Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000472656
Subject:
XM_017015791.2
Aligned Length:
969
Identities:
819
Gaps:
78

Alignment

Query   1  ATGGATTCCAAACACCAGTGTGTAAAGCTAAATGATGGCCACTTCATGCCTGTATTGGGATTTGGCACCTATGC  74
           ||||||||.|||.|.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATTCGAAATATCAGTGTGTGAAGCTGAATGATGGTCACTTCATGCCTGTCCTGGGATTTGGCACCTATGC  74

Query  75  ACCTCCAGAGGTTCCAAGAAGTAAAGCTTTGGAGGTCACAAAATTAGCAATAGAAGCTGGGTTCCGCCATATAG  148
           .|||.||||||||||.|.||||||||||||.||||.|||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|
Sbjct  75  GCCTGCAGAGGTTCCTAAAAGTAAAGCTTTAGAGGCCACCAAATTGGCAATTGAAGCTGGCTTCCGCCATATTG  148

Query 149  ATTCTGCTCATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  ATTCTGCTCATTTATACAATAATGAGGAGCAGGTTGGACTGGCCATCCGAAGCAAGATTGCAGATGGCAGTGTG  222

Query 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTCCACTTTTCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||..|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AAGAGAGAAGACATATTCTACACTTCAAAGCTTTGGTGCAATTCCCATCGACCAGAGTTGGTCCGACCAGCCTT  296

Query 297  GGAAAACTCACTGAAAAAAGCTCAATTGGACTATGTTGACCTCTATCTTATTCATTCTCCAATGTCTCTAAAGC  370
           |||||..|||||||||||...|||||||||.||||||||||||||.||||||||||.||||.|||||.|||   
Sbjct 297  GGAAAGGTCACTGAAAAATCTTCAATTGGATTATGTTGACCTCTACCTTATTCATTTTCCAGTGTCTGTAA---  367

Query 371  CAGGTGAGGAACTTTCACCAACAGATGAAAATGGAAAAGTAATATTTGACATAGTGGATCTCTGTACCACCTGG  444
                                                                                     
Sbjct 368  --------------------------------------------------------------------------  367

Query 445  GAGGCCATGGAGAAGTGTAAGGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATTGGGGTGTCAAACTTCAACCGCAGGCAGCT  518
            |||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 368  -AGGCCGTGGAGAAGTGTAAAGATGCAGGATTGGCCAAGTCCATCGGGGTGTCCAACTTCAACCGCAGGCAGCT  440

Query 519  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGACTTAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTAGAATGTCATCCGTATTTCA  592
           ||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 441  GGAGATGATCCTCAACAAGCCAGGGCTCAAGTACAAGCCTGTCTGCAACCAGGTGGAATGTCATCCTTACTTCA  514

Query 593  ACCGGAGTAAATTGCTAGATTTCTGCAAGTCGAAAGATATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCTCAA  666
           |||.|||.|||.||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 515  ACCAGAGAAAACTGCTGGATTTCTGCAAGTCAAAAGACATTGTTCTGGTTGCCTATAGTGCTCTGGGATCCCAC  588

Query 667  CGAGACAAACGATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAA  740
           |||||..|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589  CGAGAAGAACCATGGGTGGACCCGAACTCCCCGGTGCTCTTGGAGGACCCAGTCCTTTGTGCCTTGGCAAAAAA  662

Query 741  GCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTGCAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663  GCACAAGCGAACCCCAGCCCTGATTGCCCTGCGCTACCAGCTACAGCGTGGGGTTGTGGTCCTGGCCAAGAGCT  736

Query 815  ACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTTTTTGAGTTCCAGTTGACTGCAGAGGACATGAAAGCCATA  888
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||
Sbjct 737  ACAATGAGCAGCGCATCAGACAGAACGTGCAGGTGTTTGAATTCCAGTTGACTTCAGAGGAGATGAAAGCCATA  810

Query 889  GATGGCCTAGACAGAAATCTCCACTATTTTAACAGTGATAGTTTTGCTAGCCACCCTAATTATCCATATTCAGA  962
           |||||||||.||||||||.|.|..|||||.|.|..|||||.|||||||.|||.||||||||||||||.|||.||
Sbjct 811  GATGGCCTAAACAGAAATGTGCGATATTTGACCCTTGATATTTTTGCTGGCCCCCCTAATTATCCATTTTCTGA  884

Query 963  TGAATAT  969
           |||||||
Sbjct 885  TGAATAT  891