Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472541
- Subject:
- XM_006513326.3
- Aligned Length:
- 3101
- Identities:
- 2761
- Gaps:
- 25
Alignment
Query 1 ATGCAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAACGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA 74
|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAAGATGGCGGACGCGAAGCAGAAGCGGAACGAGCAGCTGAAGCGCTGGATCGGCTCCGAGACGGACCTCGA 74
Query 75 GCCTCCGGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTGGCTGCTTGCTCCA 148
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||
Sbjct 75 GCCGCCCGTGGTGAAGCGCCAGAAGACCAAGGTGAAGTTCGACGATGGCGCCGTCTTCCTCGCCGCCTGCTCCA 148
Query 149 GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGGCGACACGGACGAGGTCCTCAAGCTGCTGCACCGCGGCGCCGACATCAATTACGCCAATGTGGACGGACTC 222
Query 223 ACTGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT 296
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCGCCCTGCACCAGGCTTGCATTGATGACAATGTTGATATGGTGAAGTTTCTGGTAGAAAATGGAGCAAATAT 296
Query 297 TAATCAACCTGATAATGAAGGCTGGATACCACTACATGCAGCAGCTTCCTGTGGATATCTTGATATTGCAGAGT 370
.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 CAATCAACCTGACAATGAAGGCTGGATACCACTCCATGCAGCTGCTTCCTGTGGATATCTCGATATTGCAGAGT 370
Query 371 TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGGGCTGTCAACAGTGAAGGAGATACACCTTTAGATATTGCGGAGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 371 TTTTGATTGGTCAAGGAGCACATGTAGGAGCTGTCAACAGTGAAGGAGACACACCTTTAGATATTGCAGAGGAG 444
Query 445 GAGGCAATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAAGTTAATCGGCAAGGGGTTGATATAGAAGCAGCTCGAAAGGAAGA 518
|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 445 GAGGCGATGGAAGAGCTACTTCAAAATGAGGTTAATCGGCAAGGTGTTGATATAGAAGCGGCTCGGAAAGAGGA 518
Query 519 AGAACGGATCATGCTTAGAGATGCCAGGCAGTGGCTAAATAGTGGTCATATAAATGATGTCCGGCATGCAAAAT 592
.||.|||.|.|||||.|||||.||.|||||||||.||||.||.||.||.||.|.|||.||||||||||||||.|
Sbjct 519 GGAGCGGGTAATGCTAAGAGACGCGAGGCAGTGGTTAAACAGCGGCCACATCAGTGACGTCCGGCATGCAAAGT 592
Query 593 CTGGAGGTACAGCACTTCACGTTGCAGCTGCTAAAGGCTATACGGAAGTTTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC 666
|.||.||.||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CCGGGGGCACAGCACTCCACGTGGCGGCCGCCAAAGGCTATACAGAAGTGTTAAAACTTTTAATACAGGCAGGC 666
Query 667 TATGATGTTAATATTAAAGACTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC 740
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TATGATGTTAATATTAAAGATTATGATGGCTGGACACCTCTTCATGCTGCAGCTCATTGGGGTAAAGAAGAAGC 740
Query 741 ATGTCGAATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGATGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG 814
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 ATGTCGGATTTTAGTGGACAATCTGTGTGATATGGAGACGGTCAACAAAGTGGGCCAAACAGCCTTTGATGTAG 814
Query 815 CAGATGAAGACATTTTAGGATATTTAGAAGAGTTGCAAAAGAAACAAAATCTGCTCCATAGTGAAAAACGGGAC 888
||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 815 CAGATGAAGACATTTTGGGATATCTAGAAGAGTTGCAAAAAAAACAAACTCTGCTCCATAGTGAGAAGCGGGAT 888
Query 889 AAGAAATCTCCACTAATTGAATCAACAGCAAATATGGACAATAATCAGTCACAGAAGACCTTTAAAAACAAAGA 962
||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||.||.|||||..||||||||.|.|||||||||||.||
Sbjct 889 AAGAAATCTCCACTGATCGAGTCCACAGCAAATATGGAAAACAATCAACCACAGAAGGCTTTTAAAAACAAGGA 962
Query 963 GACGTTGATTATTGAACCAGAGAAAAATGCATCCCGTATTGAATCTCTGGAACAAGAAAAGGTTGATGAAGAAG 1036
.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.||||.||||||.||.|
Sbjct 963 AACGTTGATTATTGAGCCAGAGAAAAATGCATCTCGCATCGAGTCTCTGGAGCATGAGAAGGCTGATGAGGAGG 1036
Query 1037 AAGAAGGAAAGAAGGATGAGTCTAGCTGCTCTAGTGAAGAAGATGAGGAAGATGACTCGGAATCAGAAGCTGAA 1110
|||||||.||||||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||.||.
