Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472693
• Subject: NM_001290383.1
• Aligned Length: 2043
• Identities: 1851
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGACGGCCTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGGGCCAAGCTAGGCTC  74
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct    1  ATGACGGCGTCTCCGGATTACTTGGTGGTGCTTTTTGGGATCACTGCTGGGGCCACCGGAGCCAAGCTGGGTTC  74

Query   75  GGATGAGAAGGAGTTGATCCTGCTGTTCTGGAAAGTCGTGGATCTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGTTGCACG  148
            |||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct   75  GGATGAGAAGGAGCTGATCCTGCTGTTATGGAAAGTCGTGGATTTGGCCAACAAGAAGGTGGGACAGCTGCACG  148

Query  149  AAGTGCTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACGGAGGACTGCAAAGAAGAAACTAAAATAGACGTCGAAAGC  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||.|||||.|
Sbjct  149  AAGTACTAGTTAGACCGGATCAGTTGGAACTGACAGAGGATTGTAAAGAAGAAACTAAAATAGACGCCGAAAAC  222

Query  223  CTGTCCTCGGCGTCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAATATTGG  296
            |||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct  223  CTGTCTTCCGCGCCGCAGCTGGACCAAGCCCTCCGACAGTTTAACCAGTCAGTGAGCAATGAACTGAACATCGG  296

Query  297  AGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGATGGGCAGCTTCATGTCAGGCAAATCCTGCATCCTGAGGCTTCCA  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.|||||.|||.|||||||.||||||||||
Sbjct  297  GGTAGGGACTTCCTTCTGTCTCTGTACTGACGGGCAGCTTCACATTAGGCAGATCTTGCATCCCGAGGCTTCCA  370

Query  371  AGAAGAATGTACTATTACCTGAATGCTTCTATTCCTTTTTTGATCTTCGAAAAGAATTCAAGAAATGTTGCCCT  444
            ||||||||||..||.|.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.
Sbjct  371  AGAAGAATGTGTTACTGCCTGAGTGCTTCTATTCCTTTTTCGATCTTCGGAAAGAGTTCAAGAAGTGCTGCCCG  444

Query  445  GGTTCACCTGATATTGACAAACTGGACGTTGCCACAATGACAGAGTATTTAAATTTTGAGAAGAGTAGTTCAGT  518
            ||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||..|.||||||||.....|.||.||||||||||||...||.||
Sbjct  445  GGCTCTCCCGATATCGACAAGCTGGATGTCGCAGCGATGACAGAAAGCCTGAACTTTGAGAAGAGTGACTCTGT  518

Query  519  CTCTCGATATGGAGCCTCTCAAGTTGAAGATATGGGGAATATAATTTTAGCAATGATTTCAGAGCCTTATAATC  592
            .||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  519  GTCCCGATACGGAGCCTCCCAAGTTGAAGACATGGGGAACATAATTTTAGCAATGATCTCCGAGCCCTACAATC  592

Query  593  ACAGGTTTTCAGATCCAGAGAGAGTGAATTACAAGTTTGAAAGTGGAACTTGCAGCAAGATGGAACTTATTGAT  666
            ||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||   ||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACAGATTTTCAGATCCAGAGAGAGTAAACTACAAGTTTGAAAGTGGCACTT---GCAAGATGGAACTTATTGAT  663

Query  667  GATAACACCGTAGTCAGGGCACGAGGTTTACCATGGCAGTCTTCAGATCAAGATATTGCAAGATTCTTCAAAGG  740
            ||.|.|||.||.||.||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  664  GACAGCACAGTGGTGAGAGCTCGAGGTTTGCCCTGGCAATCTTCAGATCAAGATATTGCAAGGTTCTTCAAAGG  737

Query  741  ACTCAATATTGCCAAGGGAGGTGCAGCACTTTGTCTGAATGCTCAGGGTCGAAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA  814
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  ACTCAATATTGCCAAGGGTGGCGCAGCACTTTGCCTGAATGCTCAGGGCCGGAGGAACGGAGAAGCTCTGGTTA  811

Query  815  GGTTTGTAAGTGAGGAGCACCGAGACCTAGCACTACAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTATATTGAG  888
            |.||||||||||||||||||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  812  GATTTGTAAGTGAGGAGCACAGAGATCTAGCCCTGCAGAGGCACAAACATCACATGGGGACCCGGTACATTGAG  885

Query  889  GTTTACAAAGCAACAGGTGAAGATTTCCTTAAAATTGCTGGTGGTACTTCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GTTTACAAAGCAACAGGCGAAGATTTCCTTAAAATTGCCGGAGGGACATCCAATGAGGTAGCCCAGTTTCTCTC  959

Query  963  CAAGGAAAATCAAGTCATTGTTCGCATGCGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACAGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT  1036
            |||||||||.||||||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  CAAGGAAAACCAAGTCATCGTGCGCATGAGGGGGCTCCCTTTCACGGCCACGGCTGAAGAAGTGGTGGCCTTCT  1033

