Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472545
- Subject:
- NM_001286032.1
- Aligned Length:
- 2237
- Identities:
- 1535
- Gaps:
- 412
Alignment
Query 1 ATGGAAGAAGAAGGGCTGGAGTGTCCAAACTCTTCCTCTGAAAAACGCTATTTTCCTGAATCCCTGGATTCCAG 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CGATGGGGATGAGGAAGAGGTTTTGGCCTGTGAGGATTTGGAACTTAACCCCTTTGATGGATTGCCATATTCAT 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CACGTTATTATAAACTTCTGAAAGAAAGAGAAGATCTTCCTATATGGAAAGAAAAATACTCCTTTATGGAGAAC 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CTGCTTCAAAATCAAATCGTGATTGTTTCAGGAGATGCTAAATGTGGTAAGAGCGCTCAGGTTCCTCAGTGGTG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TGCTGAATATTGTCTTTCCATCCACTACCAGCACGGGGGCGTGATATGCACACAGGTCCACAAGCAGACTGTGG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 TCCAGCTCGCCCTGCGGGTGGCGGATGAAATGGATGTTAACATTGGTCATGAGGTTGGCTACGTGATCCCTTTC 444
||||||||.||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct 1 -----------------------------ATGGATGTGAATATCGGGCACGAAGTCGGCTATGTGATTCCTTTT 45
Query 445 GAGAACTGCTGTACCAACGAAACAATCCTGAGGTATTGTACTGATGATATGCTGCAAAGAGAAATGATGTCCAA 518
|||||||||||.||||..|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 46 GAGAACTGCTGCACCACTGAAACAATCCTGAGGTACTGTACTGATGACATGCTGCAGAGAGAGATGATGTCCAA 119
Query 519 TCCTTTTTTGGGTAGCTATGGGGTCATCATCTTAGATGATATTCATGAAAGAAGCATTGCAACTGATGTGTTAC 592
.|||||..|||||||||||||.|||||||||||.||.|||.|.||.||.||||||.|.||.|||||.|||.|.|
Sbjct 120 CCCTTTCCTGGGTAGCTATGGCGTCATCATCTTGGACGATGTCCACGAGAGAAGCCTGGCGACTGACGTGCTGC 193
Query 593 TTGGACTTCTTAAAGATGTTTTACTAGCAAGACCAGAACTGAAGCTCATAATTAACTCCTCACCTCACCTGATC 666
|.|||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||.||||||.|||.||||.|||.|.|
Sbjct 194 TCGGACTCCTTAAAGATGTGCTGCTGGCAAGACCAGAGCTGAAGCTCATAGTTAACTGCTCGCCTCTCCTCACC 267
Query 667 AGCAAACTCAATTCTTATTATGGAAACGTGCCTGTCATAGAAGTGAAAAATAAACACCCTGTGGAGGTTGTGTA 740
||.|||||||.|||.||.||||||.|||||||||||||||||||||.||||||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct 268 AGTAAACTCAGTTCCTACTATGGAGACGTGCCTGTCATAGAAGTGAGAAATAAGCACCCGGTGGAGGTGGTGTA 341
Query 741 CCTTAGTGAGGCTCAAAAGGATTCTTTTGAGTCTATTTTACGCCTTATCTTTGAAATTCACCACTCGGGTGAGA 814
||||||||.||||||.||||||||.||.||||||.|..|||||||||||||||||||.||||.|||||||||||
Sbjct 342 CCTTAGTGGGGCTCAGAAGGATTCCTTCGAGTCTGTCATACGCCTTATCTTTGAAATCCACCGCTCGGGTGAGA 415
Query 815 AAGGTGACATTGTAGTCTTTCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAGAAAGTCTGTGAAACTGTCTATC---AAGGA 885