Sbjct 1037 AAGAAGGCAAGAAGGACGAGTCGAGCTGTTCCAGTGAGGAGGACGAGGAGGACGATTCAGAGTCAGAGGCAGAG 1110
Query 1111 ACAGATAAGACAAAACCCCTGGCTTCTGTAACTAATGCCAACACTTCTAGTACACAAGCAGCTCCTGTAGCTGT 1184
||||||||||||||.|||.||||||||||||..|||||..|.|||||.||.||.||.|||||.||||.||||||
Sbjct 1111 ACAGATAAGACAAAGCCCATGGCTTCTGTAAGCAATGCTCATACTTCCAGCACGCAGGCAGCCCCTGCAGCTGT 1184
Query 1185 TACAACACCTACTGTGTCATCAGGTCAAGCA----ACACCTACATCACCTATTAAAAAGTTTCCAACCACAGCT 1254
||||.||||||||.||||.|| |||.|| ||.||||||||||||.|||||||||||||||...|..||
Sbjct 1185 TACAGCACCTACTCTGTCTTC----CAACCAGGGGACCCCTACATCACCTGTTAAAAAGTTTCCAATATCGACT 1254
Query 1255 ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAAGAGAGAAAAGATGAGTCTCCTGCAACTTGGAGGTTAGGACTTAGAAAGAC 1328
|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1255 ACAAAAATTTCTCCCAAAGAAGAGGAAAGAAAAGATGAGTCTCCTGCATCCTGGAGGTTAGGGCTTCGAAAGAC 1328
Query 1329 GGGCAGCTATGGTGCACTTGCTGAAATCACAGCATCTAAAGAGGGTCAGAAAGAAAAAGATACTGCAGGTGTTA 1402
.|||||.||.|||||.||.||||||||||..||.||||||||.|..|||||.||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1329 TGGCAGTTACGGTGCCCTGGCTGAAATCAGTGCGTCTAAAGAAGCCCAGAAGGAGAAAGACACTGCAGGGGTGA 1402
Query 1403 CACGTTCAGCTTCAAGTCCCAGACTTTCCTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAGTAAAGGAACT 1476
..||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||.
