Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472554
• Subject: NM_145341.3
• Aligned Length: 1407
• Identities: 1369
• Gaps: 34

Alignment

Query    1  ATGGATGTAGAAAATGAGCAGATACTGAATGTAAACCCTGCAGATCCTGATAACTTAAGTGACTCTCTCTTTTC  74
                         ||||.||.||                    |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------ATGACCAAAT--------------------ATCCTGATAACTTAAGTGACTCTCTCTTTTC  41

Query   75  CGGTGATGAAGAAAATGCTGGGACTGAGGAAGTAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCAGCATACTCCA  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct   42  CGGTGATGAAGAAAATGCTGGGACTGAGGAAATAAAGAATGAAATAAATGGAAATTGGATTTCAGCATCCTCCA  115

Query  149  TTAACGAAGCTAGAATTAATGCCAAGGCAAAAAGGCGACTAAGGAAAAACTCATCCCGGGACTCTGGCAGAGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  116  TTAACGAAGCTAGAATTAATGCCAAGGCAAAAAGGCGACTAAGGAAAAACTCATCCCGGGACTCTGGCAGAGGC  189

Query  223  GATTCGGTCAGCGACAGTGGGAGTGACGCCCTTAGAAGTGGATTAACTGTGCCAACCAGTCCAAAGGGAAGGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GATTCGGTCAGCGACAGTGGGAGTGACGCCCTTAGAAGTGGATTAACTGTGCCAACCAGTCCAAAGGGAAGGTT  263

Query  297  GCTGGATAGGCGATCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGACTACCAAAGAAAGGTGGTGCAGGAGGCAAAGGTGTCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  GCTGGATAGGCGATCCAGATCTGGGAAAGGAAGGGGACTACCAAAGAAAGGTGGTGCAGGAGGCAAAGGTGTCT  337

Query  371  GGGGTACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAGGAGGTGGATGTGAAAGATCCTAACTATGATGATGACCAGGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  GGGGTACACCTGGACAGGTGTATGATGTGGAGGAGGTGGATGTGAAAGATCCTAACTATGATGATGACCAGGAG  411

Query  445  AACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCTTTGGATGAAAGGGCATTTGAGAAGACTTTAACACCAATCATACA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  AACTGTGTTTATGAAACTGTAGTTTTGCCTTTGGATGAAAGGGCATTTGAGAAGACTTTAACACCAATCATACA  485

Query  519  GGAATATTTTGAGCATGGAGATACTAATGAAGTTGCGGAAATGTTAAGAGATTTAAATCTTGGTGAAATGAAAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  GGAATATTTTGAGCATGGAGATACTAATGAAGTTGCGGAAATGTTAAGAGATTTAAATCTTGGTGAAATGAAAA  559

Query  593  GTGGAGTACCAGTGTTGGCAGTATCCTTAGCATTGGAGGGGAAGGCTAGTCATAGAGAGATGACATCTAAGCTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  GTGGAGTACCAGTGTTGGCAGTATCCTTAGCATTGGAGGGGAAGGCTAGTCATAGAGAGATGACATCTAAGCTT  633

Query  667  CTTTCTGACCTTTGTGGGACAGTAATGAGCACAACTGATGTGGAAAAATCATTTGATAAATTGTTGAAAGATCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  CTTTCTGACCTTTGTGGGACAGTAATGAGCACAACTGATGTGGAAAAATCATTTGATAAATTGTTGAAAGATCT  707

Query  741  ACCTGAATTAGCACTGGATACTCCTAGAGCACCACAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  ACCTGAATTAGCACTGGATACTCCTAGAGCACCACAGTTGGTGGGCCAGTTTATTGCTAGAGCTGTTGGAGATG  781

Query  815  GAATTTTATGTAATACCTATATTGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTGCAGGCTAGAGCTGCTCTGGAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  GAATTTTATGTAATACCTATATTGATAGTTACAAAGGAACTGTAGATTGTGTGCAGGCTAGAGCTGCTCTGGAT  855

Query  889  AAGGCTACCGTGCTTCTGAGTATGTCTAAAGGTGGAAAGCGTAAAGATAGTGTGTGGGGCTCTGGAGGTGGGCA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  856  AAGGCTACCGTGCTTCTGAGTATGTCTAAAGGTGGAAAGCGTAAAGATAGTGTGTGGGGCTCTGGAGGTGGGCA  929

Query  963  GCAATCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTGAAAGAATATTTACTCTCTGGAGACATATCTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  930  GCAATCTGTCAATCACCTTGTTAAAGAGATTGATATGCTGCTGAAAGAATATTTACTCTCTGGAGACATATCTG  1003

Query 1037  AAGCTGAACATTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCATGAGCTTGTATATGAAGCTATTATAATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1004  AAGCTGAACATTGCCTTAAGGAACTGGAAGTACCTCATTTTCACCATGAGCTTGTATATGAAGCTATTATAATG  1077

Query 1111  GTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTACATTTAAGATGATTTTGGATTTATTAAAGTCCCTTTGGAAGTCTTCTAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1078  GTTTTAGAGTCAACTGGAGAAAGTACATTTAAGATGATTTTGGATTTATTAAAGTCCCTTTGGAAGTCTTCTAC  1151

Query 1185  CATTACTGTAGACCAAATGAAAAGAGGTTATGAGAGAATTTACAATGAAATTCCGGACATTAATCTGGATGTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1152  CATTACTGTAGACCAAATGAAAAGAGGTTATGAGAGAATTTACAATGAAATTCCGGACATTAATCTGGATGTCC  1225

Query 1259  CACATTCATACTCTGTGCTGGAGCGGTTTGTAGAAGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCAGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1226  CACATTCATACTCTGTGCTGGAGCGGTTTGTAGAAGAATGTTTTCAGGCTGGAATAATTTCCAAACAACTCAGA  1299

Query 1333  GATCTTTGTCCTTCAAGGGGCAGAAAGCGTTTTGTAAGCGAAGGAGATGGAGGTCGTCTTAAACCAG-GAGCTA  1405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
Sbjct 1300  GATCTTTGTCCTTCAAGGGGCAGAAAGCGTTTTGTAAGCGAAGGAGATGGAGGTCGTCTTAAACCAGAGAGCTA  1373

Query 1406  C  1406
            |
Sbjct 1374  C  1374