Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000472816
• Subject: NM_001352616.2
• Aligned Length: 1538
• Identities: 1436
• Gaps: 64

Alignment

Query    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGGCGGAAGAAAATACAAATCACACGCATAATGGATGAAAGGAACCGACAGGTCACTTTTACAAAGAGAAA  74

Query   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTTGGATTAATGAAGAAAGCCTATGAACTTAGTGTGCTCTGTGACTGTGAAATAGCACTCATCATTTTCAACA  148

Query  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTCTAACAAACTGTTTCAATATGCTAGCACTGATATGGACAAAGTTCTTCTCAAGTATACAGAATATAATGAA  222

Query  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGGCTCTGAACAAGAAGGAA----CACAGAGGGTGCGACA  292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|    |||||.|||    |..|..||.||.||.|
Sbjct  223  CCTCATGAAAGCAGAACCAACTCGGATATTGTTGAGACTTT----AAGAAAGAAAGGCCTTAATGGTTGTGAGA  292

Query  293  GCCCAGACCCTGA----TACTTCATATGTGCTAACTCCACATACAGAAGAAAAATATAAAAAAATTAATGAGGA  362
            ||||.||..||||    |||||    ||.||..|.|||||...|.||.||.|.||..|..|||.|.|||||.||
Sbjct  293  GCCCTGATGCTGACGATTACTT----TGAGCACAGTCCACTCTCGGAGGACAGATTCAGCAAACTAAATGAAGA  362

Query  363  -----ATTTGAT----AATATGATGCGGAATCATAAAATCGCACCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGT  427
                 ||||.||    || |.||.|              |.|.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  TAGTGATTTTATTTTCAA-ACGAGG--------------CCCTCCTGGTCTGCCACCTCAGAACTTTTCAATGT  421

Query  428  CTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCT  501
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  422  CTGTCACAGTTCCAGTGACCAGCCCCAATGCTTTGTCCTACACTAACCCAGGGAGTTCACTGGTGTCCCCATCT  495

Query  502  TTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTC  575
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  496  TTGGCAGCCAGCTCAACGTTAACAGATTCAAGCATGCTCTCTCCACCTCAAACCACATTACATAGAAATGTGTC  569

Query  576  TCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGC  649
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  570  TCCTGGAGCTCCTCAGAGACCACCAAGTACTGGCAATGCAGGTGGGATGTTGAGCACTACAGACCTCACAGTGC  643

Query  650  CAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCT  723
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  644  CAAATGGAGCTGGAAGCAGTCCAGTGGGGAATGGATTTGTAAACTCAAGAGCTTCTCCAAATTTGATTGGAGCT  717

Query  724  ACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAAT  797
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  718  ACTGGTGCAAATAGCTTAGGCAAAGTCATGCCTACAAAGTCTCCCCCTCCACCAGGTGGTGGTAATCTTGGAAT  791

Query  798  GAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTA-------  864
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  792  GAACAGTAGGAAACCAGATCTTCGAGTTGTCATCCCCCCTTCAAGCAAGGGCATGATGCCTCCACTATCGGAGG  865

Query  865  -----------------AATACCCAAAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTG  921
                             ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  866  AAGAGGAATTGGAGTTGAATACCCAGAGGATCAGTAGTTCTCAAGCCACTCAACCTCTTGCTACCCCAGTCGTG  939

Query  922  TCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTA  995
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  940  TCTGTGACAACCCCAAGCTTGCCTCCGCAAGGACTTGTGTACTCAGCAATGCCGACTGCCTACAACACTGATTA  1013

Query  996  TTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGT  1069
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1014  TTCACTGACCAGCGCTGACCTGTCAGCCCTTCAAGGCTTCAACTCGCCAGGAATGCTGTCGCTGGGACAGGTGT  1087

Query 1070  CGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGT  1143
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1088  CGGCCTGGCAGCAGCACCACCTAGGACAAGCAGCCCTCAGCTCTCTTGTTGCTGGAGGGCAGTTATCTCAGGGT  1161

Query 1144  TCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTAT  1217
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1162  TCCAATTTATCCATTAATACCAACCAAAACATCAGCATCAAGTCCGAACCGATTTCACCTCCTCGGGATCGTAT  1235

Query 1218  GACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGC  1291
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1236  GACCCCATCGGGCTTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCGCCGCCACCACCGCAGCCCCAGC  1309

Query 1292  CACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGC  1365
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1310  CACAACCCCCGCAGCCCCAGCCCCGACAGGAAATGGGGCGCTCCCCTGTGGACAGTCTGAGCAGCTCTAGTAGC  1383

Query 1366  TCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAA  1439
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1384  TCCTATGATGGCAGTGATCGGGAGGATCCACGGGGCGACTTCCATTCTCCAATTGTGCTTGGCCGACCCCCAAA  1457

Query 1440  CACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTTACC  1497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1458  CACTGAGGACAGAGAAAGCCCTTCTGTAAAGCGAATGAGGATGGACGCGTGGGTGACC  1515