Sbjct 1403 TGCGGTCGGCTTCCAGTCCGAGACTCTCGTCCTCTTTGGATAATAAAGAAAAGGAGAAAGATAACAAAGGAACG 1476
Query 1477 AGGCTTGCATATGTTGCACCTACAATACCAAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAAGAAAACAG 1550
||.|||||.|||||..|.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1477 AGACTTGCGTATGTCACCCCTACAATCCCGAGACGACTAGCCAGTACATCTGACATTGAAGAGAAGGAGAACAG 1550
Query 1551 AGATTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCATATACAAGGAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAAAATAGCT 1624
|||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct 1551 AGAGTCTTCAAGTTTGCGAACAAGTAGTTCTTACACAAGAAGAAAATGGGAAGATGATCTTAAAAAGAATAGTT 1624
Query 1625 CAGTTAATGAAGGATCAACGTATCATAAAAGTTGCTCCTTTGGTAGAAGACAAGATGATTTGATTAGTTCTAGT 1698
|..|.|||||||||||.||.||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1625 CGATCAATGAAGGATCCACTTACCATAGAAGTTGCTCCTTTGGTAGAAGACAAGATGATTTGATTAGTTGTAGT 1698
Query 1699 GTTCCAAGCACCACATCAACACCAACAGTTACCTCTGCAGCTGGGCTTCAGAAAAGCCTGCTTTCCAGCACAAG 1772
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||.|.||||||||||||
Sbjct 1699 GTTCCAAGCACCACATCAACACCAACAGTTACCTCTGCAGCGGGGCTTCAGAGAAGCCTCCCTTCCAGCACAAG 1772
Query 1773 CACTACTACAAAGATTACAACGGGTTCTTCCTCAGCAGGCACACAAAGCAGTACCTCAAATCGTTTGTGGGCTG 1846
||||.||.||||||.|.|..|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1773 CACTGCTGCAAAGACTCCCCCGGGTTCCTCCTCCGCAGGCACACAGAGCAGTACCTCAAATCGTTTGTGGGCTG 1846
Query 1847 AGGATAGTACTGAGAAAGAAAAGGACAGTGTTCCTACGGCAGTGACCATTCCTGTTGCTCCAACTGTTGTAAAT 1920
||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1847 AGGATAGTACTGAGAAAGAAAAGGACAGTGCTCCTACTGCAGTGACCATTCCTGTGGCTCCAACTGTTGTAAAT 1920
Query 1921 GCTGCAG---CTTCTACCACAACCCTGACTACAACTACTGCTGGCACTGTCTCCTCCACAACAGAGGTCAGGGA 1991
||||||| ||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||| |||||||||||
Sbjct 1921 GCTGCAGCTCCTTCCACCACCACCCTGACTACAACTACTGCTGGCACTGTTTCC---------GAGGTCAGGGA 1985
Query 1992 GAGACGCAGATCATACCTCACTCCTGTTAGGGATGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAG 2065
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1986 GAGACGCAGGTCATACCTCACTCCTGTTAGGGACGAAGAGTCTGAATCCCAAAGAAAAGCAAGATCTAGACAAG 2059
Query 2066 CAAGACAATCTAGAAGATCAACACAGGGAGTGACATTAACTGATCTTCAAGAAGCTGAGAAAACAATAGGAAGA 2139
|||||||.||||||.|.|||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2060 CAAGACAGTCTAGACGGTCAACACAGGGGGTAACACTGACTGATCTTCAGGAAGCTGAAAAAACAATAGGAAGA 2133
Query 2140 AGTCGTTCTACCCGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAAAAAGAAAAAGAGGAAAAAGAGAAACAAGATAAAGA 2213
|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 2134 AGTCGTTCTACGAGAACCAGAGAACAAGAAAATGAAGAGAAAGAAAAAGAAGAAAAGGAAAAGCAGGATAAAGA 2207
Query 2214 GAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAACATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTACTCCAGAACGTATG 2287
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 2208 GAAACAAGAAGAAAAGAAGGAGTCAGAAGCATCTAGAGAAGATGAATATAAACAAAAGTATTCAAGAACATACG 2281
