Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472583
• Subject: XM_011238377.2
• Aligned Length: 2058
• Identities: 1484
• Gaps: 378

Alignment

Query    1  ---------------ATGAAAGAGGCGGCCCTCATCTATCTTGACAGAAGTGGAGGCCTCCAAAAGTTTATAGA  59
                           |||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGACTCTTCAGATGAAAGAGGCAGCCCTTGTCTATCTTGACAGAAGTGGAGGCCTCCAAAAGTTTATAGA  74

Query   60  TGATTGCAAGTACTACAATGATTCAAAACAAAGCTATGCTGTCTATCGATTCAAAATTTTAATAAATCCCTCTG  133
            .||.|||||||.|||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||..|||.|||||.|.||||.||
Sbjct   75  CGACTGCAAGTCCTACAATGATTCAAAGCAGAGTTATGCTGTCTATCGGTTCAGTATTCTAATAGACCCCTGTG  148

Query  134  ATGTTGTTGAATTAGATGCTGAGCTTGGAAATCACATTTTACACCAACCTTTAAAAGCTGCTGAAGTCTTTCAA  207
            |.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||..|||.||||||
Sbjct  149  ACGTTGTTGAATTAGATGCTGACCTTGGAAATCACATTTTACACCATCCCTTAAAAGCTGCTCGAGTTTTTCAA  222

Query  208  TCAGTCTGTTTTATTGCTGTTAAGACTCTCTCATTAATTGGACAATTGCAGACTGAAACGCAAATTAATATAGT  281
            ||                                                            |||.|||||.||
Sbjct  223  TC------------------------------------------------------------AATCAATATTGT  236

Query  282  GCTGAAATTAACACATTTACCTCCCCTGCCAAGTTATGGTCTTGATCTTTGTGAGTTTCCACTTGATTATACAT  355
            ||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||..|||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct  237  GCTGAAGTTAACACATTTACCAGCCCTGCCAAGCTATACTCTTGATCTTTGTGAGTTTCCACTTAATTATGCAT  310

Query  356  CTCAGAGATTTTATATGATGCAAGGAATTGTGATTGCAATGACAACTATAACCAAGTATACACAAGGGGCAAGA  429
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||| 
Sbjct  311  CTCAGAGATTTTATATGATGCAAGGAATTGTGATTGCAATGACAACTATAACCAAGTACACTCAAGGTGCAAG-  383

Query  430  TTTCTT-TGTTCAGATGAAGCATGCCCTCTTTCAAAAGGATTTCAGTATATAAGAGTGCATGTGCCTGGTGCTA  502
            .||||| ||||||||||.||..||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct  384  GTTCTTGTGTTCAGATGGAGTGTGTCCTCTTTCAAAAGGATTTCAGTATGTGAGAGTCCATGTGCCTGGAGCTA  457

Query  503  CAGAATCTGCAACGATAAGAAATGACTTTTTGTGTAATCTATGTGCATCTTCACTTCAAGAAGACAGAAAATTT  576
            |||||||||||||..||||||||||||||||.||.|.|||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  458  CAGAATCTGCAACAGTAAGAAATGACTTTTTATGCAGTCTCTGTTCATCTTCACTTCAAGAAGACAGAAAATTT  531

Query  577  AGAGTACTTGGTGATAAACAAATAGTTGAAATAATTGCCACAAAGGCACTTCGTGCTTTTCAAGGATATTCTAA  650
            ||||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||||||.....|||.|||||||||||||.|.|||||
Sbjct  532  AGAGTACTTGGTGATAAACAGATAGTTGAAATAATCACCACAAAAATGTTTCATGCTTTTCAAGGAGACTCTAA  605

Query  651  CAACCAGCCATTTAGGTTTCAATCACTTACAATTTTCCTAAGAGATGAATCAGTGAATAAAATGAATATAGGAA  724
            .|||||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||..|||||||||.|||||.|||||||
Sbjct  606  AAACCAGCCATTTAGGTTTCAATCACTTGGTATTTTCCTAAGAGATGAACTAGTGAATAAGATGAAAATAGGAA  679

Query  725  ATGAATATAAAATTATTGGAATTCCAACCTGTGTAAAAACCTCACAAACTGCTGTCTGTATAGAAGCAAATAGC  798
            ||||||||||||||||||||||||||..||||||.|||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||..
Sbjct  680  ATGAATATAAAATTATTGGAATTCCAGTCTGTGTCAAAACTTCACAAACTGCTCTCTGTGTAGAAGCAAATAAT  753

Query  799  ATAACTTTTTGTAATT----------CAAAAGTTCCTTCAGGAATTAGTGACAACTTCAGGTGTCTCCTCTCCT  862
            ||.||          |          ||||||||||||.||||||||||||||||||.|||.||||||||||||
Sbjct  754  ATCAC----------TCCCCACACAGCAAAAGTTCCTTTAGGAATTAGTGACAACTTTAGGCGTCTCCTCTCCT  817

Query  863  TAACTTCCAGCTCATGCTGGAAGTTTACAGCAATACTTGCCAATATCTTTGCATCACAAATTACCCCTCCTGGG  936
            |.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.||.||||||.|||||||||||||.|||....||||||||
Sbjct  818  TGACTTCGAGCTCGTGCTGGAAATTCACAGCAATGCTGGCCAATGTCTTTGCATCACAGATTGTTGCTCCTGGG  891