Query 1037  TTGGACAGCATTGCCCTATTACTGGGGGAAAGGAAGGCATCCTCTTTGTCACCTACCCAGATGGTAGGCCAACA  1110
            ||||||||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1034  TTGGACAGCACTGCCCCATCACTGGAGGGAAGGAAGGCATCCTCTTCGTTACCTACCCAGATGGTAGGCCAACC  1107

Query 1111  GGGGACGCTTTTGTCCTCTTTGCCTGTGAGGAATATGCACAGAATGCGTTGAGGAAGCATAAAGACTTGTTGGG  1184
            ||.||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.||..||||||||||.||.||.|||.||||
Sbjct 1108  GGAGATGCTTTTGTGCTCTTTGCTTGTGAGGAGTATGCTCAGAACGCCCTGAGGAAGCACAAGGAGTTGCTGGG  1181

Query 1185  TAAAAGATACATTGAACTCTTCAGGAGCACAGCAGCTGAAGTTCAGCAGGTGCTGAATCGATTCTCCTCGGCCC  1258
            ||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1182  TAAAAGATACATCGAGCTCTTCAGGAGCACAGCTGCCGAAGTTCAGCAGGTGCTGAACCGATTCTCCTCAGCCC  1255

Query 1259  CTCTCATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATTCCAGTACTACCTCAGCAATTTGTGCCCCCTACAAATGTTAGA  1332
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||
Sbjct 1256  CTCTGATTCCACTTCCAACCCCTCCCATTATCCCTGTACTACCTCAGCAGTTTGTGCCTCCCACGAATGTCAGA  1329

Query 1333  GACTGTATACGCCTTCGAGGTCTTCCCTATGCAGCCACAATTGAGGACATCCTGGATTTCCTGGGGGAGTTCGC  1406
            |||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||||||||||..|
Sbjct 1330  GACTGCATACGTCTGCGAGGTCTTCCCTATGCTGCCACAATAGAAGACATTCTGGACTTCCTGGGGGAGTTTTC  1403

Query 1407  CACAGATATTCGTACTCATGGGGTTCACATGGTTTTGAATCACCAGGGCCGCCCATCAGGAGATGCCTTTATCC  1480
            |||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1404  CACAGATATTCGTACACATGGAGTGCACATGGTATTGAATCACCAGGGACGCCCGTCAGGAGATGCCTTTATCC  1477

Query 1481  AGATGAAGTCTGCGGACAGAGCATTTATGGCTGCACAGAAGTGTCATAAAAAAAACATGAAGGACAGATATGTT  1554
            ||||||||||..|.|||||||||||.||||||||.|||||||..||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1478  AGATGAAGTCAACAGACAGAGCATTCATGGCTGCGCAGAAGTACCATAAAAAAACCATGAAGGACAGATATGTT  1551

Query 1555  GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTATC  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1552  GAAGTCTTTCAGTGTTCAGCTGAGGAGATGAACTTTGTGTTAATGGGGGGCACTTTAAATCGAAATGGCTTGTC  1625

Query 1629  CCCACCGCCATGTAAGTTACCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTTCCAGCTCCTGCTGCAGTTATTCCTA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||..|.||.||.|||||||
Sbjct 1626  CCCACCGCCATGTAAGTTACCATGCCTGTCTCCTCCCTCCTACACATTCCCAGCTCCCACGGCTGTGATTCCTA  1699

Query 1703  CAGAAGCTGCCATTTACCAGCCCTCTGTGATTTTGAATCCACGAGCACTGCAGCCCTCCACAGCGTACTACCCA  1776
            |.||||||||||||||.||.||.|||.||.|.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.
Sbjct 1700  CCGAAGCTGCCATTTATCAACCTTCTCTGCTCTTGAACCCACGGGCACTGCAGCCCTCCACTGCATACTACCCG  1773

Query 1777  GCAGGCACTCAGCTCTTCATGAACTACACAGCGTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  GCAGGCACTCAGCTCTTCATGAACTACACAGCCTACTATCCCAGCCCCCCAGGTTCGCCTAATAGTCTTGGCTA  1847

Query 1851  CTTCCCTACAGCTGCTAATCTTAGCGGTGTCCCTCCACAGCCTGGCACGGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCT  1924
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  CTTCCCTACAGCTGCTAATCTTAGCAGTGTCCCGCCCCAGCCTGGCACCGTGGTCAGAATGCAGGGCCTGGCCT  1921

Query 1925  ACAATACTGGAGTTAAGGAAATTCTTAACTTCTTCCAAGGTTACCAGTATGCAACCGAGGATGGACTTATACAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1922  ACAATACTGGAGTTAAGGAAATTCTTAACTTCTTCCAAGGTTACCAGTATGCAACCGAGGATGGACTTGTACAC  1995

Query 1999  ACAAATGACCAGGCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATT  2043
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  ACAAATGACCAGGCCAGGACTCTACCCAAAGAATGGGTTTGTATT  2040