Query 2288 ATGAGACTTAC-CAGCGTTATAGGCCAGTATCAACTTCAAGTTCAACCACTC---CATCCTCTTCACTTTCTAC 2357
||||||||||| || ||||||||.||.||.||||||||||||||||.|.||| |.||.||.|||||.|||||
Sbjct 2282 ATGAGACTTACACA-CGTTATAGACCTGTGTCAACTTCAAGTTCAAGCGCTCCGTCGTCGTCCTCACTCTCTAC 2354
Query 2358 TATGAGCAGTTCACTGTATGCTTCAAGTCAACTAAACAGGCCAAATAGTCTTGTAGGCATAACTTCTGCTTACT 2431
|.|..||||..||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 2355 TCTAGGCAGCACACTCTATGCCTCAAGTCAGCTCAACAGGCCAAACAGTCTTGTAGGTATAACCTCTGCCTACT 2428
Query 2432 CCAGAGGAATAACAAAAGAAAATGAAAGAGAGGGAGAAAAAAGAGAAGAGGAGAAAGAAGGAGAAGATAAATCA 2505
||.|.|||.||.|.||||||||.||.|||||||||||.||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2429 CCCGGGGATTAGCCAAAGAAAACGAGAGAGAGGGAGAGAAAAAAGAAGAGGAGAAAGAAGGGGAAGATAAGTCA 2502
Query 2506 CAACCTAAATCAATCAGAGAACGACGACGACCAAGAGAGAAAAGAAGATCTACAGGAGTTTCATTTTGGACACA 2579
||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||..||.|.|||||.|||||.||.||.||||||||
Sbjct 2503 CAGCCTAAGTCAATCAGAGAACGACGGCGACCCAGAGAAAAGCGACGGTCTACTGGAGTCTCCTTCTGGACACA 2576
Query 2580 AGATAGTGATGAAAATGAACAAGAACAACAATCAGACACAGAAGAGGGATCCAATAAGAAAGAAACTCAGACGG 2653
||||||||||||||||||.|||||.|..|||||.|||||.||.||.||.||||..||||.|||.||.|||||||
Sbjct 2577 AGATAGTGATGAAAATGAGCAAGAGCGGCAATCGGACACTGAGGACGGCTCCAGCAAGAGAGAGACGCAGACGG 2650
Query 2654 ATTCCATTTCTAGATATGAAACCAGTTCTACATCAGCTGGTGATCGATATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGGA 2727
||||..||||.||.|||||.|.||||||.||||||.|..|||||||.|||||||||||||||||||||||||..
Sbjct 2651 ATTCTGTTTCCAGGTATGACAGCAGTTCCACATCATCAAGTGATCGGTATGATTCCTTGCTGGGTCGCTCTGCT 2724
Query 2728 TCATACAGTTACTTAGAAGAAAGAAAACCTTACAGCAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTTAAAAA 2801
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2725 TCATACAGTTACTTAGAAGACAGAAAACCTTACAGTAGCAGGCTAGAAAAGGATGACTCAACTGACTTCAAAAA 2798
Query 2802 GCTTTATGAACAAATTCTAGCTGAAAATGAAAAGCTGAAGGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACAG 2875
||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2799 GCTTTATGAACAAATTTTAGCTGAAAATGAAAAGCTAAAAGCACAGCTACATGATACAAATATGGAACTAACGG 2872
Query 2876 ATCTTAAATTACAGTTGGAAAAGGCCACCCAGAGACAAGAAAGATTTGCTGATAGATCACTGTTGGAAATGGAA 2949
||||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||.||.||||..|||||.||||||
Sbjct 2873 ATCTAAAGTTGCAGTTGGAAAAGGCTACCCAGAGACAAGAACGATTTGCTGACAGGTCACAATTGGAGATGGAA 2946
Query 2950 AAAAGGGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATCTGAAATGGAAGAAGAGCTCAAAATGTTACCAGACCTAAA 3023
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2947 AAAAGGGAACGAAGAGCTCTAGAAAGAAGAATATCTGAAATGGAAGAAGAGCTCAAAATGTTACCAGACTTAAA 3020
Query 3024 AGCAGACAACCAGAGGCTAAAGGATGAAAATGGGGCCTTGATCAGAGTTATAAGCAAACTTTCCAAA 3090
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 3021 GGCAGACAACCAGAGGCTAAAGGATGAAAATGGAGCCTTGATCAGAGTTATAAGCAAACTTTCCAAG 3087