Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472584
• Subject: NM_001190242.1
• Aligned Length: 2855
• Identities: 1906
• Gaps: 946

Alignment

Query    1  ATGCACAATTTTGAGGAAGAGTTAACTTGTCCCATATGTTATAGTATTTTTGAAGATCCTCGTGTACTGCCATG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTCTCATACATTTTGTAGAAATTGTTTGGAAAACATTCTTCAGGCATCTGGTAACTTTTATATATGGAGACCTT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TACGAATTCCACTCAAGTGCCCTAATTGCAGAAGTATTACTGAAATTGCTCCAACTGGCATTGAATCTTTACCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GTTAATTTTGCACTAAGGGCTATTATTGAAAAGTACCAGCAAGAAGACCATCCAGATATTGTCACCTGCCCTGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ACATTACAGGCAACCATTAAATGTTTACTGTCTATTAGATAAAAAATTAGTTTGTGGTCATTGCCTTACCATAG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GTCAACATCATGGTCATCCTATAGATGACCTTCAAAGTGCCTATTTGAAAGAAAAGGACACTCCTCAAAAACTG  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CTTGAACAGTTGACTGACACACACTGGACAGATCTTACCCATCTTATTGAAAAGCCGAAAGAACAAAAATCTCA  518
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  519  TTCTGAGAAAATGATCCAAGGCGATAAGGAAGCTGTTCTCCAGTATTTTAAGGAGCTTAATGATACATTAGAAC  592
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  593  AGAAAAAAAAAAGTTTCCTAACGGCTCTCTGTGATGTTGGCAATCTAATTAATCAAGAATATACTCCACAAATT  666
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  667  GAAAGAATGAAGGAAATACGAGAGCAGCAGCTTGAATTAATGGCACTGACAATATCTTTACAAGAAGAGTCTCC  740
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  741  ACTTAAATTTCTTGAAAAAGTTGATGATGTACGCCAGCATGTACAGATCTTGAAACAAAGACCACTTCCTGAGG  814
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  815  TTCAACCCGTTGAAATTTATCCTCGAGTAAGCAAAATATTGAAAGAAGAATGGAGCAGAACAGAAATTGGACAA  888
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  889  ATTAAGAACGTTCTCATTCCCAAAATG-------AAAATTT--CTC--CAAAAAGGATGTCATGTTCCTGGCCT  951
                                    |||       .||.|||  |||  |||                       
Sbjct    1  ------------------------ATGCTTAGATCAACTTTAGCTCAGCAA-----------------------  27

Query  952  GGAACACCAGTGTATTCAGTAGCGTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAGCAGCTAAT  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   28  GGAACACCAGTGTATTCAGTAGCGTGGGGCCCTGATTCAGAAAAGGTTCTTTATACAGCAGGCAAGCAGCTAAT  101

Query 1026  CATTAAACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTGCAGTGGAAAGCTCATGATGGCATTATTTTAAAAGTAGATT  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  102  CATTAAACCTCTTCAACCAAATGCTAAAGTTTTGCAGTGGAAAGCTCATGATGGCATTATTTTAAAAGTAGATT  175

Query 1100  GGAACTCGGTCAATGATCTTATTTTATCTGCTGGTGAAGACTGTAAATATAAGGTATGGGATAGTTACGGCCGC  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  176  GGAACTCGGTCAATGATCTTATTTTATCTGCTGGTGAAGACTGTAAATATAAGGTATGGGATAGTTACGGCCGC  249

Query 1174  CCACTGTACAATTCACAACCTCATGAGCATCCCATTACTTCAGTTGCCTGGGCTCCAGATGGAGAATTATTTGC  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  250  CCACTGTACAATTCACAACCTCATGAGCATCCCATTACTTCAGTTGCCTGGGCTCCAGATGGAGAATTATTTGC  323

Query 1248  TGTTGGATCGTTTCATACTTTACGCTTGTGTGATAAAACTGGGTGGTCATATGCATTAGAAAAACCCAACACTG  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  324  TGTTGGATCGTTTCATACTTTACGCTTGTGTGATAAAACTGGGTGGTCATATGCATTAGAAAAACCCAACACTG  397

Query 1322  GCAGCATATTTAATATTGCATGGTCTATCGATGGCACTCAGATTGCTGGAGCCTGTGGAAATGGACATGTCGTT  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  398  GCAGCATATTTAATATTGCATGGTCTATCGATGGCACTCAGATTGCTGGAGCCTGTGGAAATGGACATGTCGTT  471

Query 1396  TTTGCACATGTGGTGGAACAACATTGGGAGTGGAAAAATTTTCAAGTAACATTAACGAAAAGAAGAGCCATGCA  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  472  TTTGCACATGTGGTGGAACAACATTGGGAGTGGAAAAATTTTCAAGTAACATTAACGAAAAGAAGAGCCATGCA  545

Query 1470  GGTTCGTAATGTTCTTAATGATGCAGTGGATTTACTGGAATTCCGTGATAGAGTCATTAAAGCATCTTTGAACT  1543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  546  GGTTCGTAATGTTCTTAATGATGCAGTGGATTTACTGGAATTCCGTGATAGAGTCATTAAAGCATCTTTGAACT  619

Query 1544  ATGCACACTTAGTTGTTTCAACGTCTCTTCAATGTTACGTGTTCTCCACGAAGAACTGGAACACACCAATTATA  1617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  620  ATGCACACTTAGTTGTTTCAACGTCTCTTCAATGTTACGTGTTCTCCACGAAGAACTGGAACACACCAATTATA  693