|.||||||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||..||.||||..|||.|.|| |||||
Sbjct 416 AGGGTGACGTTGTGGTCTTCCTGGCCTGTGAACAAGATATTGAAAAAACCTATGAACTTGTGTGTCAGGAAGGA 489
Query 886 TCTAACCTAAACCCAGATCTTGGAGAACTGGTGGTTGTTCCTTTGTATCCAAAAGAGAAATGTTCA--TTGTTC 957
||.|||.|||||||||||.|.||.||.||||||||..|.|||||||||||.|||||||| ||.|| .|||||
Sbjct 490 TCCAACTTAAACCCAGATGTGGGCGACCTGGTGGTCATCCCTTTGTATCCCAAAGAGAA--GTGCAGCCTGTTC 561
Query 958 AAGCCACTCGATGAAACAGAAAAAAGATGCCAAGTTTATCAAAGAAGAGTGGTGTTAACTACTAGCTCTGGAGA 1031
|.||||.|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||||||.|.||.||.||||..||.||
Sbjct 562 AGGCCAGTGGACGAAACCGAGAAAAGATGCCAAGTGTATCAGAGACGGGTGGTGCTGACCACCAGCTGCGGGGA 635
Query 1032 GTTTTTGATCTGGAGCAACTCAGTCAGATTTGTTATCGATGTGGGTGTGGAAAGAAGAAAGGTGTACAACCCGA 1105
||.|.|||||||||||.||.|.||||.||||||.||.|||||.|||.|||||||||||.||||.||.|||||..
Sbjct 636 GTCTCTGATCTGGAGCCACACGGTCAAATTTGTCATTGATGTTGGTCTGGAAAGAAGACAGGTATATAACCCCC 709
Query 1106 GAATAAGAGCAAACTCGCTCGTCATGCAGCCCATCAGCCAGAGCCAGGCAGAGATACGCAAGCAGATTCTTGGC 1179
|.||.|||||.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||.|.||.||.
Sbjct 710 GGATCAGAGCCAACTCCCTCGTCCTGCAGCCCATCAGCCAAAGCCAAGCAGAGATCCGGAAGCAGCTCCTCGGG 783
Query 1180 TCATCTTCTTCAGGAAAATTTTTCTGCCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAAAGACATGACGCCACTGAAGCC 1253
||.|||.|.|||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||.|||||
Sbjct 784 TCTTCTCCCTCAGGAAAACTTTTCTGTCTGTACACTGAAGAATTTGCCTCCAAAGACATGAGGCCCCTTAAGCC 857
Query 1254 AGCAGAAATGCAGGAAGCCAACCTAACAAGCATGGTGCTTTTTATGAAGAGGATAGACATTGCGGGCCTAGGCC 1327
|||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||.|.||||||||.|||||.||||
Sbjct 858 AGCGGAAATGCAGGAAGCCAACCTGACTAGCATGGTGCTCTTCATGAAGAGGGTGGACATTGCAGGCCTGGGCC 931
Query 1328 ACTGTGACTTCATGAACAGACCAGCACCAGAAAGTTTGATGCAGGCATTGGAAGACTTAGATTATCTGGCAGCA 1401
.|||.||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||||||.|||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 932 GCTGCGACTTCATGAACAGGCCAGCTCCAGAAAGCCTGATGCAGGCACTGGAAGATTTAGATTACCTGGCAGCC 1005
Query 1402 CTGGATAATGATGGAAATCTTTCTGAATTTGGAATCATCATGTCAGAGTTTCCTCTTGATCCACAACTCTCGAA 1475
|||||.||.|||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 1006 CTGGACAACGATGGGAATCTCTCTGAGTTTGGAATCATCATGTCTGAGTTTCCTCTGGATCCACAGCTCTCAAA 1079
Query 1476 GTCTATCTTAGCGTCCTGTGAATTTGACTGTGTAGATGAAGTGCTAACAATCGCGGCCATGGTAACAGCTCCAA 1549
||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1080 GTCTATCTTAGCATCCTGTGAATTTGACTGTGTAGACGAAATGCTAACCATCGCTGCCATGGTAACAGCTCCCA 1153
