Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472805
• Subject: XM_006535804.3
• Aligned Length: 1061
• Identities: 897
• Gaps: 46

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCAAAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAAAAGAAGATTGGAGCATATGATCAACAAATATGGGA  74
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCAGAGTCACAGATGCTATAGTCTGGTATCAGAAGAAGATTGGAGCCTATGATCAACAAATATGGGA  74

Query   75  AAAATCTGTTGAACAGAGAGAAATCAAGGGGCTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATGTGAAACCAGACC  148
            |||.|||||||||||.||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAGTCTGTTGAACAAAGAGAAATCAAGGGCTTAAGGAATAAACCAAAGAAAACAGCACATGTGAAACCAGACC  148

Query  149  TCATAGATGTTGATCTTGTAAGAGGGTCTGCATTTGCAAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGGACTTCTCTGACC  222
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  149  TCATCGATGTTGATCTTGTGAGAGGGTCTGCATTTGCTAAGGCAAAGCCTGAAAGTCCTTGGACTTCTCTGACA  222

Query  223  A-GAAAGGGAATTGTTCGAGTTGTATTTTTCCCCTTTTTCTTCCGGTGGTGGTTACAAGTAACATCAAAGGTCA  295
            | ||||||| ||||||||||||||.||||||||.||.||||.|||.|||||||||||||||||.||.|..||||
Sbjct  223  AGGAAAGGG-ATTGTTCGAGTTGTCTTTTTCCCTTTCTTCTCCCGCTGGTGGTTACAAGTAACGTCCAGAGTCA  295

Query  296  TCTTTTTCTGGCTTCTTGTCCTTTATCTTCTTCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGCTCCACTTCTAGCCCA  369
            ||||.|.||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||.||||||||
Sbjct  296  TCTTCTCCTGGCTTCTTGTTCTCTATCTTCTCCAAGTTGCTGCAATAGTATTATTCTGTTCCGCTCCTAGCCCA  369

Query  370  CACAGCATACCTCTGACAGAGGTGATTGGGCCGATATGGCTGATGCTGCTCCTGGGAACTGTGCATTGCCAGAT  443
            ||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||
Sbjct  370  CATAGCATACCTCTAACTGAAGTGATTGGGCCAATATGGCTGATGCTGCTTTTGGGAACCGTGCATTGCCAGAT  443

Query  444  TGTTTCCACAAGAACACCCAAACCTCCTCTAAGTACAGGGGGTAAAAGAAGAAGGAAATTAAGAAAAGCAGCCC  517
            ||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  TGTTTCAACAAGAACACCCAAGCCTCCACTAGGCACAGGCGGTAAACGAAGAAGGAAATTAAGAAAAGCAGCCC  517

Query  518  ATTTGGAAGTACATAGGGAAGGAGATGGTTCTAGTACCACAGATAACACACAAGAGGGAGCAGTTCAGAACCAC  591
            ||||||||||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||||.||||
Sbjct  518  ATTTGGAAGTCCACAGGGAAGGGGACGGTTCTAGCACCACAGATAACACACAGGAGGGAGCGGTGCAGAGCCAC  591

Query  592  GGTACAAGCACCTCTCACAGCGTTGGCACTGTCTTCAGAGATCTCTGGCATGCTGCTTTCTTTTTATCAGGATC  665
            ||..||.||.||.||.||||.||||||||||||||||||||.||.||||.||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  592  GGCGCAGGCGCCCCTTACAGTGTTGGCACTGTCTTCAGAGACCTTTGGCTTGCTGCTTTCTTCTTATCAGGGTC  665

Query  666  AAAGAAAGCAAAGAATTCAATTGATAAATCAACTGAAACTGACAATGGCTATGTATCCCTTGATGGGAAGAAGA  739
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||.||
Sbjct  666  AAAGAAGGCAAAGAATTCAATTGATAAGTCAACCGAGACTGACAATGGCTATGTGTCCCTCGATGGGAAGAGGA  739

Query  740  CTGTTAAAAGCGGTGAAGATGGAATACAAAACCATGAACCTCAGTGTGAAACTATTCGACCAGAAGAGACAGCC  813
            ||||.||||||.||||.||||||..|||..|||||||.|||||||||||||||.||.||||||||||..|||||
Sbjct  740  CTGTAAAAAGCAGTGAGGATGGAGCACAGTACCATGAGCCTCAGTGTGAAACTGTTGGACCAGAAGACGCAGCC  813

Query  814  TGGAACACAGGAACACTGAGGAATGGTCCTAGCAAAGATACCCAAAGGACAATAACAAATGTCTCTGATGAAGT  887
            |||..||||.||||.|..||||.||.||||..|||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TGGGCCACACGAACGCCAAGGAGTGTTCCTGCCAAAGATACCCAAAGAAAGATAACAAATGTCTCTGATGAAGT  887

Query  888  CTCCAGTGAGGAAGGTCCTGAAACAGGATACTCATTACGTCGTCATGTGGACAGGACTTCTGAAGGTGTTCTTC  961
            .|||||||||||.|||||.||||||||||||.||||.|||.|||||||||||||.|||||||||.|.|.|||||
Sbjct  888  ATCCAGTGAGGAGGGTCCCGAAACAGGATACCCATTGCGTGGTCATGTGGACAGAACTTCTGAAAGCGGTCTTC  961

Query  962  GGAATAGAAAGTCACACCATTATAAGAAACATTACCCTAATGAGGTATATAC----TTTGTCCTTAAGTGTATA  1031
            |.|||||||||.|||||||||||||.||.|||||..|.||||||.|..|.||    ||.               
Sbjct  962  GAAATAGAAAGCCACACCATTATAAAAAGCATTATGCAAATGAGTTCCAGACAGGATTC---------------  1020

Query 1032  CATACATATCTATTTTATATGTTAC  1056
                                     
Sbjct 1021  -------------------------  1020