAGGCGTTTGATGGAGAAAAAGGAAGTGGCCCTTCAAGAAGCTCA  1184

Query  987  TGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTG  1060
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAAGACAAAGAGAGAGCACGGCGGCTAGAAGCCCTTAGGAAACAGGTTGCTGTTGTTGCTCAATTTGATCCTG  1258

Query 1061  TTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAA  1134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTAGAATGATGTCAGATACAATGGCATCAAAAGCTAGAATGGGCATTGAAATTGAAGAAGAATTTATTCTTCAA  1332

Query 1135  AAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGC  1208
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAGCCACTCTTCACATTGAATACATACAATGAACAGCAGATAATTTCTGACCCTAGACTTCGCTTCGAGTTAGC  1406

Query 1209  ACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTC  1282
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACTTCGAGAAGCTGGACTTCATAGAACACTTTATGCTAAAGAGATATTACCAAAAATTAGTCCTCAAAAACCTC  1480

Query 1283  CAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTGAAAATA  1317
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1481  CAAGAAAGGACATGGAGTCTACTGTATTTAAAATA  1515