Query 1550 ATTGCTTTTCACATGTGCCACATGGAGCTGAAGAGGCTGCCTTGACTTGTTGGAAGACATTTTTACATCCCGAA 1623
.||||||||..||.|||||.|||||.|||||.||||||||..|||||||.|||||.||.||.||.||.||.|||
Sbjct 1154 GTTGCTTTTTGCACGTGCCTCATGGTGCTGAGGAGGCTGCAGTGACTTGCTGGAAAACGTTCTTGCACCCTGAA 1227
Query 1624 GGAGATCACTTTACCCTCATCAGCATTTACAAGGCTTACCAAGACACAACTCTGAATTCTAGCAGTGAGTACTG 1697
||.|||||||||||.|||||||...|.|||||.||.||||||||.|||..||||||.|||..||.|||..||||
Sbjct 1228 GGTGATCACTTTACGCTCATCAATGTCTACAATGCCTACCAAGATACAGTTCTGAACTCTGCCAATGAACACTG 1301
Query 1698 TGTGGAAAAGTGGTGTCGTGATTACTTCCTCAACTGTTCAGCACTCAGAATGGCAGATGTTATTCGAGCTGAAC 1771
||||||.|.||||||||..||||.||||||||.|||.||.||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 1302 TGTGGAGATGTGGTGTCACGATTGCTTCCTCAGCTGCTCTGCTCTCAGGATGGCAGACGTTATCCGAGCAGAAC 1375
Query 1772 TCTTAGAAATTATCAAGCGAATCGAGCTTCCCTATGCAGAACCTGCTTTTGGCTCCAAGGAAAACACTCTAAAC 1845
|||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||....|.|||
Sbjct 1376 TCTTAGAGATCATCAAGCGGATCGAGCTTCCCTATGCAGAGCCTGCCTTTGGCTCCAAGGAAAACGGGTTGAAC 1449
Query 1846 ATAAAGAAAGCTCTTCTGTCCGGTTACTTTATGCAGATTGCTCGGGATGTTGATGGATCAGGTAACTACTTAAT 1919
||.||||||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1450 ATCAAGAAAGCGCTGCTCTCTGGGTACTTCATGCAGATTGCTCGGGATGTTGACGGGTCAGGTAACTACTTGAT 1523
Query 1920 GCTGACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCCTGTCTGGTTACTCAATCACCAAGAAGATGCCAGAGTGGG 1993
|||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||..|.||.||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1524 GCTTACACATAAGCAGGTTGCTCAGCTGCATCCCTTATCAAGCTATTCCATCACCAAGAAGATGCCCGAGTGGG 1597
Query 1994 TCCTCTTCCATAAATTCAGCATTTCTGAGAACAACTACATCAGGATTACCTCAGAAATCTCTCCTGAACTATTT 2067
||||||||||..|.||||||||.|||||||||||||||||||||.|..||||.|.|.||||.|||||.||||||
Sbjct 1598 TCCTCTTCCACCAGTTCAGCATATCTGAGAACAACTACATCAGGGTCGCCTCCGCAGTCTCCCCTGAGCTATTT 1671
Query 2068 ATGCAGCTGGTACCACAATACTATTTCAGTAATCTGCCTCCTAGTGAAAGTAAGGACATTCTACAGCAAGTAGT 2141
|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||..|.
Sbjct 1672 ATGCAGCTGGTACCACAGTACTATTTCAGTAACCTGCCTCCTAGTGAAAGCAAGGACATCCTACAGCAAGCTGC 1745
Query 2142 GGATCACCTATCCCCTGTGTCAACAATGAATAAGGAACAGCAAATGTGTGAGACGTGCCC---TGAAACTGAAC 2212
.|..||||||.||.|.| .|||..||||.|||||.|||.|..|||||||.|.|||||| ||..|||||.|
Sbjct 1746 AGGCCACCTACCCACAG---AAACTGTGAACAAGGACCAGGATGTGTGTGACAAGTGCCCAGATGCTACTGAGC 1816
Query 2213 AGAGATGCACTCTCCAG 2229
||||||||||..|||||
Sbjct 1817 AGAGATGCACAATCCAG 1833