Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000472554
- Subject:
- NM_001199492.1
- Aligned Length:
- 1407
- Identities:
- 1362
- Gaps:
- 43
Alignment
Query 1 ATGGATGTAGAAAATGAGCAGATACTGAATGTAAACCCTGCAGATCCTGATAACTTAAGTGACTCTCTCTTTTC 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGATGTAGAAAATGAGCAGATACTGAATGTAAACCCTGC--------------------------------- 41
Query 75 CGGTGATGAAGAAAATGCTGGGACTGAGGAAGTAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCAGCATACTCCA 148
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 42 ---------AGAAAATGCTGGGACTGAGGAAATAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCAGCATCCTCCA 106
Query 149 TTAACGAAGCTAGAATTAATGCCAAGGCAAAAAGGCGACTAAGGAAAAACTCATCCCGGGACTCTGGCAGAGGC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 107 TTAACGAAGCTAGAATTAATGCCAAGGCAAAAAGGCGACTAAGGAAAAACTCATCCCGGGACTCTGGCAGAGGC 180
Query 223 GATTCGGTCAGCGACAGTGGGAGTGACGCCCTTAGAAGTGGATTAACTGTGCCAACCAGTCCAAAGGGAAGGTT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 181 GATTCGGTCAGCGACAGTGGGAGTGACGCCCTTAGAAGTGGATTAACTGTGCCAACCAGTCCAAAGGGAAGGTT 254
Query 297 GCTGGATAGGCGATCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGACTACCAAAGAAAGGTGGTGCAGGAGGCAAAGGTGTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 255 GCTGGATAGGCGATCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGACTACCAAAGAAAGGTGGTGCAGGAGGCAAAGGTGTCT 328
Query 371 GGGGTACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAGGAGGTGGATGTGAAAGATCCTAACTATGATGATGACCAGGAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 329 GGGGTACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAGGAGGTGGATGTGAAAGATCCTAACTATGATGATGACCAGGAG 402
Query 445 AACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCTTTGGATGAAAGGGCATTTGAGAAGACTTTAACACCAATCATACA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 403 AACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCTTTGGATGAAAGGGCATTTGAGAAGACTTTAACACCAATCATACA 476
Query 519 GGAATATTTTGAGCATGGAGATACTAATGAAGTTGCGGAAATGTTAAGAGATTTAAATCTTGGTGAAATGAAAA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 477 GGAATATTTTGAGCATGGAGATACTAATGAAGTTGCGGAAATGTTAAGAGATTTAAATCTTGGTGAAATGAAAA 550
Query 593 GTGGAGTACCAGTGTTGGCAGTATCCTTAGCATTGGAGGGGAAGGCTAGTCATAGAGAGATGACATCTAAGCTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 551 GTGGAGTACCAGTGTTGGCAGTATCCTTAGCATTGGAGGGGAAGGCTAGTCATAGAGAGATGACATCTAAGCTT 624
Query 667 CTTTCTGACCTTTGTGGGACAGTAATGAGCACAACTGATGTGGAAAAATCATTTGATAAATTGTTGAAAGATCT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 625 CTTTCTGACCTTTGTGGGACAGTAATGAGCACAACTGATGTGGAAAAATCATTTGATAAATTGTTGAAAGATCT 698
Query 741 ACCTGAATTAGCACTGGATACTCCTAGAGCACCACAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 699 ACCTGAATTAGCACTGGATACTCCTAGAGCACCACAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGATG 772
Query 815 GAATTTTATGTAATACCTATATTGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTGCAGGCTAGAGCTGCTCTGGAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 773 GAATTTTATGTAATACCTATATTGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTGCAGGCTAGAGCTGCTCTGGAT 846
Query 889 AAGGCTACCGTGCTTCTGAGTATGTCTAAAGGTGGAAAGCGTAAAGATAGTGTGTGGGGCTCTGGAGGTGGGCA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 847 AAGGCTACCGTGCTTCTGAGTATGTCTAAAGGTGGAAAGCGTAAAGATAGTGTGTGGGGCTCTGGAGGTGGGCA 920
Query 963 GCAATCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTGAAAGAATATTTACTCTCTGGAGACATATCTG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 921 GCAATCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTGAAAGAATATTTACTCTCTGGAGACATATCTG 994
Query 1037 AAGCTGAACATTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCATGAGCTTGTATATGAAGCTATTATAATG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 995 AAGCTGAACATTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCATGAGCTTGTATATGAAGCTATTATAATG 1068
Query 1111 GTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTACATTTAAGATGATTTTGGATTTATTAAAGTCCCTTTGGAAGTCTTCTAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1069 GTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTACATTTAAGATGATTTTGGATTTATTAAAGTCCCTTTGGAAGTCTTCTAC 1142
Query 1185 CATTACTGTAGACCAAATGAAAAGAGGTTATGAGAGAATTTACAATGAAATTCCGGACATTAATCTGGATGTCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1143 CATTACTGTAGACCAAATGAAAAGAGGTTATGAGAGAATTTACAATGAAATTCCGGACATTAATCTGGATGTCC 1216
Query 1259 CACATTCATACTCTGTGCTGGAGCGGTTTGTAGAAGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCAGA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1217 CACATTCATACTCTGTGCTGGAGCGGTTTGTAGAAGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCAGA 1290
Query 1333 GATCTTTGTCCTTCAAGGGGCAGAAAGCGTTTTGTAAGCGAAGGAGATGGAGGTCGTCTTAAACCAG-GAGCTA 1405
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1291 GATCTTTGTCCTTCAAGGGGCAGAAAGCGTTTTGTAAGCGAAGGAGATGGAGGTCGTCTTAAACCAGAGAGCTA 1364
Query 1406 C 1406
|
Sbjct 1365 C 1365