Query  937  ACTTACAATTTGCTCAAGCTCTGTTTGTTGATGAGTCTAGTACAGACAACTGACCGTAACAAGGAACTGGAAGA  1010
            |||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||..|||.|.||||.|||||..|||||
Sbjct  892  ACTTACAATTTGCTCAAACTTTGTTTGTTGATGAGTCTAGTACAGACAAGAGACTGCAACAGGGAACGAGAAGA  965

Query 1011  TTGCCTGGATATTTTAATTATAACAAGTGATACTCTACTCATAGACAGGCTTCTGAATTTTAGCATAAACCTTG  1084
            .|||.|||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||..|||||||.|||.|||||||||||||.||.||||
Sbjct  966  CTGCTTGGATATTTTAGTTATAACCAGTGACACTCTGCTTGTAGACAGACTTTTGAATTTTAGCATGAATCTTG  1039

Query 1085  TCCCCCGTGGTATACGTCATCTAGTCTCTACTGAAATTTTTCCCACTCTATCCAGGAATAAGTATGGAACTGGA  1158
            ||.||||||||||||||||||..||||.|||.|||.|||||||.||..|.|||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1040  TCTCCCGTGGTATACGTCATCCTGTCTGTACAGAAGTTTTTCCTACAGTGTCCAGAAATAAATATGGAACAGGA  1113

Query 1159  GCAGTTAGCATTCAGGCTGGCAGTGCTTTGCTAGCTAAAGGTGGTATCTGCTTTATAGGAGACTTGGCTTCACA  1232
            |||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||.||.|.||.||
Sbjct 1114  GCAGTGAGCATTCAGGCCGGCAGTGCTTTGCTTGCTAAGGGTGGTATCTGCTTTATAGGAGACCTGACATCCCA  1187

Query 1233  CAAAAAAGATAAACTTGAACAGCTTCAAACAGTTCTGGAGAGCAGAAGCATCACAGTGTACATCCCAGGAAAGA  1306
            .|||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|.|||||.|.||||||||||||||
Sbjct 1188  TAAAAAAGATAAACTTGAACAGCTTCAATCAGCTTTGGAGAGCAGAAGCGTTACAGTATTCATCCCAGGAAAGA  1261

Query 1307  AGTTTGGGGAGGATATTGATCAACAGATGACTTTTCCAGTTCAGTGCAGTTTTTGGTCTTTTGTTGATGTGGAT  1380
            ||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1262  AGTTTGGGGATGATTTCGATCAGCAAATGACTTTTCCCATTCAGTGCAGTTTTTGGTCTTTTGTTGATATGGAT  1335

Query 1381  TCATCTTCAAGGAGAAATGCACAGAAAATCAACACTCTAATTGGTCAGATGGATTGCAGTTTGATTCCAGCTAA  1454
            |||||||||||||||||||..|||||||.||..|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1336  TCATCTTCAAGGAGAAATGTGCAGAAAACCAGTACTCTGATTGGTCAGATGGATTGCAGTTTGATTCCAGCCAA  1409

Query 1455  CCTTGTGGAGGCATTTGGTTTATTGATTAACTGCAACGAGTCATCTCCCTGCCACCCATTTCTTCCTACTGTGC  1528
            |||||..|||||||||||.|||.||||||||||||..|||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1410  CCTTGCAGAGGCATTTGGATTACTGATTAACTGCAGTGAGGCATCTCCTTGCCACCCACTTCTTCCTACTGTGC  1483

Query 1529  AACACACTTTGAACAAAGCCATTAATCCTGAAGGGCTGTT----TTATGCGGCTTCTAGACAGTTCACAACTGA  1598
            |.||||||||.||.|||||..|..|.|||||.||||||.|    |||    ||.||||..||||||||||||||
Sbjct 1484  AGCACACTTTAAAGAAAGCAGTGGAGCCTGAGGGGCTGCTGTACTTA----GCGTCTAAGCAGTTCACAACTGA  1553

Query 1599  AGATTTTGAAAAGCTATTGGCTTTTGCAAAGAATTTGAATGTAGAATTCAGCTTGGAAGCAGAAAGAATGACCC  1672
            |||.||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1554  AGACTTTGAAAAGCTACTGGCTTTTGCAAAGAGTTTGAATATGGAATTCAGCTTGGAAGCAGAAAGAATGATTC  1627

Query 1673  ATGGCTATTATCTAGCAAGTCGCAGAATCAGAACAGGCTCTGTATGTGGATCAAAGCTGTCAGCATCTGCATTA  1746
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||..|||.||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628  ATGGCTATTATCTAGCAAGTCGCAGAATAAGAACAGATTCTATACATGGATCAAAGCTGTCAGCATCTGCATTA  1701

Query 1747  AAA-------------TATCTG----------------------------------------------------  1755
            |||             ||||||                                                    
Sbjct 1702  AAATATTTAGTGTCTTTATCTGAAGCCCACGCCCGGCTGAGCCTAAGGACCACAGTGCTCAGAGAAGACGCACT  1775

Query 1756  --------------------------------------------------------------------------  1755
                                                                                      
Sbjct 1776  CATCGCAGCCTTGTTGTTGGAAATCTCTCTCACACTGAGATACGGGGCCACTCCATTTTGTGTTGCTCCCAATG  1849

Query 1756  --------------------------------------------------------------------------  1755
                                                                                      
Sbjct 1850  CATTATTTCCATTTGAGCTGTATAATGAAGAATATTTAGAGCAAAGAGATCTCTACCTGACTCAGTGCCAACAG  1923

Query 1756  ------------------------------------------------------------  1755
                                                                        
Sbjct 1924  CAGCTCCAACAGTTTATTGCCACATGTGGACCTGGGACAACTGTCTTTTCTAGTGATGAA  1983