Query 1618  TTTGATCTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTGATTCTGCAGGCAGAAAGACATTTTCTTCTTGTAGATGGTAGTAG  1691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  694  TTTGATCTCAAAGAAGGAACTGTTAGTTTGATTCTGCAGGCAGAAAGACATTTTCTTCTTGTAGATGGTAGTAG  767

Query 1692  TATCTATTTATATTCATATGAAGGGCGCTTTATTTCATCTCCAAAATTTCCTGGAATGAGAACAGATATTCTGA  1765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  768  TATCTATTTATATTCATATGAAGGGCGCTTTATTTCATCTCCAAAATTTCCTGGAATGAGAACAGATATTCTGA  841

Query 1766  ATGCACAGACTGTGTCTTTGAGTAATGATACCATAGCAATAAGAGACAAAGCTGATGAAAAAATAATCTTCCTC  1839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  842  ATGCACAGACTGTGTCTTTGAGTAATGATACCATAGCAATAAGAGACAAAGCTGATGAAAAAATAATCTTCCTC  915

Query 1840  TTTGAGGCATCAACCGGAAAGCCGTTAGGTGATGGAAAGTTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTTGGAAATTGC  1913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  916  TTTGAGGCATCAACCGGAAAGCCGTTAGGTGATGGAAAGTTTCTTTCTCATAAGAATGAAATCTTGGAAATTGC  989

Query 1914  TCTGGATCAAAAAGGACTTACCAATGATAGAAAAATTGCTTTCATTGATAAAAATAGAGATCTCTGTATCACTT  1987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  990  TCTGGATCAAAAAGGACTTACCAATGATAGAAAAATTGCTTTCATTGATAAAAATAGAGATCTCTGTATCACTT  1063

Query 1988  CTGTGAAACGATTTGGGAAGGAAGAACAAATTATCAAGCTTGGAACAATGGTGCATACTTTGGCATGGAACGAT  2061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1064  CTGTGAAACGATTTGGGAAGGAAGAACAAATTATCAAGCTTGGAACAATGGTGCATACTTTGGCATGGAACGAT  1137

Query 2062  ACATGCAATATCCTTTGTGGACTTCAAGATACTCGATTTATAGTGTGGTATTACCCCAATACAGTTTATGTGGA  2135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1138  ACATGCAATATCCTTTGTGGACTTCAAGATACTCGATTTATAGTGTGGTATTACCCCAATACAGTTTATGTGGA  1211

Query 2136  CAGAGACATTTTGCCTAAAACATTATATGAAAGGGATGCAAGTGAATTTAGTAAAAATCCCCATATTGTGAGTT  2209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1212  CAGAGACATTTTGCCTAAAACATTATATGAAAGGGATGCAAGTGAATTTAGTAAAAATCCCCATATTGTGAGTT  1285

Query 2210  TTGTTGGAAATCAAGTAACTATTAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTTCACATCAGCATAACACCATATCCTGCT  2283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1286  TTGTTGGAAATCAAGTAACTATTAGAAGAGCTGATGGCTCCCTGGTTCACATCAGCATAACACCATATCCTGCT  1359

Query 2284  ATTCTCCATGAATATGTAAGCAGTTCAAAATGGGAAGATGCTGTGAGACTTTGTCGCTTTGTTAAGGAGCAAAC  2357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1360  ATTCTCCATGAATATGTAAGCAGTTCAAAATGGGAAGATGCTGTGAGACTTTGTCGCTTTGTTAAGGAGCAAAC  1433

Query 2358  CATGTGGGCTTGTCTAGCTGCTATGGCAGTTGCTAATCGAGATATGACTACTGCAGAAGTAGCCTATGCAGCAA  2431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1434  CATGTGGGCTTGTCTAGCTGCTATGGCAGTTGCTAATCGAGATATGACTACTGCAGAAATAGCCTATGCAGCAA  1507

Query 2432  TTGGTGAAATTGATAAGGTTCAGTACATCAATTCTATAAAAAATCTTCCATCTAAAGAATCAAAAATGGCCCAC  2505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1508  TTGGTGAAATTGATAAGGTTCAGTACATCAATTCTATAAAAAATCTTCCATCTAAAGAATCAAAAATGGCCCAC  1581

Query 2506  ATACTACTGTTTAGTGGGAACATACAGGAGGCTGAAATAGTACTTCTTCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCAAT  2579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1582  ATACTACTGTTTAGTGGGAACATACAGGAGGCTGAAATAGTACTTCTTCAGGCTGGCCTTGTTTATCAAGCAAT  1655

Query 2580  CCAGATCAATATTAATCTCTACAACTGGGAAAGGGCACTGGAATTGGCTGTAAAATACAAAACACATGTTGATA  2653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1656  CCAGATCAATATTAATCTCTACAACTGGGAAAGGGCACTGGAATTGGCTGTAAAATACAAAACACATGTTGATA  1729

Query 2654  CAGTTCTTGCTTACCGTCAAAAGTTTTTGGAGACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATACTTGCATTAT  2727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1730  CAGTTCTTGCTTACCGTCAAAAGTTTTTGGAGACATTTGGTAAACAGGAAACTAATAAACGATACTTGCATTAT  1803

Query 2728  GCAGAAGGTCTCCAAATAGATTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACAAAAGAAAGAGAGCA  2801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1804  GCAGAAGGTCTCCAAATAGATTGGGAGAAAATCAAAGCCAAAATTGAGATGGAAATTACAAAAGAAAGAGAGCA  1877

Query 2802  ATCATCAAGCAGCCAATCCAGCAAGAGTATAGGTTTAAAGCCC  2844
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1878  ATCATCAAGCAGCCAATCCAGCAAGAGTATAGGTTTAAAGCCC  1920